MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. TLW03 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 20926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017252	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017252	TAA	3	9	29	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017252	ATT	3	9	43	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017252	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017252	T	7	7	57	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017252	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017252	T	7	7	73	79	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017252	AAAGA	2	10	93	102	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017252	T	8	8	111	118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017252	TTTAA	2	10	212	221	40 %	60 %	0 %	0 %	384225822
11	NC_017252	GTT	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225822
12	NC_017252	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384225822
13	NC_017252	TCA	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
14	NC_017252	ATT	2	6	304	309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225822
15	NC_017252	CTCA	2	8	311	318	25 %	25 %	0 %	50 %	384225822
16	NC_017252	A	6	6	318	323	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
17	NC_017252	GGT	2	6	407	412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384225822
18	NC_017252	ATG	2	6	413	418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225822
19	NC_017252	CTG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384225822
20	NC_017252	CTA	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
21	NC_017252	A	8	8	532	539	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
22	NC_017252	A	6	6	544	549	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
23	NC_017252	AAT	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225822
24	NC_017252	TGT	2	6	610	615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225822
25	NC_017252	GT	3	6	618	623	0 %	50 %	50 %	0 %	384225822
26	NC_017252	AATT	2	8	637	644	50 %	50 %	0 %	0 %	384225822
27	NC_017252	AGC	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384225822
28	NC_017252	T	6	6	679	684	0 %	100 %	0 %	0 %	384225822
29	NC_017252	AGG	2	6	685	690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384225822
30	NC_017252	CTG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384225822
31	NC_017252	CGC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384225822
32	NC_017252	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225822
33	NC_017252	T	6	6	885	890	0 %	100 %	0 %	0 %	384225822
34	NC_017252	CAT	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
35	NC_017252	CA	3	6	940	945	50 %	0 %	0 %	50 %	384225822
36	NC_017252	A	6	6	954	959	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
37	NC_017252	ATA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225822
38	NC_017252	AT	3	6	998	1003	50 %	50 %	0 %	0 %	384225822
39	NC_017252	T	6	6	1009	1014	0 %	100 %	0 %	0 %	384225822
40	NC_017252	TAG	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225822
41	NC_017252	T	7	7	1246	1252	0 %	100 %	0 %	0 %	384225822
42	NC_017252	ATTA	2	8	1288	1295	50 %	50 %	0 %	0 %	384225822
43	NC_017252	T	6	6	1304	1309	0 %	100 %	0 %	0 %	384225822
44	NC_017252	ACT	2	6	1328	1333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
45	NC_017252	GAA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384225822
46	NC_017252	TTG	2	6	1361	1366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225822
47	NC_017252	GCA	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384225822
48	NC_017252	GAT	2	6	1451	1456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225822
49	NC_017252	ACT	2	6	1460	1465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
50	NC_017252	CTTT	2	8	1517	1524	0 %	75 %	0 %	25 %	384225822
51	NC_017252	AGA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384225822
52	NC_017252	A	9	9	1648	1656	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
53	NC_017252	A	7	7	1693	1699	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
54	NC_017252	TA	3	6	1701	1706	50 %	50 %	0 %	0 %	384225822
55	NC_017252	TTAAT	2	10	1710	1719	40 %	60 %	0 %	0 %	384225822
56	NC_017252	TTA	2	6	1742	1747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225822
57	NC_017252	TTG	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225822
58	NC_017252	AGA	2	6	1876	1881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384225822
59	NC_017252	A	6	6	1897	1902	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
60	NC_017252	ATC	2	6	1918	1923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225822
61	NC_017252	TCT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384225822
62	NC_017252	GTT	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225822
63	NC_017252	A	6	6	1970	1975	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
64	NC_017252	GCT	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384225822
65	NC_017252	TTA	2	6	2051	2056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225822
66	NC_017252	A	7	7	2065	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	384225822
67	NC_017252	T	6	6	2112	2117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017252	T	6	6	2131	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017252	AAAATT	2	12	2147	2158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017252	ATA	2	6	2182	2187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017252	T	8	8	2238	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017252	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017252	GA	3	6	2279	2284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017252	AT	3	6	2322	2327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017252	TCA	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017252	AGAT	2	8	2351	2358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017252	ATT	2	6	2374	2379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017252	TCT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017252	ATT	2	6	2402	2407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017252	T	7	7	2431	2437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017252	T	9	9	2454	2462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017252	T	6	6	2468	2473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017252	A	9	9	2484	2492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017252	TATT	2	8	2616	2623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017252	T	7	7	2628	2634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017252	GATT	2	8	2659	2666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017252	ATTT	2	8	2674	2681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017252	CTG	2	6	2724	2729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017252	ATATTA	2	12	2730	2741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017252	GT	3	6	2760	2765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017252	T	8	8	2765	2772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017252	ATTTT	2	10	2774	2783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017252	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017252	TTTTA	2	10	2956	2965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017252	TGC	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017252	TGG	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017252	T	6	6	2998	3003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017252	TAA	2	6	3033	3038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017252	TTTTAT	2	12	3052	3063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017252	T	7	7	3128	3134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017252	TA	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	384225823
102	NC_017252	TGG	2	6	3198	3203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384225823
103	NC_017252	GGAATT	2	12	3230	3241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225823
104	NC_017252	ATT	2	6	3292	3297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225823
105	NC_017252	T	6	6	3308	3313	0 %	100 %	0 %	0 %	384225823
106	NC_017252	TA	3	6	3366	3371	50 %	50 %	0 %	0 %	384225823
107	NC_017252	T	7	7	3392	3398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017252	T	6	6	3406	3411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017252	A	6	6	3414	3419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017252	ATT	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017252	ATT	2	6	3433	3438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017252	T	7	7	3455	3461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017252	AT	3	6	3578	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	384225824
114	NC_017252	CCT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384225824
115	NC_017252	ATT	2	6	3594	3599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225824
116	NC_017252	A	7	7	3650	3656	100 %	0 %	0 %	0 %	384225824
117	NC_017252	TA	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	384225824
118	NC_017252	A	9	9	3682	3690	100 %	0 %	0 %	0 %	384225824
119	NC_017252	ATT	2	6	3702	3707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225824
120	NC_017252	AGA	2	6	3770	3775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384225824
121	NC_017252	AGA	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384225824
122	NC_017252	A	7	7	3804	3810	100 %	0 %	0 %	0 %	384225824
123	NC_017252	AGT	2	6	3878	3883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225824
124	NC_017252	A	6	6	3907	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	384225824
125	NC_017252	A	8	8	3918	3925	100 %	0 %	0 %	0 %	384225824
126	NC_017252	GAT	2	6	3936	3941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225824
127	NC_017252	GTT	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384225824
128	NC_017252	CTT	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384225824
129	NC_017252	AAT	2	6	4058	4063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225825
130	NC_017252	AT	3	6	4083	4088	50 %	50 %	0 %	0 %	384225825
131	NC_017252	TTA	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225825
132	NC_017252	A	6	6	4118	4123	100 %	0 %	0 %	0 %	384225825
133	NC_017252	T	6	6	4132	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	384225825
134	NC_017252	TGA	2	6	4201	4206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225825
135	NC_017252	A	6	6	4213	4218	100 %	0 %	0 %	0 %	384225825
136	NC_017252	TAA	2	6	4221	4226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225825
137	NC_017252	ATT	2	6	4228	4233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225825
138	NC_017252	AT	3	6	4254	4259	50 %	50 %	0 %	0 %	384225825
139	NC_017252	ATA	2	6	4263	4268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225825
140	NC_017252	CAT	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225825
141	NC_017252	TTC	2	6	4388	4393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384225825
142	NC_017252	A	8	8	4396	4403	100 %	0 %	0 %	0 %	384225825
143	NC_017252	TA	4	8	4411	4418	50 %	50 %	0 %	0 %	384225825
144	NC_017252	AAT	2	6	4460	4465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225825
145	NC_017252	ATC	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225825
146	NC_017252	AAT	3	9	4532	4540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017252	AT	3	6	4539	4544	50 %	50 %	0 %	0 %	384225826
148	NC_017252	ATTA	2	8	4572	4579	50 %	50 %	0 %	0 %	384225826
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150	NC_017252	AATC	2	8	4609	4616	50 %	25 %	0 %	25 %	384225826
151	NC_017252	TAT	2	6	4632	4637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225826
152	NC_017252	TAT	2	6	4653	4658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225826
153	NC_017252	TAA	2	6	4710	4715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225826
154	NC_017252	T	6	6	4848	4853	0 %	100 %	0 %	0 %	384225826
155	NC_017252	AGT	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225826
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262	NC_017252	A	6	6	8602	8607	100 %	0 %	0 %	0 %	384225829
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408	NC_017252	A	7	7	12998	13004	100 %	0 %	0 %	0 %	384225832
409	NC_017252	ATA	2	6	13018	13023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225832
410	NC_017252	T	7	7	13043	13049	0 %	100 %	0 %	0 %	384225832
411	NC_017252	GGA	2	6	13080	13085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384225832
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445	NC_017252	T	7	7	14206	14212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017252	TA	3	6	14899	14904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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