MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp25

Total Repeats: 754

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017420	TGAC	2	8	22	29	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017420	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017420	A	6	6	113	118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017420	T	7	7	151	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017420	T	9	9	205	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017420	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017420	T	9	9	239	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017420	AATT	2	8	254	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017420	TTCTT	2	10	345	354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017420	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017420	T	6	6	393	398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017420	CTA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017420	TTAT	2	8	407	414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017420	A	6	6	418	423	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
15	NC_017420	TAT	2	6	427	432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
16	NC_017420	TAA	2	6	434	439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
17	NC_017420	TTA	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
18	NC_017420	TCT	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
19	NC_017420	T	6	6	485	490	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
20	NC_017420	T	6	6	492	497	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
21	NC_017420	TCT	2	6	531	536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
22	NC_017420	TTTTCT	2	12	579	590	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387827857
23	NC_017420	A	6	6	593	598	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
24	NC_017420	TCT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
25	NC_017420	TTA	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
26	NC_017420	TAAA	2	8	662	669	75 %	25 %	0 %	0 %	387827857
27	NC_017420	AAG	2	6	712	717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
28	NC_017420	TTTCTT	2	12	757	768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387827857
29	NC_017420	TCT	2	6	827	832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
30	NC_017420	AATA	2	8	872	879	75 %	25 %	0 %	0 %	387827857
31	NC_017420	T	6	6	881	886	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
32	NC_017420	AT	3	6	920	925	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
33	NC_017420	T	6	6	1061	1066	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
34	NC_017420	CTTT	2	8	1089	1096	0 %	75 %	0 %	25 %	387827857
35	NC_017420	A	6	6	1112	1117	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
36	NC_017420	TGA	2	6	1131	1136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
37	NC_017420	ATT	2	6	1172	1177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
38	NC_017420	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
39	NC_017420	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
40	NC_017420	TATT	2	8	1383	1390	25 %	75 %	0 %	0 %	387827857
41	NC_017420	TAA	2	6	1417	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
42	NC_017420	TAT	2	6	1423	1428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
43	NC_017420	TTC	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
44	NC_017420	T	7	7	1534	1540	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
45	NC_017420	AT	3	6	1582	1587	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
46	NC_017420	CTTTT	2	10	1654	1663	0 %	80 %	0 %	20 %	387827857
47	NC_017420	CAC	3	9	1711	1719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387827857
48	NC_017420	T	7	7	1773	1779	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
49	NC_017420	GAT	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
50	NC_017420	TTTAT	2	10	1833	1842	20 %	80 %	0 %	0 %	387827857
51	NC_017420	GGA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387827857
52	NC_017420	TCCT	2	8	1952	1959	0 %	50 %	0 %	50 %	387827857
53	NC_017420	A	6	6	1988	1993	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
54	NC_017420	TAG	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
55	NC_017420	T	6	6	2012	2017	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
56	NC_017420	T	6	6	2020	2025	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
57	NC_017420	T	6	6	2029	2034	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
58	NC_017420	ATT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
59	NC_017420	TTC	2	6	2192	2197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
60	NC_017420	TCT	2	6	2232	2237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
61	NC_017420	TAG	2	6	2239	2244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
62	NC_017420	T	6	6	2263	2268	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
63	NC_017420	GATA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	25 %	0 %	387827857
64	NC_017420	TCT	2	6	2277	2282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
65	NC_017420	T	7	7	2308	2314	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
66	NC_017420	T	6	6	2343	2348	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
67	NC_017420	A	6	6	2357	2362	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
68	NC_017420	ATG	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
69	NC_017420	GTG	2	6	2425	2430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387827857
70	NC_017420	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
71	NC_017420	TATAC	2	10	2552	2561	40 %	40 %	0 %	20 %	387827857
72	NC_017420	CAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
73	NC_017420	TTC	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
74	NC_017420	CTTT	2	8	2580	2587	0 %	75 %	0 %	25 %	387827857
75	NC_017420	T	7	7	2618	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
76	NC_017420	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
77	NC_017420	A	6	6	2688	2693	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
78	NC_017420	TTC	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
79	NC_017420	ATC	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
80	NC_017420	TTTC	2	8	2819	2826	0 %	75 %	0 %	25 %	387827857
81	NC_017420	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
82	NC_017420	AAT	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
83	NC_017420	AGT	2	6	2954	2959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387827857
84	NC_017420	T	6	6	3044	3049	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
85	NC_017420	T	7	7	3060	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
86	NC_017420	AGA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
87	NC_017420	TTC	2	6	3095	3100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
88	NC_017420	ATT	2	6	3128	3133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
89	NC_017420	TCT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
90	NC_017420	TCC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387827857
91	NC_017420	TTA	2	6	3226	3231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
92	NC_017420	T	7	7	3232	3238	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
93	NC_017420	ATTT	2	8	3247	3254	25 %	75 %	0 %	0 %	387827857
94	NC_017420	T	6	6	3252	3257	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
95	NC_017420	TCA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387827857
96	NC_017420	A	8	8	3271	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
97	NC_017420	AGA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387827857
98	NC_017420	TCT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
99	NC_017420	AT	3	6	3351	3356	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
100	NC_017420	A	6	6	3362	3367	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
101	NC_017420	TAAAA	2	10	3374	3383	80 %	20 %	0 %	0 %	387827857
102	NC_017420	TTC	2	6	3392	3397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
103	NC_017420	GCTA	2	8	3404	3411	25 %	25 %	25 %	25 %	387827857
104	NC_017420	AT	4	8	3458	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
105	NC_017420	T	6	6	3465	3470	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
106	NC_017420	TC	3	6	3500	3505	0 %	50 %	0 %	50 %	387827857
107	NC_017420	TC	3	6	3514	3519	0 %	50 %	0 %	50 %	387827857
108	NC_017420	T	6	6	3526	3531	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
109	NC_017420	TAT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
110	NC_017420	CTT	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
111	NC_017420	TCTT	2	8	3599	3606	0 %	75 %	0 %	25 %	387827857
112	NC_017420	ATAA	2	8	3621	3628	75 %	25 %	0 %	0 %	387827857
113	NC_017420	TTC	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
114	NC_017420	TTC	2	6	3662	3667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
115	NC_017420	AT	3	6	3690	3695	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
116	NC_017420	T	6	6	3697	3702	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
117	NC_017420	ATA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
118	NC_017420	TA	3	6	3793	3798	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
119	NC_017420	TCT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
120	NC_017420	CTT	2	6	3811	3816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
121	NC_017420	ATT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
122	NC_017420	T	8	8	3903	3910	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
123	NC_017420	CTT	2	6	3913	3918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
124	NC_017420	TAT	2	6	3925	3930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387827857
125	NC_017420	ACTCC	2	10	3982	3991	20 %	20 %	0 %	60 %	387827857
126	NC_017420	TGT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387827857
127	NC_017420	AAT	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387827857
128	NC_017420	TTC	2	6	4034	4039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387827857
129	NC_017420	GTC	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387827857
130	NC_017420	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
131	NC_017420	GTTT	2	8	4102	4109	0 %	75 %	25 %	0 %	387827857
132	NC_017420	T	6	6	4107	4112	0 %	100 %	0 %	0 %	387827857
133	NC_017420	A	6	6	4121	4126	100 %	0 %	0 %	0 %	387827857
134	NC_017420	AT	3	6	4189	4194	50 %	50 %	0 %	0 %	387827857
135	NC_017420	TTGT	2	8	4200	4207	0 %	75 %	25 %	0 %	387827857
136	NC_017420	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017420	AT	3	6	4281	4286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017420	TATTAA	2	12	4287	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017420	AT	3	6	4301	4306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017420	A	7	7	4310	4316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017420	TTAA	2	8	4325	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017420	TAAA	2	8	4345	4352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017420	AAT	2	6	4383	4388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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