MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-12

Total Repeats: 718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017423	T	6	6	2	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017423	AT	5	10	33	42	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017423	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017423	GTT	2	6	66	71	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827927
5	NC_017423	T	6	6	136	141	0 %	100 %	0 %	0 %	387827927
6	NC_017423	AGA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
7	NC_017423	TAT	2	6	273	278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
8	NC_017423	GAA	2	6	343	348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
9	NC_017423	TA	3	6	427	432	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
10	NC_017423	ATG	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
11	NC_017423	AT	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
12	NC_017423	A	6	6	581	586	100 %	0 %	0 %	0 %	387827927
13	NC_017423	T	6	6	624	629	0 %	100 %	0 %	0 %	387827927
14	NC_017423	CAA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827927
15	NC_017423	CTT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827927
16	NC_017423	TAG	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
17	NC_017423	AAT	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
18	NC_017423	TCT	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827927
19	NC_017423	T	6	6	747	752	0 %	100 %	0 %	0 %	387827927
20	NC_017423	ATA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
21	NC_017423	TAA	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827927
22	NC_017423	GTT	2	6	901	906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827927
23	NC_017423	AGG	2	6	929	934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827927
24	NC_017423	ATTA	2	8	942	949	50 %	50 %	0 %	0 %	387827927
25	NC_017423	ATG	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
26	NC_017423	ATT	2	6	1046	1051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
27	NC_017423	T	6	6	1056	1061	0 %	100 %	0 %	0 %	387827927
28	NC_017423	GAA	2	6	1159	1164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827927
29	NC_017423	ATG	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827927
30	NC_017423	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827927
31	NC_017423	A	6	6	1299	1304	100 %	0 %	0 %	0 %	387827928
32	NC_017423	GAA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
33	NC_017423	AGA	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
34	NC_017423	AGC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827928
35	NC_017423	TA	3	6	1406	1411	50 %	50 %	0 %	0 %	387827928
36	NC_017423	ATA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827928
37	NC_017423	GAA	2	6	1502	1507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
38	NC_017423	AG	3	6	1508	1513	50 %	0 %	50 %	0 %	387827928
39	NC_017423	AGC	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827928
40	NC_017423	A	6	6	1789	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	387827928
41	NC_017423	GAA	2	6	1850	1855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
42	NC_017423	AAGT	2	8	1857	1864	50 %	25 %	25 %	0 %	387827928
43	NC_017423	AATT	2	8	1888	1895	50 %	50 %	0 %	0 %	387827928
44	NC_017423	AATTC	2	10	1942	1951	40 %	40 %	0 %	20 %	387827928
45	NC_017423	AAG	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827928
46	NC_017423	CAA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827929
47	NC_017423	CTTA	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	387827929
48	NC_017423	T	6	6	2136	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	387827929
49	NC_017423	TGG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827929
50	NC_017423	TAG	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827929
51	NC_017423	AAC	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827929
52	NC_017423	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827929
53	NC_017423	ACAA	2	8	2345	2352	75 %	0 %	0 %	25 %	387827929
54	NC_017423	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	387827929
55	NC_017423	ATTT	2	8	2508	2515	25 %	75 %	0 %	0 %	387827929
56	NC_017423	ATA	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
57	NC_017423	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827930
58	NC_017423	A	6	6	2760	2765	100 %	0 %	0 %	0 %	387827930
59	NC_017423	TACT	2	8	2849	2856	25 %	50 %	0 %	25 %	387827930
60	NC_017423	AGA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827930
61	NC_017423	GTG	2	6	2932	2937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
62	NC_017423	TA	3	6	2963	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	387827930
63	NC_017423	GATATT	2	12	2985	2996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827930
64	NC_017423	TG	3	6	3006	3011	0 %	50 %	50 %	0 %	387827930
65	NC_017423	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	387827930
66	NC_017423	AAT	2	6	3057	3062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
67	NC_017423	AAG	2	6	3083	3088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827930
68	NC_017423	TGA	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827930
69	NC_017423	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827930
70	NC_017423	TGG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
71	NC_017423	TAA	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827930
72	NC_017423	TGG	3	9	3335	3343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827930
73	NC_017423	AGG	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017423	AATG	2	8	3372	3379	50 %	25 %	25 %	0 %	387827931
75	NC_017423	AGA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827931
76	NC_017423	T	6	6	3509	3514	0 %	100 %	0 %	0 %	387827931
77	NC_017423	ATC	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827931
78	NC_017423	GGT	2	6	3659	3664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827931
79	NC_017423	CTA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827931
80	NC_017423	TAA	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
81	NC_017423	TAG	2	6	3753	3758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827931
82	NC_017423	CAAAA	2	10	3775	3784	80 %	0 %	0 %	20 %	387827931
83	NC_017423	TAA	2	6	3799	3804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
84	NC_017423	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827931
85	NC_017423	ATT	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
86	NC_017423	TGA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
87	NC_017423	ATT	2	6	3990	3995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
88	NC_017423	ATT	2	6	4209	4214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
89	NC_017423	TACAA	2	10	4221	4230	60 %	20 %	0 %	20 %	387827932
90	NC_017423	TCT	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827932
91	NC_017423	TAA	3	9	4294	4302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827932
92	NC_017423	AGT	2	6	4337	4342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
93	NC_017423	TTA	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827932
94	NC_017423	TTCAA	2	10	4387	4396	40 %	40 %	0 %	20 %	387827932
95	NC_017423	CTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827932
96	NC_017423	AGA	2	6	4468	4473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827932
97	NC_017423	GTG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827932
98	NC_017423	A	6	6	4515	4520	100 %	0 %	0 %	0 %	387827932
99	NC_017423	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
100	NC_017423	GCA	3	9	4622	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827932
101	NC_017423	GCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827932
102	NC_017423	AGT	2	6	4643	4648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827932
103	NC_017423	TAA	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827932
104	NC_017423	AGA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827932
105	NC_017423	AGTA	2	8	4790	4797	50 %	25 %	25 %	0 %	387827932
106	NC_017423	CTAC	2	8	4802	4809	25 %	25 %	0 %	50 %	387827932
107	NC_017423	TCAT	2	8	4849	4856	25 %	50 %	0 %	25 %	387827932
108	NC_017423	CTA	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827932
109	NC_017423	TAAA	2	8	4941	4948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017423	CAAA	2	8	4954	4961	75 %	0 %	0 %	25 %	387827933
111	NC_017423	GAA	2	6	4988	4993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827933
112	NC_017423	TTCA	2	8	5013	5020	25 %	50 %	0 %	25 %	387827933
113	NC_017423	T	6	6	5071	5076	0 %	100 %	0 %	0 %	387827933
114	NC_017423	TGAATT	2	12	5209	5220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387827933
115	NC_017423	A	7	7	5230	5236	100 %	0 %	0 %	0 %	387827933
116	NC_017423	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827933
117	NC_017423	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827933
118	NC_017423	GTG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827934
119	NC_017423	TGT	2	6	5496	5501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827934
120	NC_017423	TTA	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827934
121	NC_017423	TAG	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827935
122	NC_017423	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	387827935
123	NC_017423	CAA	2	6	5927	5932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827935
124	NC_017423	A	7	7	6077	6083	100 %	0 %	0 %	0 %	387827935
125	NC_017423	AGC	2	6	6087	6092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387827935
126	NC_017423	TTG	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827935
127	NC_017423	ACTT	2	8	6137	6144	25 %	50 %	0 %	25 %	387827935
128	NC_017423	AAT	2	6	6236	6241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827936
129	NC_017423	ACT	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827936
130	NC_017423	ATA	2	6	6311	6316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827936
131	NC_017423	ACA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827936
132	NC_017423	AGTTT	2	10	6393	6402	20 %	60 %	20 %	0 %	387827936
133	NC_017423	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	387827936
134	NC_017423	TTA	2	6	6606	6611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827936
135	NC_017423	CAA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827936
136	NC_017423	AGG	3	9	6693	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827936
137	NC_017423	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827937
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