MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) chromosome

Total Repeats: 21416

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017259	TAA	4	12	24	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017259	TAT	3	9	37	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017259	T	15	15	45	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017259	AATT	2	8	60	67	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017259	TAAAAA	2	12	85	96	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017259	A	8	8	92	99	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017259	T	7	7	104	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017259	TTAA	2	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017259	TAA	2	6	157	162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017259	TTTTA	2	10	192	201	20 %	80 %	0 %	0 %	384228036
11	NC_017259	TGG	2	6	236	241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228036
12	NC_017259	ATT	3	9	296	304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
13	NC_017259	A	6	6	310	315	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
14	NC_017259	GT	3	6	328	333	0 %	50 %	50 %	0 %	384228036
15	NC_017259	GAAA	2	8	380	387	75 %	0 %	25 %	0 %	384228036
16	NC_017259	AGG	2	6	398	403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228036
17	NC_017259	ATT	2	6	424	429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
18	NC_017259	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228036
19	NC_017259	CTA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228036
20	NC_017259	AGAT	2	8	497	504	50 %	25 %	25 %	0 %	384228036
21	NC_017259	A	8	8	513	520	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
22	NC_017259	A	7	7	524	530	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
23	NC_017259	AACAA	2	10	536	545	80 %	0 %	0 %	20 %	384228036
24	NC_017259	A	7	7	544	550	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
25	NC_017259	TTA	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
26	NC_017259	ATT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
27	NC_017259	AATT	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	384228036
28	NC_017259	GAAT	2	8	721	728	50 %	25 %	25 %	0 %	384228036
29	NC_017259	GA	3	6	761	766	50 %	0 %	50 %	0 %	384228036
30	NC_017259	ATTT	2	8	841	848	25 %	75 %	0 %	0 %	384228036
31	NC_017259	T	6	6	877	882	0 %	100 %	0 %	0 %	384228036
32	NC_017259	ATC	2	6	904	909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228036
33	NC_017259	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
34	NC_017259	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228036
35	NC_017259	TAA	2	6	1003	1008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228036
36	NC_017259	A	8	8	1066	1073	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
37	NC_017259	ATA	2	6	1116	1121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228036
38	NC_017259	ATT	2	6	1206	1211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
39	NC_017259	T	7	7	1238	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	384228036
40	NC_017259	ATTA	2	8	1280	1287	50 %	50 %	0 %	0 %	384228036
41	NC_017259	ATT	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
42	NC_017259	T	6	6	1296	1301	0 %	100 %	0 %	0 %	384228036
43	NC_017259	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228036
44	NC_017259	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228036
45	NC_017259	GCA	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228036
46	NC_017259	ATT	2	6	1352	1357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
47	NC_017259	A	6	6	1385	1390	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
48	NC_017259	TCA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228036
49	NC_017259	TGA	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228036
50	NC_017259	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228036
51	NC_017259	GTTTG	2	10	1562	1571	0 %	60 %	40 %	0 %	384228036
52	NC_017259	ATG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228036
53	NC_017259	ATA	2	6	1642	1647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228036
54	NC_017259	ATT	2	6	1733	1738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228036
55	NC_017259	A	7	7	1788	1794	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
56	NC_017259	GT	3	6	1795	1800	0 %	50 %	50 %	0 %	384228036
57	NC_017259	AGT	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228036
58	NC_017259	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228036
59	NC_017259	A	6	6	1889	1894	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
60	NC_017259	A	6	6	1930	1935	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
61	NC_017259	TCT	2	6	1947	1952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228036
62	NC_017259	A	6	6	1962	1967	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
63	NC_017259	GCG	2	6	2028	2033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384228036
64	NC_017259	ATTT	2	8	2049	2056	25 %	75 %	0 %	0 %	384228036
65	NC_017259	A	8	8	2057	2064	100 %	0 %	0 %	0 %	384228036
66	NC_017259	TAA	2	6	2120	2125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017259	TTAA	2	8	2131	2138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017259	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017259	AAT	3	9	2184	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017259	T	8	8	2222	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017259	ATT	2	6	2260	2265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017259	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017259	A	6	6	2291	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	384228037
74	NC_017259	AT	3	6	2313	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	384228037
75	NC_017259	TCA	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228037
76	NC_017259	TCT	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228037
77	NC_017259	TAA	2	6	2402	2407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228037
78	NC_017259	AAT	2	6	2418	2423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228037
79	NC_017259	T	6	6	2423	2428	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
80	NC_017259	GTT	2	6	2441	2446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228037
81	NC_017259	T	9	9	2445	2453	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
82	NC_017259	TTG	2	6	2468	2473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228037
83	NC_017259	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228037
84	NC_017259	GAATT	2	10	2516	2525	40 %	40 %	20 %	0 %	384228037
85	NC_017259	GTAT	2	8	2558	2565	25 %	50 %	25 %	0 %	384228037
86	NC_017259	T	7	7	2618	2624	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
87	NC_017259	T	6	6	2680	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
88	NC_017259	CTG	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228037
89	NC_017259	ATATTA	2	12	2720	2731	50 %	50 %	0 %	0 %	384228037
90	NC_017259	T	8	8	2755	2762	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
91	NC_017259	T	6	6	2802	2807	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
92	NC_017259	ATC	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228037
93	NC_017259	ATTTT	2	10	2858	2867	20 %	80 %	0 %	0 %	384228037
94	NC_017259	TTTTA	2	10	2946	2955	20 %	80 %	0 %	0 %	384228037
95	NC_017259	TGG	2	6	2974	2979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228037
96	NC_017259	T	6	6	2988	2993	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
97	NC_017259	TAA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228037
98	NC_017259	T	7	7	3029	3035	0 %	100 %	0 %	0 %	384228037
99	NC_017259	TTTTAT	2	12	3042	3053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228037
100	NC_017259	TTTA	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	384228037
101	NC_017259	A	6	6	3125	3130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017259	TAA	2	6	3138	3143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228038
103	NC_017259	TA	3	6	3170	3175	50 %	50 %	0 %	0 %	384228038
104	NC_017259	TGG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228038
105	NC_017259	AGC	2	6	3211	3216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228038
106	NC_017259	GTA	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228038
107	NC_017259	ATT	2	6	3283	3288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228038
108	NC_017259	T	6	6	3299	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	384228038
109	NC_017259	GTT	2	6	3305	3310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228038
110	NC_017259	GGTTTA	2	12	3347	3358	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384228038
111	NC_017259	TA	3	6	3357	3362	50 %	50 %	0 %	0 %	384228038
112	NC_017259	T	8	8	3390	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017259	TA	3	6	3403	3408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017259	TGT	2	6	3433	3438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017259	TTTG	2	8	3440	3447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017259	TAA	2	6	3454	3459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017259	T	7	7	3470	3476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017259	ATTT	2	8	3562	3569	25 %	75 %	0 %	0 %	384228039
119	NC_017259	TTTG	2	8	3572	3579	0 %	75 %	25 %	0 %	384228039
120	NC_017259	TAT	2	6	3607	3612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228039
121	NC_017259	AGA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228039
122	NC_017259	TAA	2	6	3654	3659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228039
123	NC_017259	A	6	6	3665	3670	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
124	NC_017259	TAT	2	6	3688	3693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228039
125	NC_017259	A	9	9	3696	3704	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
126	NC_017259	A	6	6	3728	3733	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
127	NC_017259	GTT	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228039
128	NC_017259	ATT	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228039
129	NC_017259	TA	3	6	3882	3887	50 %	50 %	0 %	0 %	384228039
130	NC_017259	GCAA	2	8	3917	3924	50 %	0 %	25 %	25 %	384228039
131	NC_017259	ATT	2	6	3926	3931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228039
132	NC_017259	A	8	8	3932	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
133	NC_017259	ATA	2	6	3954	3959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228039
134	NC_017259	GAT	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228039
135	NC_017259	TTG	2	6	3978	3983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228039
136	NC_017259	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
137	NC_017259	A	6	6	4000	4005	100 %	0 %	0 %	0 %	384228039
138	NC_017259	ATA	3	9	4072	4080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228040
139	NC_017259	CTT	2	6	4123	4128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228040
140	NC_017259	A	7	7	4130	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	384228040
141	NC_017259	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	384228040
142	NC_017259	TCA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228040
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