MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 chromosome

Total Repeats: 25118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017418	AATG	2	8	75	82	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017418	T	7	7	110	116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017418	CAA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017418	T	6	6	222	227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017418	ACT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017418	AAC	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017418	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017418	TAA	2	6	347	352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017418	CTT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017418	TA	3	6	425	430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017418	T	7	7	435	441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017418	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017418	GTT	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017418	T	6	6	481	486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017418	ATT	2	6	496	501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017418	CTT	2	6	620	625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826929
17	NC_017418	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
18	NC_017418	ATA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826929
19	NC_017418	AGC	2	6	772	777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826929
20	NC_017418	ATT	2	6	802	807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826929
21	NC_017418	A	6	6	815	820	100 %	0 %	0 %	0 %	387826929
22	NC_017418	GTT	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826929
23	NC_017418	TCC	2	6	973	978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387826929
24	NC_017418	C	6	6	1118	1123	0 %	0 %	0 %	100 %	387826929
25	NC_017418	T	7	7	1158	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	387826929
26	NC_017418	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
27	NC_017418	C	6	6	1190	1195	0 %	0 %	0 %	100 %	387826929
28	NC_017418	TCA	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
29	NC_017418	AATC	2	8	1249	1256	50 %	25 %	0 %	25 %	387826929
30	NC_017418	TAAA	2	8	1290	1297	75 %	25 %	0 %	0 %	387826929
31	NC_017418	T	6	6	1319	1324	0 %	100 %	0 %	0 %	387826929
32	NC_017418	ATC	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826929
33	NC_017418	AATA	2	8	1390	1397	75 %	25 %	0 %	0 %	387826929
34	NC_017418	A	7	7	1533	1539	100 %	0 %	0 %	0 %	387826929
35	NC_017418	A	6	6	1543	1548	100 %	0 %	0 %	0 %	387826929
36	NC_017418	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	387826929
37	NC_017418	TA	3	6	1580	1585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017418	ACA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017418	AT	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017418	TAA	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017418	AGGA	2	8	1731	1738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017418	TCT	2	6	1740	1745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017418	AAT	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017418	AT	3	6	1820	1825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017418	T	6	6	1866	1871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017418	TAT	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017418	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017418	T	6	6	1889	1894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017418	ACA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017418	GAA	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017418	C	6	6	1987	1992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_017418	TCCC	2	8	2040	2047	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017418	GCTTT	2	10	2057	2066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017418	AGA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017418	AATT	2	8	2127	2134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017418	AT	4	8	2162	2169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017418	AAAT	2	8	2198	2205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017418	GGCA	2	8	2239	2246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017418	TAT	2	6	2271	2276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017418	TCT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017418	T	6	6	2362	2367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017418	AATCA	2	10	2392	2401	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017418	AAAT	2	8	2407	2414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017418	AT	3	6	2654	2659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017418	TTG	2	6	2703	2708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017418	ACC	2	6	2713	2718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017418	AAAG	2	8	2732	2739	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017418	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017418	A	6	6	2784	2789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017418	TAA	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017418	CTT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017418	T	7	7	2842	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017418	ATC	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017418	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017418	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017418	AAAACC	2	12	3042	3053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017418	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017418	A	6	6	3081	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017418	TAA	2	6	3101	3106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017418	ACTAT	2	10	3115	3124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017418	ATT	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017418	AAT	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017418	AAT	2	6	3145	3150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017418	GAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017418	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
86	NC_017418	TGA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
87	NC_017418	GAT	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
88	NC_017418	A	6	6	3280	3285	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
89	NC_017418	TAA	2	6	3339	3344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
90	NC_017418	ATT	2	6	3360	3365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
91	NC_017418	ATTGG	2	10	3389	3398	20 %	40 %	40 %	0 %	387826930
92	NC_017418	ATT	2	6	3425	3430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
93	NC_017418	TAA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
94	NC_017418	CAAA	2	8	3459	3466	75 %	0 %	0 %	25 %	387826930
95	NC_017418	T	6	6	3479	3484	0 %	100 %	0 %	0 %	387826930
96	NC_017418	A	6	6	3520	3525	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
97	NC_017418	TTTA	2	8	3545	3552	25 %	75 %	0 %	0 %	387826930
98	NC_017418	TGG	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826930
99	NC_017418	ATA	2	6	3644	3649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
100	NC_017418	TAA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
101	NC_017418	TTAA	2	8	3695	3702	50 %	50 %	0 %	0 %	387826930
102	NC_017418	TGA	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
103	NC_017418	TAA	2	6	3748	3753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
104	NC_017418	AAT	2	6	3754	3759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
105	NC_017418	AGAA	2	8	3766	3773	75 %	0 %	25 %	0 %	387826930
106	NC_017418	A	6	6	3772	3777	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
107	NC_017418	AAAGA	2	10	3865	3874	80 %	0 %	20 %	0 %	387826930
108	NC_017418	A	6	6	3880	3885	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
109	NC_017418	AAT	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
110	NC_017418	GATA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	387826930
111	NC_017418	TA	3	6	3978	3983	50 %	50 %	0 %	0 %	387826930
112	NC_017418	TAT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
113	NC_017418	AATG	2	8	4037	4044	50 %	25 %	25 %	0 %	387826930
114	NC_017418	AT	3	6	4066	4071	50 %	50 %	0 %	0 %	387826930
115	NC_017418	ATC	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
116	NC_017418	A	6	6	4179	4184	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
117	NC_017418	TAT	2	6	4223	4228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
118	NC_017418	A	6	6	4237	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
119	NC_017418	ATG	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
120	NC_017418	A	6	6	4287	4292	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
121	NC_017418	T	6	6	4300	4305	0 %	100 %	0 %	0 %	387826930
122	NC_017418	TAGAG	2	10	4321	4330	40 %	20 %	40 %	0 %	387826930
123	NC_017418	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
124	NC_017418	GATT	2	8	4380	4387	25 %	50 %	25 %	0 %	387826930
125	NC_017418	TAC	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
126	NC_017418	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826930
127	NC_017418	ACA	2	6	4571	4576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826930
128	NC_017418	GTAAT	2	10	4587	4596	40 %	40 %	20 %	0 %	387826930
129	NC_017418	ATC	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
130	NC_017418	A	6	6	4607	4612	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
131	NC_017418	TAA	2	6	4696	4701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
132	NC_017418	AGT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826930
133	NC_017418	TTC	2	6	4783	4788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826930
134	NC_017418	GGA	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826930
135	NC_017418	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
136	NC_017418	TTG	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826930
137	NC_017418	CTA	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826930
138	NC_017418	A	6	6	4937	4942	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
139	NC_017418	TAA	2	6	4944	4949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
140	NC_017418	A	6	6	4948	4953	100 %	0 %	0 %	0 %	387826930
141	NC_017418	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826930
142	NC_017418	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017418	AAT	2	6	5030	5035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017418	TTC	2	6	5041	5046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826931
145	NC_017418	T	6	6	5048	5053	0 %	100 %	0 %	0 %	387826931
146	NC_017418	T	6	6	5056	5061	0 %	100 %	0 %	0 %	387826931
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