MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp28-4

Total Repeats: 1008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017416	TTA	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017416	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017416	AC	3	6	50	55	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017416	AAG	2	6	93	98	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017416	TA	3	6	167	172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017416	T	8	8	184	191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017416	T	7	7	196	202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017416	A	7	7	223	229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017416	AATC	2	8	239	246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017416	ATTC	2	8	254	261	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017416	A	6	6	350	355	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
12	NC_017416	AT	3	6	391	396	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
13	NC_017416	AAC	2	6	411	416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
14	NC_017416	CTAT	2	8	498	505	25 %	50 %	0 %	25 %	387828030
15	NC_017416	ATTA	2	8	519	526	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
16	NC_017416	A	6	6	533	538	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
17	NC_017416	TAC	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
18	NC_017416	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828030
19	NC_017416	ATT	2	6	576	581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
20	NC_017416	A	6	6	641	646	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
21	NC_017416	AT	3	6	698	703	50 %	50 %	0 %	0 %	387828030
22	NC_017416	TCAA	2	8	727	734	50 %	25 %	0 %	25 %	387828030
23	NC_017416	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828030
24	NC_017416	ATT	2	6	745	750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828030
25	NC_017416	CTA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828030
26	NC_017416	T	7	7	803	809	0 %	100 %	0 %	0 %	387828030
27	NC_017416	A	7	7	869	875	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
28	NC_017416	T	6	6	930	935	0 %	100 %	0 %	0 %	387828030
29	NC_017416	A	6	6	949	954	100 %	0 %	0 %	0 %	387828030
30	NC_017416	AAT	2	6	976	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017416	TAT	2	6	1003	1008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017416	ATT	2	6	1062	1067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
33	NC_017416	ATT	2	6	1075	1080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
34	NC_017416	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
35	NC_017416	AAT	2	6	1120	1125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828031
36	NC_017416	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	387828031
37	NC_017416	TTA	2	6	1322	1327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828031
38	NC_017416	A	7	7	1351	1357	100 %	0 %	0 %	0 %	387828031
39	NC_017416	AGA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828031
40	NC_017416	TA	3	6	1393	1398	50 %	50 %	0 %	0 %	387828031
41	NC_017416	G	6	6	1420	1425	0 %	0 %	100 %	0 %	387828031
42	NC_017416	AATC	2	8	1452	1459	50 %	25 %	0 %	25 %	387828031
43	NC_017416	ATC	2	6	1475	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828031
44	NC_017416	TC	3	6	1479	1484	0 %	50 %	0 %	50 %	387828031
45	NC_017416	AT	3	6	1508	1513	50 %	50 %	0 %	0 %	387828031
46	NC_017416	A	6	6	1538	1543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017416	TAG	3	9	1547	1555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017416	TAC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017416	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017416	T	8	8	1670	1677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017416	TA	3	6	1684	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017416	A	8	8	1695	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
53	NC_017416	A	7	7	1705	1711	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
54	NC_017416	A	6	6	1729	1734	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
55	NC_017416	ATA	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
56	NC_017416	AAC	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
57	NC_017416	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
58	NC_017416	AAT	2	6	1854	1859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
59	NC_017416	A	8	8	1867	1874	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
60	NC_017416	A	6	6	1902	1907	100 %	0 %	0 %	0 %	387828032
61	NC_017416	CAA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
62	NC_017416	AT	3	6	1954	1959	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
63	NC_017416	ATA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828032
64	NC_017416	AT	3	6	2009	2014	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
65	NC_017416	TAT	2	6	2019	2024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828032
66	NC_017416	ATTA	2	8	2028	2035	50 %	50 %	0 %	0 %	387828032
67	NC_017416	ACT	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
68	NC_017416	ACA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828032
69	NC_017416	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828032
70	NC_017416	A	6	6	2140	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017416	AT	3	6	2193	2198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017416	TA	3	6	2202	2207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017416	A	8	8	2207	2214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017416	A	6	6	2216	2221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017416	GAA	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017416	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
77	NC_017416	TAA	2	6	2297	2302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
78	NC_017416	AC	3	6	2312	2317	50 %	0 %	0 %	50 %	387828033
79	NC_017416	ACA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
80	NC_017416	A	6	6	2340	2345	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
81	NC_017416	TAG	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387828033
82	NC_017416	ACA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
83	NC_017416	TTA	2	6	2443	2448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828033
84	NC_017416	AAC	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828033
85	NC_017416	TAA	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828033
86	NC_017416	A	7	7	2510	2516	100 %	0 %	0 %	0 %	387828033
87	NC_017416	TAC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
88	NC_017416	CAAT	2	8	2537	2544	50 %	25 %	0 %	25 %	387828033
89	NC_017416	ACT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828033
90	NC_017416	TAT	2	6	2681	2686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017416	AAT	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017416	A	6	6	2774	2779	100 %	0 %	0 %	0 %	387828034
93	NC_017416	TA	3	6	2780	2785	50 %	50 %	0 %	0 %	387828034
94	NC_017416	TTA	3	9	2884	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828034
95	NC_017416	TAA	2	6	2963	2968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017416	AAGAA	2	10	2969	2978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017416	ATA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017416	TTA	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828035
99	NC_017416	ACA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
100	NC_017416	AAC	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
101	NC_017416	TAA	2	6	3141	3146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828035
102	NC_017416	CAA	2	6	3176	3181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828035
103	NC_017416	AAACA	2	10	3192	3201	80 %	0 %	0 %	20 %	387828035
104	NC_017416	A	6	6	3218	3223	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
105	NC_017416	A	9	9	3252	3260	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
106	NC_017416	A	6	6	3333	3338	100 %	0 %	0 %	0 %	387828035
107	NC_017416	CTA	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828035
108	NC_017416	AGCC	2	8	3404	3411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017416	T	6	6	3546	3551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017416	ATC	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017416	TTTAAT	2	12	3598	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017416	A	6	6	3610	3615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017416	TTAA	2	8	3669	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017416	ATA	2	6	3780	3785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017416	TA	4	8	3799	3806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017416	T	8	8	3814	3821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017416	ATT	2	6	3845	3850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017416	ACTCTT	2	12	3864	3875	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017416	ACAA	2	8	3910	3917	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017416	ATT	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017416	ATA	2	6	3972	3977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017416	TAA	2	6	3988	3993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017416	A	6	6	3992	3997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017416	T	8	8	4051	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	387828036
125	NC_017416	AAAT	2	8	4094	4101	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
126	NC_017416	TAA	2	6	4133	4138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
127	NC_017416	AGA	2	6	4161	4166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
128	NC_017416	ATT	2	6	4177	4182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387828036
129	NC_017416	CAAAA	2	10	4183	4192	80 %	0 %	0 %	20 %	387828036
130	NC_017416	A	6	6	4189	4194	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
131	NC_017416	AGA	2	6	4206	4211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
132	NC_017416	AGA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
133	NC_017416	A	9	9	4221	4229	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
134	NC_017416	ATA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
135	NC_017416	AAAT	2	8	4289	4296	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
136	NC_017416	TATAT	2	10	4315	4324	40 %	60 %	0 %	0 %	387828036
137	NC_017416	AAAT	2	8	4386	4393	75 %	25 %	0 %	0 %	387828036
138	NC_017416	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387828036
139	NC_017416	A	6	6	4495	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	387828036
140	NC_017416	TAAAA	2	10	4536	4545	80 %	20 %	0 %	0 %	387828036
141	NC_017416	AT	3	6	4563	4568	50 %	50 %	0 %	0 %	387828036
142	NC_017416	TAA	2	6	4574	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387828036
143	NC_017416	ATC	2	6	4601	4606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387828036
144	NC_017416	AGA	2	6	4626	4631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387828036
145	NC_017416	CGCAAT	2	12	4641	4652	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387828036
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427	NC_017416	ATT	2	6	11276	11281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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430	NC_017416	TTA	2	6	11320	11325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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