MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-9

Total Repeats: 794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017397	A	6	6	20624	20629	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
502	NC_017397	ATA	2	6	20648	20653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825652
503	NC_017397	ATA	2	6	20660	20665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825652
504	NC_017397	A	6	6	20665	20670	100 %	0 %	0 %	0 %	387825652
505	NC_017397	ATA	2	6	20677	20682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825652
506	NC_017397	TCAA	2	8	20692	20699	50 %	25 %	0 %	25 %	387825653
507	NC_017397	AAAG	2	8	20752	20759	75 %	0 %	25 %	0 %	387825653
508	NC_017397	T	6	6	20811	20816	0 %	100 %	0 %	0 %	387825653
509	NC_017397	TTAAA	2	10	20819	20828	60 %	40 %	0 %	0 %	387825653
510	NC_017397	AT	3	6	20886	20891	50 %	50 %	0 %	0 %	387825653
511	NC_017397	A	6	6	20999	21004	100 %	0 %	0 %	0 %	387825653
512	NC_017397	ATT	2	6	21098	21103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825653
513	NC_017397	TAA	2	6	21104	21109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825653
514	NC_017397	AATT	2	8	21114	21121	50 %	50 %	0 %	0 %	387825653
515	NC_017397	AATA	2	8	21165	21172	75 %	25 %	0 %	0 %	387825653
516	NC_017397	T	6	6	21201	21206	0 %	100 %	0 %	0 %	387825653
517	NC_017397	AG	3	6	21222	21227	50 %	0 %	50 %	0 %	387825653
518	NC_017397	ATA	2	6	21247	21252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825653
519	NC_017397	GAT	2	6	21307	21312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825653
520	NC_017397	A	6	6	21316	21321	100 %	0 %	0 %	0 %	387825653
521	NC_017397	TTC	2	6	21345	21350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825653
522	NC_017397	TAT	2	6	21361	21366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825653
523	NC_017397	A	6	6	21376	21381	100 %	0 %	0 %	0 %	387825653
524	NC_017397	AAATA	2	10	21413	21422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017397	ATA	2	6	21474	21479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825654
526	NC_017397	AGA	2	6	21527	21532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825654
527	NC_017397	AGA	2	6	21542	21547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825654
528	NC_017397	AAC	2	6	21581	21586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825654
529	NC_017397	GAT	2	6	21588	21593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387825654
530	NC_017397	TAA	2	6	21599	21604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825654
531	NC_017397	A	8	8	21640	21647	100 %	0 %	0 %	0 %	387825654
532	NC_017397	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	387825654
533	NC_017397	TAT	2	6	21758	21763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825654
534	NC_017397	TAA	2	6	21782	21787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825654
535	NC_017397	A	6	6	21796	21801	100 %	0 %	0 %	0 %	387825654
536	NC_017397	TTA	2	6	21829	21834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825654
537	NC_017397	A	6	6	21834	21839	100 %	0 %	0 %	0 %	387825654
538	NC_017397	A	8	8	21906	21913	100 %	0 %	0 %	0 %	387825654
539	NC_017397	GAA	2	6	21939	21944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825654
540	NC_017397	CTT	2	6	21945	21950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387825654
541	NC_017397	TAA	2	6	21971	21976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825654
542	NC_017397	A	7	7	21983	21989	100 %	0 %	0 %	0 %	387825654
543	NC_017397	AAG	2	6	22012	22017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387825654
544	NC_017397	A	6	6	22064	22069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017397	TTC	2	6	22117	22122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017397	AAT	2	6	22160	22165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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548	NC_017397	AGA	2	6	22228	22233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017397	AGA	2	6	22261	22266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017397	ATAG	2	8	22281	22288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017397	ATAG	2	8	22314	22321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017397	AGAT	2	8	22333	22340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017397	AT	3	6	22364	22369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017397	ATAG	2	8	22386	22393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017397	A	6	6	22399	22404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017397	AT	3	6	22417	22422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017397	ATA	2	6	22432	22437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017397	AAAT	2	8	22438	22445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017397	A	6	6	22451	22456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017397	TAA	2	6	22495	22500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017397	ATT	2	6	22521	22526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017397	T	6	6	22547	22552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017397	TAA	2	6	22582	22587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017397	TA	3	6	22593	22598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017397	TTTTA	2	10	22652	22661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_017397	TTA	2	6	22762	22767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017397	TAA	2	6	22788	22793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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572	NC_017397	TAA	2	6	22809	22814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017397	AAT	2	6	22836	22841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017397	TA	3	6	23004	23009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017397	TATT	2	8	23014	23021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017397	GGA	2	6	23035	23040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_017397	AAAT	2	8	23483	23490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017397	ATT	2	6	23515	23520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_017397	T	6	6	23690	23695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017397	A	7	7	23867	23873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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608	NC_017397	AATC	2	8	24054	24061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
609	NC_017397	A	7	7	24138	24144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_017397	AGAT	2	8	24278	24285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017397	CAA	2	6	24301	24306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017397	AAT	2	6	24345	24350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017397	A	6	6	24380	24385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017397	AAT	2	6	24393	24398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017397	TTA	2	6	24424	24429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825655
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618	NC_017397	ATA	2	6	24445	24450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387825655
619	NC_017397	TAT	2	6	24561	24566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825655
620	NC_017397	AT	3	6	24584	24589	50 %	50 %	0 %	0 %	387825655
621	NC_017397	TAT	2	6	24605	24610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825655
622	NC_017397	TAC	2	6	24633	24638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387825655
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625	NC_017397	CAA	2	6	24748	24753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387825655
626	NC_017397	A	6	6	24752	24757	100 %	0 %	0 %	0 %	387825655
627	NC_017397	ACTTG	2	10	24779	24788	20 %	40 %	20 %	20 %	387825655
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631	NC_017397	AG	3	6	24905	24910	50 %	0 %	50 %	0 %	387825656
632	NC_017397	TAAA	2	8	25015	25022	75 %	25 %	0 %	0 %	387825656
633	NC_017397	TTA	2	6	25032	25037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825656
634	NC_017397	TTA	2	6	25074	25079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387825656
635	NC_017397	T	6	6	25126	25131	0 %	100 %	0 %	0 %	387825656
636	NC_017397	T	7	7	25161	25167	0 %	100 %	0 %	0 %	387825656
637	NC_017397	T	7	7	25252	25258	0 %	100 %	0 %	0 %	387825656
638	NC_017397	ACCA	2	8	25384	25391	50 %	0 %	0 %	50 %	387825656
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