MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-5

Total Repeats: 811

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017406	TCA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826722
2	NC_017406	TAATA	2	10	53	62	60 %	40 %	0 %	0 %	387826722
3	NC_017406	CTTT	2	8	73	80	0 %	75 %	0 %	25 %	387826722
4	NC_017406	T	8	8	78	85	0 %	100 %	0 %	0 %	387826722
5	NC_017406	TGA	2	6	112	117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826722
6	NC_017406	CAA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826722
7	NC_017406	A	7	7	165	171	100 %	0 %	0 %	0 %	387826722
8	NC_017406	TCT	3	9	187	195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826722
9	NC_017406	T	9	9	197	205	0 %	100 %	0 %	0 %	387826722
10	NC_017406	TTC	2	6	264	269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826722
11	NC_017406	TCT	2	6	306	311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826722
12	NC_017406	CT	3	6	321	326	0 %	50 %	0 %	50 %	387826722
13	NC_017406	TTCTT	2	10	327	336	0 %	80 %	0 %	20 %	387826722
14	NC_017406	CT	3	6	345	350	0 %	50 %	0 %	50 %	387826722
15	NC_017406	TTC	2	6	351	356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826722
16	NC_017406	T	9	9	366	374	0 %	100 %	0 %	0 %	387826722
17	NC_017406	ATT	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826722
18	NC_017406	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826722
19	NC_017406	CTA	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826722
20	NC_017406	ATTT	2	8	425	432	25 %	75 %	0 %	0 %	387826722
21	NC_017406	TCT	2	6	438	443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826722
22	NC_017406	ATG	2	6	444	449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826722
23	NC_017406	ATA	2	6	464	469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826722
24	NC_017406	TAAT	2	8	470	477	50 %	50 %	0 %	0 %	387826722
25	NC_017406	A	6	6	484	489	100 %	0 %	0 %	0 %	387826722
26	NC_017406	TTAAA	2	10	491	500	60 %	40 %	0 %	0 %	387826722
27	NC_017406	AAT	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826722
28	NC_017406	T	7	7	537	543	0 %	100 %	0 %	0 %	387826722
29	NC_017406	A	7	7	544	550	100 %	0 %	0 %	0 %	387826722
30	NC_017406	T	6	6	565	570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017406	CAAC	2	8	571	578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017406	TA	3	6	597	602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017406	TA	3	6	614	619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017406	AGA	2	6	620	625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017406	TTGA	2	8	643	650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017406	TGA	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017406	ATT	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017406	GATAAA	2	12	697	708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017406	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017406	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017406	TAT	2	6	771	776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017406	TA	3	6	780	785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017406	AT	3	6	790	795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017406	T	8	8	803	810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017406	AAAT	2	8	945	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017406	AT	6	12	995	1006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017406	ATTTA	2	10	1015	1024	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017406	TCTT	2	8	1028	1035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017406	TTA	2	6	1040	1045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017406	ATTT	2	8	1065	1072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017406	T	8	8	1070	1077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017406	A	8	8	1078	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017406	ATTT	2	8	1092	1099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017406	TAT	2	6	1119	1124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017406	TTC	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017406	CTA	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017406	T	6	6	1180	1185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017406	ATA	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017406	AT	3	6	1258	1263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017406	ATA	2	6	1349	1354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017406	A	7	7	1354	1360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017406	A	6	6	1409	1414	100 %	0 %	0 %	0 %	387826723
63	NC_017406	AT	3	6	1431	1436	50 %	50 %	0 %	0 %	387826723
64	NC_017406	TA	4	8	1440	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	387826723
65	NC_017406	ATT	2	6	1450	1455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826723
66	NC_017406	T	6	6	1465	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	387826723
67	NC_017406	CCA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826723
68	NC_017406	CAA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826723
69	NC_017406	A	7	7	1526	1532	100 %	0 %	0 %	0 %	387826723
70	NC_017406	ATA	2	6	1557	1562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826723
71	NC_017406	AG	3	6	1576	1581	50 %	0 %	50 %	0 %	387826723
72	NC_017406	TAA	2	6	1582	1587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826723
73	NC_017406	AAATA	2	10	1621	1630	80 %	20 %	0 %	0 %	387826723
74	NC_017406	AAG	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826723
75	NC_017406	A	6	6	1705	1710	100 %	0 %	0 %	0 %	387826723
76	NC_017406	T	6	6	1761	1766	0 %	100 %	0 %	0 %	387826723
77	NC_017406	ATTCA	2	10	1772	1781	40 %	40 %	0 %	20 %	387826723
78	NC_017406	AAC	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826723
79	NC_017406	AAG	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826723
80	NC_017406	ATA	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826723
81	NC_017406	A	8	8	1896	1903	100 %	0 %	0 %	0 %	387826723
82	NC_017406	T	6	6	2019	2024	0 %	100 %	0 %	0 %	387826723
83	NC_017406	ATT	2	6	2061	2066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826723
84	NC_017406	A	6	6	2081	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	387826723
85	NC_017406	AAAC	2	8	2129	2136	75 %	0 %	0 %	25 %	387826723
86	NC_017406	TAA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826723
87	NC_017406	TAA	2	6	2182	2187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826723
88	NC_017406	ATTAA	2	10	2192	2201	60 %	40 %	0 %	0 %	387826723
89	NC_017406	GTT	2	6	2272	2277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017406	AT	3	6	2293	2298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017406	TGT	2	6	2312	2317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017406	AAG	2	6	2338	2343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017406	AAT	2	6	2351	2356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826724
94	NC_017406	ATT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826724
95	NC_017406	CAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826724
96	NC_017406	TG	3	6	2406	2411	0 %	50 %	50 %	0 %	387826724
97	NC_017406	AAT	2	6	2419	2424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826724
98	NC_017406	TTAA	2	8	2444	2451	50 %	50 %	0 %	0 %	387826724
99	NC_017406	GAA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826724
100	NC_017406	GAA	3	9	2495	2503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826724
101	NC_017406	A	7	7	2515	2521	100 %	0 %	0 %	0 %	387826724
102	NC_017406	AGA	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826724
103	NC_017406	A	9	9	2537	2545	100 %	0 %	0 %	0 %	387826724
104	NC_017406	ATAAAA	2	12	2580	2591	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387826724
105	NC_017406	AGA	2	6	2594	2599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826724
106	NC_017406	A	6	6	2624	2629	100 %	0 %	0 %	0 %	387826724
107	NC_017406	ATTT	2	8	2758	2765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017406	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017406	AACA	2	8	2807	2814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017406	AATA	2	8	2822	2829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017406	T	7	7	2842	2848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017406	TTG	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017406	CTT	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
114	NC_017406	AAT	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826725
115	NC_017406	CTA	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826725
116	NC_017406	AT	3	6	2965	2970	50 %	50 %	0 %	0 %	387826725
117	NC_017406	T	6	6	2979	2984	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
118	NC_017406	TAA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826725
119	NC_017406	TCT	2	6	3025	3030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
120	NC_017406	ATT	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826725
121	NC_017406	TTTTCT	2	12	3073	3084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387826725
122	NC_017406	TCT	2	6	3130	3135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
123	NC_017406	T	6	6	3214	3219	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
124	NC_017406	TTC	2	6	3258	3263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
125	NC_017406	TCT	2	6	3321	3326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
126	NC_017406	AG	3	6	3346	3351	50 %	0 %	50 %	0 %	387826725
127	NC_017406	ATA	2	6	3364	3369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826725
128	NC_017406	AAT	2	6	3370	3375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826725
129	NC_017406	T	6	6	3375	3380	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
130	NC_017406	GTT	2	6	3535	3540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387826725
131	NC_017406	T	7	7	3546	3552	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
132	NC_017406	TCT	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
133	NC_017406	A	6	6	3609	3614	100 %	0 %	0 %	0 %	387826725
134	NC_017406	TTGAA	2	10	3617	3626	40 %	40 %	20 %	0 %	387826725
135	NC_017406	A	7	7	3650	3656	100 %	0 %	0 %	0 %	387826725
136	NC_017406	ATT	2	6	3669	3674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826725
137	NC_017406	TCT	2	6	3676	3681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
138	NC_017406	TTC	2	6	3783	3788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826725
139	NC_017406	TAT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826725
140	NC_017406	T	6	6	3886	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
141	NC_017406	CAC	2	6	3923	3928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387826725
142	NC_017406	T	6	6	4028	4033	0 %	100 %	0 %	0 %	387826725
143	NC_017406	TTA	2	6	4157	4162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826725
144	NC_017406	A	7	7	4191	4197	100 %	0 %	0 %	0 %	387826725
145	NC_017406	ACT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826725
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