MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7

Total Repeats: 489

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017422	TCAA	2	8	42	49	50 %	25 %	0 %	25 %	387827904
2	NC_017422	TA	3	6	103	108	50 %	50 %	0 %	0 %	387827904
3	NC_017422	CAAAC	2	10	188	197	60 %	0 %	0 %	40 %	387827904
4	NC_017422	A	8	8	207	214	100 %	0 %	0 %	0 %	387827904
5	NC_017422	ATA	2	6	221	226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827904
6	NC_017422	AATT	2	8	306	313	50 %	50 %	0 %	0 %	387827904
7	NC_017422	GTTT	2	8	326	333	0 %	75 %	25 %	0 %	387827904
8	NC_017422	AAT	2	6	387	392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
9	NC_017422	TAA	2	6	407	412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
10	NC_017422	TTG	2	6	424	429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827905
11	NC_017422	TGA	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827905
12	NC_017422	CTC	2	6	499	504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827905
13	NC_017422	GGACT	2	10	510	519	20 %	20 %	40 %	20 %	387827905
14	NC_017422	A	6	6	566	571	100 %	0 %	0 %	0 %	387827905
15	NC_017422	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827905
16	NC_017422	ACT	2	6	624	629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827905
17	NC_017422	ACA	2	6	637	642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827905
18	NC_017422	AT	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	387827905
19	NC_017422	T	8	8	657	664	0 %	100 %	0 %	0 %	387827905
20	NC_017422	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827906
21	NC_017422	ATT	2	6	830	835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827906
22	NC_017422	TCT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827906
23	NC_017422	GAA	3	9	857	865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827906
24	NC_017422	TAAT	2	8	867	874	50 %	50 %	0 %	0 %	387827906
25	NC_017422	T	7	7	887	893	0 %	100 %	0 %	0 %	387827906
26	NC_017422	TGG	2	6	907	912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827906
27	NC_017422	GCT	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827906
28	NC_017422	GAA	2	6	932	937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827906
29	NC_017422	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827906
30	NC_017422	AT	3	6	1043	1048	50 %	50 %	0 %	0 %	387827906
31	NC_017422	CTA	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827906
32	NC_017422	AAC	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827906
33	NC_017422	TACTT	2	10	1153	1162	20 %	60 %	0 %	20 %	387827906
34	NC_017422	AAAGT	2	10	1253	1262	60 %	20 %	20 %	0 %	387827906
35	NC_017422	ATT	2	6	1331	1336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827906
36	NC_017422	T	6	6	1382	1387	0 %	100 %	0 %	0 %	387827906
37	NC_017422	A	8	8	1490	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	387827906
38	NC_017422	ATG	2	6	1515	1520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827906
39	NC_017422	AGAT	2	8	1546	1553	50 %	25 %	25 %	0 %	387827906
40	NC_017422	ACAGAA	2	12	1634	1645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017422	AT	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017422	TATC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017422	TGA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017422	TAC	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017422	TAC	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017422	ATTT	2	8	1968	1975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017422	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017422	A	6	6	2004	2009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017422	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017422	A	6	6	2050	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017422	TTA	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017422	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017422	TAA	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017422	AAC	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017422	AGG	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017422	TGA	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017422	TGA	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017422	AGA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017422	TAAA	2	8	2261	2268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017422	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017422	CTT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017422	GAAT	2	8	2496	2503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017422	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017422	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017422	TCT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017422	A	6	6	2618	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017422	TTG	2	6	2641	2646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017422	AAT	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017422	ATG	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017422	T	6	6	2768	2773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017422	TGA	4	12	2781	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017422	TGA	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017422	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017422	TATT	2	8	2886	2893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017422	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017422	TA	3	6	2939	2944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017422	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017422	TCA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017422	TA	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017422	TAAAAA	2	12	3055	3066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017422	A	6	6	3084	3089	100 %	0 %	0 %	0 %	387827907
82	NC_017422	ATTAA	2	10	3098	3107	60 %	40 %	0 %	0 %	387827907
83	NC_017422	CTT	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827907
84	NC_017422	TTC	2	6	3189	3194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827907
85	NC_017422	TTA	2	6	3203	3208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827907
86	NC_017422	A	7	7	3278	3284	100 %	0 %	0 %	0 %	387827907
87	NC_017422	AT	3	6	3354	3359	50 %	50 %	0 %	0 %	387827908
88	NC_017422	TGA	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827908
89	NC_017422	A	6	6	3519	3524	100 %	0 %	0 %	0 %	387827908
90	NC_017422	TCAA	2	8	3525	3532	50 %	25 %	0 %	25 %	387827908
91	NC_017422	TGA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827908
92	NC_017422	A	7	7	3558	3564	100 %	0 %	0 %	0 %	387827908
93	NC_017422	AGGA	2	8	3597	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	387827908
94	NC_017422	CTAT	2	8	3609	3616	25 %	50 %	0 %	25 %	387827908
95	NC_017422	AAT	2	6	3629	3634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827908
96	NC_017422	TAAC	2	8	3679	3686	50 %	25 %	0 %	25 %	387827909
97	NC_017422	AGTAA	2	10	3735	3744	60 %	20 %	20 %	0 %	387827909
98	NC_017422	T	6	6	3749	3754	0 %	100 %	0 %	0 %	387827909
99	NC_017422	AT	3	6	3764	3769	50 %	50 %	0 %	0 %	387827909
100	NC_017422	GAA	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827909
101	NC_017422	ACA	2	6	3841	3846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827909
102	NC_017422	ATA	2	6	3852	3857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827909
103	NC_017422	TCACT	2	10	3892	3901	20 %	40 %	0 %	40 %	387827909
104	NC_017422	A	6	6	3927	3932	100 %	0 %	0 %	0 %	387827909
105	NC_017422	CTA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827910
106	NC_017422	TTGCT	2	10	3989	3998	0 %	60 %	20 %	20 %	387827910
107	NC_017422	CAC	2	6	4008	4013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827910
108	NC_017422	AGA	2	6	4029	4034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827910
109	NC_017422	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827910
110	NC_017422	TATGT	2	10	4099	4108	20 %	60 %	20 %	0 %	387827910
111	NC_017422	AGTTAA	2	12	4137	4148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387827910
112	NC_017422	AT	3	6	4237	4242	50 %	50 %	0 %	0 %	387827910
113	NC_017422	A	7	7	4255	4261	100 %	0 %	0 %	0 %	387827910
114	NC_017422	TAA	2	6	4287	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827910
115	NC_017422	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017422	CAA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827911
117	NC_017422	AT	3	6	4464	4469	50 %	50 %	0 %	0 %	387827911
118	NC_017422	TTA	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827911
119	NC_017422	AAC	2	6	4495	4500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827911
120	NC_017422	AGAT	2	8	4675	4682	50 %	25 %	25 %	0 %	387827911
121	NC_017422	AT	3	6	4708	4713	50 %	50 %	0 %	0 %	387827911
122	NC_017422	AGA	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827911
123	NC_017422	AT	3	6	4762	4767	50 %	50 %	0 %	0 %	387827911
124	NC_017422	AGA	2	6	4798	4803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827911
125	NC_017422	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017422	ATA	2	6	5005	5010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017422	TAA	2	6	5034	5039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017422	TAA	3	9	5056	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017422	A	7	7	5063	5069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017422	ATT	2	6	5096	5101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827912
131	NC_017422	TTGT	2	8	5102	5109	0 %	75 %	25 %	0 %	387827912
132	NC_017422	ATACTA	2	12	5143	5154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387827912
133	NC_017422	CAAA	2	8	5157	5164	75 %	0 %	0 %	25 %	387827912
134	NC_017422	AGA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827912
135	NC_017422	ACA	2	6	5204	5209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827912
136	NC_017422	AGA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827912
137	NC_017422	A	6	6	5263	5268	100 %	0 %	0 %	0 %	387827912
138	NC_017422	ATG	2	6	5335	5340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827912
139	NC_017422	ATAAA	2	10	5341	5350	80 %	20 %	0 %	0 %	387827912
140	NC_017422	ATG	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827912
141	NC_017422	AAC	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387827912
142	NC_017422	A	6	6	5413	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	387827912
143	NC_017422	GGT	2	6	5432	5437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827912
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