MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017249	GTT	2	6	169581	169586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213905
4003	NC_017249	GCC	2	6	169587	169592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213905
4004	NC_017249	CGG	2	6	169706	169711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213905
4005	NC_017249	AGA	2	6	169856	169861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213905
4006	NC_017249	AGC	2	6	169879	169884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4007	NC_017249	AG	3	6	169886	169891	50 %	0 %	50 %	0 %	384213905
4008	NC_017249	AGA	2	6	169937	169942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213905
4009	NC_017249	TGC	3	9	169952	169960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4010	NC_017249	CGA	2	6	169963	169968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4011	NC_017249	GAA	2	6	169974	169979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213905
4012	NC_017249	CGA	2	6	170018	170023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4013	NC_017249	AG	3	6	170042	170047	50 %	0 %	50 %	0 %	384213905
4014	NC_017249	TCA	2	6	170107	170112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213905
4015	NC_017249	GCT	2	6	170171	170176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4016	NC_017249	AT	3	6	170201	170206	50 %	50 %	0 %	0 %	384213905
4017	NC_017249	GCA	2	6	170213	170218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213905
4018	NC_017249	CGA	2	6	170294	170299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017249	GGC	2	6	170331	170336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017249	GCC	2	6	170351	170356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_017249	CCT	2	6	170360	170365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017249	CGAGCC	2	12	170413	170424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_017249	CG	3	6	170470	170475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_017249	CCGT	2	8	170480	170487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_017249	AGCCT	2	10	170498	170507	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4026	NC_017249	CAT	2	6	170524	170529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017249	TGCGT	2	10	170575	170584	0 %	40 %	40 %	20 %	384213906
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4030	NC_017249	CGCCC	2	10	170729	170738	0 %	0 %	20 %	80 %	384213906
4031	NC_017249	GCG	2	6	170739	170744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213906
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4033	NC_017249	CGG	2	6	170812	170817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213906
4034	NC_017249	CG	3	6	170925	170930	0 %	0 %	50 %	50 %	384213906
4035	NC_017249	GCC	2	6	170947	170952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213906
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4037	NC_017249	GGC	2	6	171015	171020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213906
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4041	NC_017249	GCC	2	6	171142	171147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213906
4042	NC_017249	CG	3	6	171166	171171	0 %	0 %	50 %	50 %	384213906
4043	NC_017249	GCC	2	6	171208	171213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017249	AAC	2	6	171216	171221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017249	GC	3	6	171267	171272	0 %	0 %	50 %	50 %	384213907
4046	NC_017249	TCG	2	6	171274	171279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213907
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4049	NC_017249	CAA	2	6	171314	171319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213907
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4052	NC_017249	GCGCC	2	10	171396	171405	0 %	0 %	40 %	60 %	384213907
4053	NC_017249	CGC	2	6	171470	171475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213907
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4055	NC_017249	CGGC	2	8	171538	171545	0 %	0 %	50 %	50 %	384213907
4056	NC_017249	GCG	2	6	171550	171555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213907
4057	NC_017249	GCACCG	2	12	171556	171567	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384213907
4058	NC_017249	GCC	2	6	171570	171575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213907
4059	NC_017249	CAT	2	6	171578	171583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213907
4060	NC_017249	CG	4	8	171593	171600	0 %	0 %	50 %	50 %	384213907
4061	NC_017249	GAG	2	6	171687	171692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213907
4062	NC_017249	CTG	2	6	171693	171698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213907
4063	NC_017249	ATC	2	6	171720	171725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213907
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4069	NC_017249	TCA	2	6	172015	172020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213907
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4087	NC_017249	ATG	2	6	172544	172549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017249	GC	3	6	172644	172649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_017249	CGC	2	6	172671	172676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017249	GGCG	2	8	172709	172716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_017249	CCG	2	6	172745	172750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_017249	TGC	2	6	172765	172770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213908
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4094	NC_017249	CGAT	2	8	172842	172849	25 %	25 %	25 %	25 %	384213908
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4097	NC_017249	CGACA	2	10	173003	173012	40 %	0 %	20 %	40 %	384213908
4098	NC_017249	CG	3	6	173026	173031	0 %	0 %	50 %	50 %	384213908
4099	NC_017249	ACG	2	6	173040	173045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213908
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4106	NC_017249	GCC	2	6	173506	173511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_017249	CCAT	2	8	173536	173543	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_017249	ACG	2	6	173595	173600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213909
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4110	NC_017249	CTGC	2	8	173704	173711	0 %	25 %	25 %	50 %	384213909
4111	NC_017249	CG	3	6	173928	173933	0 %	0 %	50 %	50 %	384213909
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4116	NC_017249	CGCGA	2	10	174219	174228	20 %	0 %	40 %	40 %	384213909
4117	NC_017249	TCT	2	6	174234	174239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213909
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4119	NC_017249	GCGATC	2	12	174305	174316	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213909
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4249	NC_017249	GAA	2	6	178950	178955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213914
4250	NC_017249	GC	3	6	178991	178996	0 %	0 %	50 %	50 %	384213914
4251	NC_017249	GCA	2	6	179132	179137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213914
4252	NC_017249	CGG	2	6	179157	179162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213914
4253	NC_017249	GAT	2	6	179163	179168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213914
4254	NC_017249	TCGA	2	8	179203	179210	25 %	25 %	25 %	25 %	384213914
4255	NC_017249	CGGC	2	8	179222	179229	0 %	0 %	50 %	50 %	384213914
4256	NC_017249	TCG	2	6	179239	179244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213914
4257	NC_017249	ATG	2	6	179257	179262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213914
4258	NC_017249	GTC	2	6	179283	179288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213914
4259	NC_017249	GC	3	6	179297	179302	0 %	0 %	50 %	50 %	384213914
4260	NC_017249	CGTG	2	8	179426	179433	0 %	25 %	50 %	25 %	384213914
4261	NC_017249	GTC	2	6	179493	179498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213914
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4264	NC_017249	GATC	2	8	179585	179592	25 %	25 %	25 %	25 %	384213914
4265	NC_017249	GGC	2	6	179666	179671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213914
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4270	NC_017249	CCG	2	6	179917	179922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213914
4271	NC_017249	TCG	2	6	179935	179940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213914
4272	NC_017249	GCC	2	6	180087	180092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213914
4273	NC_017249	GCG	2	6	180095	180100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213914
4274	NC_017249	ACG	2	6	180109	180114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213914
4275	NC_017249	CGC	2	6	180152	180157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213914
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4277	NC_017249	AAC	2	6	180204	180209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213914
4278	NC_017249	GCC	2	6	180233	180238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4279	NC_017249	CGT	2	6	180316	180321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4280	NC_017249	CCA	2	6	180343	180348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213915
4281	NC_017249	GCA	3	9	180358	180366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213915
4282	NC_017249	GTC	2	6	180392	180397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213915
4283	NC_017249	TGT	2	6	180457	180462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213915
4284	NC_017249	CGG	2	6	180481	180486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213915
4285	NC_017249	CGAT	2	8	180523	180530	25 %	25 %	25 %	25 %	384213915
4286	NC_017249	CGGATG	2	12	180546	180557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384213915
4287	NC_017249	GCA	3	9	180613	180621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213915
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4291	NC_017249	ACG	2	6	180774	180779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213915
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4298	NC_017249	CG	3	6	180931	180936	0 %	0 %	50 %	50 %	384213915
4299	NC_017249	CGGC	2	8	180977	180984	0 %	0 %	50 %	50 %	384213915
4300	NC_017249	ATC	2	6	181029	181034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213915
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4306	NC_017249	CG	3	6	181239	181244	0 %	0 %	50 %	50 %	384213915
4307	NC_017249	GCGCG	2	10	181288	181297	0 %	0 %	60 %	40 %	384213915
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4309	NC_017249	CTGCGC	2	12	181319	181330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384213915
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4315	NC_017249	CGTCA	2	10	181549	181558	20 %	20 %	20 %	40 %	384213916
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4319	NC_017249	ATC	3	9	181694	181702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213916
4320	NC_017249	GCT	2	6	181713	181718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213916
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4322	NC_017249	CAG	2	6	181780	181785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213916
4323	NC_017249	CAT	2	6	181795	181800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213916
4324	NC_017249	TTC	2	6	181811	181816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213916
4325	NC_017249	CGC	2	6	181823	181828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213916
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4327	NC_017249	GAT	2	6	181852	181857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213916
4328	NC_017249	GGC	2	6	181875	181880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213916
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4331	NC_017249	GCCC	2	8	181926	181933	0 %	0 %	25 %	75 %	384213916
4332	NC_017249	GC	3	6	181940	181945	0 %	0 %	50 %	50 %	384213916
4333	NC_017249	GTG	2	6	181946	181951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213916
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4340	NC_017249	CTG	2	6	182206	182211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213916
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4351	NC_017249	TCG	4	12	182618	182629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213916
4352	NC_017249	GCGCT	2	10	182645	182654	0 %	20 %	40 %	40 %	384213916
4353	NC_017249	CTGGT	2	10	182705	182714	0 %	40 %	40 %	20 %	384213916
4354	NC_017249	GCC	2	6	182772	182777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213916
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4358	NC_017249	GCG	2	6	182862	182867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213916
4359	NC_017249	CGGT	2	8	182876	182883	0 %	25 %	50 %	25 %	384213916
4360	NC_017249	TCG	2	6	182888	182893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213916
4361	NC_017249	TCG	2	6	182915	182920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213916
4362	NC_017249	CGCC	2	8	182946	182953	0 %	0 %	25 %	75 %	384213916
4363	NC_017249	GCG	2	6	182956	182961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213916
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4366	NC_017249	CG	3	6	183131	183136	0 %	0 %	50 %	50 %	384213916
4367	NC_017249	GC	3	6	183148	183153	0 %	0 %	50 %	50 %	384213916
4368	NC_017249	CAGG	2	8	183226	183233	25 %	0 %	50 %	25 %	384213916
4369	NC_017249	TCGG	2	8	183257	183264	0 %	25 %	50 %	25 %	384213916
4370	NC_017249	GAT	3	9	183296	183304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213916
4371	NC_017249	CGC	2	6	183341	183346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213917
4372	NC_017249	CTC	2	6	183372	183377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213917
4373	NC_017249	GCT	2	6	183506	183511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213917
4374	NC_017249	CGA	2	6	183563	183568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213917
4375	NC_017249	GCC	2	6	183570	183575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213917
4376	NC_017249	TCG	2	6	183640	183645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213917
4377	NC_017249	CTT	2	6	183675	183680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213917
4378	NC_017249	GGT	2	6	183681	183686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213917
4379	NC_017249	AGC	2	6	183770	183775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213918
4380	NC_017249	TCG	2	6	183811	183816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213918
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4383	NC_017249	GGCGA	2	10	183954	183963	20 %	0 %	60 %	20 %	384213918
4384	NC_017249	TTG	2	6	183970	183975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213918
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4389	NC_017249	AGC	2	6	184210	184215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213918
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4392	NC_017249	TCG	2	6	184285	184290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213918
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4395	NC_017249	GC	3	6	184449	184454	0 %	0 %	50 %	50 %	384213918
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4399	NC_017249	TCC	2	6	184725	184730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4400	NC_017249	TCAA	2	8	184831	184838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4401	NC_017249	CGGG	2	8	184916	184923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4402	NC_017249	GCCT	2	8	184931	184938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4403	NC_017249	TGGC	2	8	185062	185069	0 %	25 %	50 %	25 %	384213919
4404	NC_017249	GCT	2	6	185094	185099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213919
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4409	NC_017249	TGC	2	6	185198	185203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213919
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4423	NC_017249	TAC	2	6	185620	185625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213919
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4426	NC_017249	GGA	2	6	185677	185682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4427	NC_017249	AG	3	6	185695	185700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4428	NC_017249	CGC	2	6	185714	185719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213920
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4435	NC_017249	CGAT	2	8	186083	186090	25 %	25 %	25 %	25 %	384213920
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4442	NC_017249	AGG	2	6	186368	186373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213920
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4446	NC_017249	CGGCG	3	15	186478	186492	0 %	0 %	60 %	40 %	384213920
4447	NC_017249	GGC	2	6	186493	186498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213920
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4453	NC_017249	CAGG	2	8	186687	186694	25 %	0 %	50 %	25 %	384213920
4454	NC_017249	GC	3	6	186755	186760	0 %	0 %	50 %	50 %	384213920
4455	NC_017249	CGG	2	6	186867	186872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213920
4456	NC_017249	ATT	2	6	186907	186912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384213920
4457	NC_017249	GTGCA	2	10	186971	186980	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4458	NC_017249	GCG	2	6	187080	187085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213921
4459	NC_017249	ATC	2	6	187091	187096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213921
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4461	NC_017249	GAGC	2	8	187226	187233	25 %	0 %	50 %	25 %	384213921
4462	NC_017249	CG	3	6	187237	187242	0 %	0 %	50 %	50 %	384213921
4463	NC_017249	TCG	2	6	187281	187286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213921
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4467	NC_017249	GC	3	6	187377	187382	0 %	0 %	50 %	50 %	384213921
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4471	NC_017249	CG	3	6	187557	187562	0 %	0 %	50 %	50 %	384213921
4472	NC_017249	TGG	2	6	187563	187568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213921
4473	NC_017249	CGC	2	6	187591	187596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213921
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4478	NC_017249	CGG	2	6	187815	187820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213921
4479	NC_017249	GC	3	6	187869	187874	0 %	0 %	50 %	50 %	384213921
4480	NC_017249	AAG	2	6	187880	187885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213921
4481	NC_017249	TTC	2	6	187919	187924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213921
4482	NC_017249	CGC	2	6	187981	187986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213921
4483	NC_017249	GC	3	6	188015	188020	0 %	0 %	50 %	50 %	384213921
4484	NC_017249	CGC	2	6	188128	188133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4485	NC_017249	CG	3	6	188178	188183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4486	NC_017249	CG	3	6	188202	188207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4487	NC_017249	CGA	2	6	188219	188224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4488	NC_017249	CGC	2	6	188331	188336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213922
4489	NC_017249	GCC	2	6	188344	188349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213922
4490	NC_017249	TGC	2	6	188396	188401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213922
4491	NC_017249	CTT	2	6	188451	188456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213922
4492	NC_017249	ACGC	2	8	188484	188491	25 %	0 %	25 %	50 %	384213922
4493	NC_017249	ACGGC	2	10	188540	188549	20 %	0 %	40 %	40 %	384213922
4494	NC_017249	CGC	2	6	188669	188674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213922
4495	NC_017249	CGA	2	6	188679	188684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213922
4496	NC_017249	GAT	2	6	188754	188759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213922
4497	NC_017249	CTC	2	6	188761	188766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213922
4498	NC_017249	ATC	2	6	188780	188785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213922
4499	NC_017249	CAA	2	6	188790	188795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213922
4500	NC_017249	TGC	2	6	188819	188824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213922

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