MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-3

Total Repeats: 938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017405	T	6	6	6	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017405	TAACTT	2	12	57	68	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017405	ATA	2	6	93	98	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017405	T	8	8	160	167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017405	AAT	2	6	179	184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017405	TAA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017405	TAT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017405	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
9	NC_017405	ATT	2	6	295	300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
10	NC_017405	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
11	NC_017405	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
12	NC_017405	A	6	6	368	373	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
13	NC_017405	AAAT	2	8	386	393	75 %	25 %	0 %	0 %	387826796
14	NC_017405	CAAA	2	8	400	407	75 %	0 %	0 %	25 %	387826796
15	NC_017405	ATT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
16	NC_017405	ATA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
17	NC_017405	CTA	2	6	488	493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826796
18	NC_017405	ATT	3	9	553	561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
19	NC_017405	AAAG	2	8	574	581	75 %	0 %	25 %	0 %	387826796
20	NC_017405	GGA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387826796
21	NC_017405	ACA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826796
22	NC_017405	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826796
23	NC_017405	ATAC	2	8	747	754	50 %	25 %	0 %	25 %	387826796
24	NC_017405	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
25	NC_017405	TAG	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826796
26	NC_017405	TTA	2	6	801	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
27	NC_017405	ATA	2	6	820	825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826796
28	NC_017405	ATT	2	6	847	852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826796
29	NC_017405	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	387826796
30	NC_017405	T	8	8	909	916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017405	A	8	8	935	942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017405	A	7	7	945	951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017405	A	6	6	969	974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017405	ATA	2	6	986	991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017405	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017405	ATT	2	6	1074	1079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
37	NC_017405	AAT	2	6	1093	1098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
38	NC_017405	A	8	8	1106	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
39	NC_017405	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
40	NC_017405	ATA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826797
41	NC_017405	CAA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
42	NC_017405	AATA	2	8	1180	1187	75 %	25 %	0 %	0 %	387826797
43	NC_017405	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
44	NC_017405	A	6	6	1202	1207	100 %	0 %	0 %	0 %	387826797
45	NC_017405	AT	3	6	1248	1253	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
46	NC_017405	TAT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826797
47	NC_017405	ATTA	2	8	1267	1274	50 %	50 %	0 %	0 %	387826797
48	NC_017405	CAA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826797
49	NC_017405	ACT	2	6	1307	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
50	NC_017405	AAACTA	2	12	1330	1341	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387826797
51	NC_017405	AACTA	2	10	1349	1358	60 %	20 %	0 %	20 %	387826797
52	NC_017405	CTA	3	9	1361	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826797
53	NC_017405	A	6	6	1379	1384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017405	AT	3	6	1430	1435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017405	ATAA	2	8	1445	1452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017405	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826798
57	NC_017405	AC	3	6	1550	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	387826798
58	NC_017405	ACA	2	6	1559	1564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826798
59	NC_017405	A	6	6	1578	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	387826798
60	NC_017405	TAG	2	6	1596	1601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826798
61	NC_017405	TAAAC	2	10	1650	1659	60 %	20 %	0 %	20 %	387826798
62	NC_017405	TA	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017405	TTAT	2	8	1735	1742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017405	TAAAC	2	10	1764	1773	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017405	TTC	3	9	1797	1805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017405	TA	4	8	1849	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017405	AAG	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017405	GA	3	6	1874	1879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017405	TAT	2	6	1914	1919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017405	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017405	AAAG	2	8	1937	1944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017405	AGT	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017405	AG	3	6	1992	1997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017405	TA	3	6	2053	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017405	AAT	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017405	T	6	6	2069	2074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017405	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017405	ATT	2	6	2099	2104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017405	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017405	TAG	2	6	2166	2171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017405	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017405	TAA	2	6	2268	2273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
83	NC_017405	CAG	2	6	2312	2317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387826799
84	NC_017405	A	6	6	2323	2328	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
85	NC_017405	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
86	NC_017405	T	6	6	2337	2342	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
87	NC_017405	CTT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
88	NC_017405	ATTT	2	8	2370	2377	25 %	75 %	0 %	0 %	387826799
89	NC_017405	T	6	6	2472	2477	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
90	NC_017405	CAA	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
91	NC_017405	CAA	2	6	2501	2506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
92	NC_017405	AGA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826799
93	NC_017405	ACA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
94	NC_017405	T	6	6	2565	2570	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
95	NC_017405	CAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
96	NC_017405	ATC	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
97	NC_017405	AATT	2	8	2646	2653	50 %	50 %	0 %	0 %	387826799
98	NC_017405	TTC	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826799
99	NC_017405	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826799
100	NC_017405	T	6	6	2727	2732	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
101	NC_017405	ATATAG	2	12	2735	2746	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387826799
102	NC_017405	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
103	NC_017405	AAT	2	6	2849	2854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
104	NC_017405	CAA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826799
105	NC_017405	CTA	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826799
106	NC_017405	ATA	2	6	2924	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826799
107	NC_017405	A	6	6	2959	2964	100 %	0 %	0 %	0 %	387826799
108	NC_017405	T	7	7	2966	2972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826799
109	NC_017405	T	6	6	3061	3066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017405	TA	3	6	3078	3083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017405	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017405	A	7	7	3090	3096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017405	ATTA	2	8	3127	3134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017405	TC	3	6	3136	3141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017405	T	8	8	3160	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017405	T	7	7	3177	3183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017405	TA	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017405	A	6	6	3212	3217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017405	TAA	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017405	A	7	7	3306	3312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017405	TCA	2	6	3357	3362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017405	GAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017405	A	6	6	3424	3429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017405	A	6	6	3433	3438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017405	ATT	2	6	3445	3450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017405	AAT	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017405	T	6	6	3478	3483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017405	A	6	6	3489	3494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017405	ATT	2	6	3504	3509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017405	AAGA	2	8	3522	3529	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017405	ATC	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017405	TA	3	6	3627	3632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017405	GTAA	2	8	3634	3641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017405	ACCA	2	8	3726	3733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017405	ATT	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017405	T	6	6	3789	3794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017405	A	7	7	3808	3814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017405	TCA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017405	TAA	3	9	3846	3854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017405	TTAA	2	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	387826800
141	NC_017405	AAT	2	6	3919	3924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826800
142	NC_017405	TTA	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
143	NC_017405	TTC	2	6	3956	3961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
144	NC_017405	T	6	6	3972	3977	0 %	100 %	0 %	0 %	387826800
145	NC_017405	TCT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826800
146	NC_017405	ATTTTC	2	12	4052	4063	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387826800
147	NC_017405	TTA	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826800
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