MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017249	AGG	2	6	644651	644656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214344
16003	NC_017249	CCT	2	6	644685	644690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214344
16004	NC_017249	CGATG	2	10	644703	644712	20 %	20 %	40 %	20 %	384214344
16005	NC_017249	CAT	2	6	644772	644777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214344
16006	NC_017249	CGGTCG	2	12	644792	644803	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384214344
16007	NC_017249	CCA	2	6	644810	644815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214344
16008	NC_017249	CTG	2	6	644836	644841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16009	NC_017249	GC	3	6	644842	644847	0 %	0 %	50 %	50 %	384214344
16010	NC_017249	CGC	2	6	644852	644857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214344
16011	NC_017249	CAC	2	6	644877	644882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214344
16012	NC_017249	CAT	2	6	644925	644930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214344
16013	NC_017249	AGA	2	6	644933	644938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214344
16014	NC_017249	GCT	3	9	644967	644975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16015	NC_017249	GGCC	2	8	644997	645004	0 %	0 %	50 %	50 %	384214344
16016	NC_017249	GCC	3	9	645002	645010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214344
16017	NC_017249	GC	4	8	645015	645022	0 %	0 %	50 %	50 %	384214344
16018	NC_017249	TCG	2	6	645095	645100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16019	NC_017249	TGC	2	6	645113	645118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16020	NC_017249	CG	3	6	645134	645139	0 %	0 %	50 %	50 %	384214344
16021	NC_017249	CTT	2	6	645168	645173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214344
16022	NC_017249	CGA	2	6	645198	645203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16023	NC_017249	GGC	2	6	645204	645209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214344
16024	NC_017249	TGT	2	6	645296	645301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214344
16025	NC_017249	GCCACC	2	12	645313	645324	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384214344
16026	NC_017249	GCGATC	2	12	645325	645336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384214344
16027	NC_017249	ACA	2	6	645368	645373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384214344
16028	NC_017249	CG	3	6	645391	645396	0 %	0 %	50 %	50 %	384214344
16029	NC_017249	GAA	2	6	645408	645413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214344
16030	NC_017249	GC	3	6	645486	645491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16031	NC_017249	CGT	2	6	645498	645503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_017249	CCA	2	6	645506	645511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_017249	ATG	2	6	645531	645536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_017249	CAGCG	2	10	645609	645618	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16035	NC_017249	TCG	2	6	645660	645665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_017249	CTC	2	6	645672	645677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16037	NC_017249	GCCGC	2	10	645715	645724	0 %	0 %	40 %	60 %	384214345
16038	NC_017249	TCC	2	6	645816	645821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214345
16039	NC_017249	GTG	2	6	645857	645862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214345
16040	NC_017249	GCC	2	6	645863	645868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214345
16041	NC_017249	TGCG	2	8	645882	645889	0 %	25 %	50 %	25 %	384214345
16042	NC_017249	TCG	2	6	645898	645903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214345
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16049	NC_017249	CGA	2	6	646087	646092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214345
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16052	NC_017249	GGC	2	6	646140	646145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214345
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16055	NC_017249	CGCA	2	8	646208	646215	25 %	0 %	25 %	50 %	384214345
16056	NC_017249	CAG	2	6	646277	646282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214345
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16061	NC_017249	GCC	2	6	646450	646455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214345
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16063	NC_017249	GCTC	2	8	646600	646607	0 %	25 %	25 %	50 %	384214345
16064	NC_017249	GCC	2	6	646622	646627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214345
16065	NC_017249	GCC	2	6	646673	646678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214345
16066	NC_017249	GTGC	2	8	646683	646690	0 %	25 %	50 %	25 %	384214345
16067	NC_017249	TCG	2	6	646698	646703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214345
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16073	NC_017249	CGA	2	6	646897	646902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214345
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16085	NC_017249	GC	4	8	647272	647279	0 %	0 %	50 %	50 %	384214345
16086	NC_017249	CGG	2	6	647326	647331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214345
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16090	NC_017249	GC	3	6	647495	647500	0 %	0 %	50 %	50 %	384214345
16091	NC_017249	GC	3	6	647512	647517	0 %	0 %	50 %	50 %	384214345
16092	NC_017249	TGG	2	6	647550	647555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214345
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16095	NC_017249	GC	5	10	647597	647606	0 %	0 %	50 %	50 %	384214345
16096	NC_017249	CTTC	2	8	647614	647621	0 %	50 %	0 %	50 %	384214345
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16102	NC_017249	CGA	2	6	647975	647980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_017249	GT	3	6	648095	648100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_017249	GAT	3	9	648146	648154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_017249	GGC	2	6	648175	648180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214346
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16107	NC_017249	GCC	2	6	648202	648207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214346
16108	NC_017249	CGA	2	6	648216	648221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214346
16109	NC_017249	CGGC	2	8	648279	648286	0 %	0 %	50 %	50 %	384214346
16110	NC_017249	CCG	2	6	648314	648319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214346
16111	NC_017249	CCGAG	2	10	648384	648393	20 %	0 %	40 %	40 %	384214346
16112	NC_017249	CGT	2	6	648396	648401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214346
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16116	NC_017249	GCCG	2	8	648493	648500	0 %	0 %	50 %	50 %	384214346
16117	NC_017249	CCGAT	2	10	648561	648570	20 %	20 %	20 %	40 %	384214346
16118	NC_017249	CGC	2	6	648573	648578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214346
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16120	NC_017249	AAC	2	6	648607	648612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384214346
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16122	NC_017249	CCG	2	6	648725	648730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16168	NC_017249	TCTT	2	8	650335	650342	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16169	NC_017249	TCA	2	6	650436	650441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16196	NC_017249	TTCG	2	8	651672	651679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16197	NC_017249	GCCCT	2	10	651732	651741	0 %	20 %	20 %	60 %	384214351
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16227	NC_017249	CGT	3	9	652966	652974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214351
16228	NC_017249	TGGTCG	2	12	653031	653042	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384214352
16229	NC_017249	GGCG	2	8	653092	653099	0 %	0 %	75 %	25 %	384214352
16230	NC_017249	CCGC	2	8	653103	653110	0 %	0 %	25 %	75 %	384214352
16231	NC_017249	GCT	2	6	653112	653117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214352
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16233	NC_017249	GCTG	2	8	653157	653164	0 %	25 %	50 %	25 %	384214352
16234	NC_017249	GCA	2	6	653298	653303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214352
16235	NC_017249	GC	3	6	653342	653347	0 %	0 %	50 %	50 %	384214352
16236	NC_017249	CGC	2	6	653355	653360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214352
16237	NC_017249	ACCG	2	8	653372	653379	25 %	0 %	25 %	50 %	384214352
16238	NC_017249	CGC	3	9	653395	653403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214352
16239	NC_017249	GC	3	6	653405	653410	0 %	0 %	50 %	50 %	384214352
16240	NC_017249	CGA	3	9	653436	653444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214352
16241	NC_017249	TGC	2	6	653498	653503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214352
16242	NC_017249	GCG	2	6	653504	653509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214352
16243	NC_017249	GCC	2	6	653515	653520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214352
16244	NC_017249	GC	3	6	653521	653526	0 %	0 %	50 %	50 %	384214352
16245	NC_017249	CGA	2	6	653532	653537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214352
16246	NC_017249	CTT	2	6	653551	653556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214352
16247	NC_017249	GTCG	2	8	653593	653600	0 %	25 %	50 %	25 %	384214352
16248	NC_017249	GGT	2	6	653626	653631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214352
16249	NC_017249	AGCGCG	2	12	653666	653677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384214352
16250	NC_017249	GAT	2	6	653777	653782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214353
16251	NC_017249	CGC	2	6	653794	653799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214353
16252	NC_017249	GATCG	2	10	653810	653819	20 %	20 %	40 %	20 %	384214353
16253	NC_017249	GC	3	6	653825	653830	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16254	NC_017249	AGC	2	6	653859	653864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214353
16255	NC_017249	CGT	2	6	653896	653901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214353
16256	NC_017249	CG	3	6	653930	653935	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16257	NC_017249	CAC	2	6	653936	653941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214353
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16259	NC_017249	GC	3	6	654004	654009	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16260	NC_017249	GAT	2	6	654011	654016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214353
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16263	NC_017249	CGGCG	2	10	654124	654133	0 %	0 %	60 %	40 %	384214353
16264	NC_017249	GTT	2	6	654161	654166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214353
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16268	NC_017249	CGC	2	6	654373	654378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214353
16269	NC_017249	CG	3	6	654461	654466	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16270	NC_017249	GGCC	2	8	654502	654509	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16271	NC_017249	TGC	2	6	654523	654528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214353
16272	NC_017249	CGA	2	6	654529	654534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214353
16273	NC_017249	CCG	2	6	654540	654545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214353
16274	NC_017249	TTG	2	6	654567	654572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214353
16275	NC_017249	GCT	2	6	654625	654630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214353
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16281	NC_017249	GCG	2	6	654738	654743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214353
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16291	NC_017249	CCA	2	6	655012	655017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214353
16292	NC_017249	CG	3	6	655033	655038	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16293	NC_017249	GAC	2	6	655049	655054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214353
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16295	NC_017249	GC	3	6	655088	655093	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
16296	NC_017249	CCG	2	6	655168	655173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214353
16297	NC_017249	GC	5	10	655235	655244	0 %	0 %	50 %	50 %	384214353
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16303	NC_017249	GCC	2	6	655443	655448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214354
16304	NC_017249	TTTC	2	8	655535	655542	0 %	75 %	0 %	25 %	384214354
16305	NC_017249	GCC	2	6	655608	655613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214354
16306	NC_017249	TTC	2	6	655639	655644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214354
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16308	NC_017249	CG	4	8	655829	655836	0 %	0 %	50 %	50 %	384214354
16309	NC_017249	TCTGGG	2	12	655850	655861	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384214354
16310	NC_017249	CTG	2	6	655870	655875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214354
16311	NC_017249	CGG	2	6	655879	655884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214354
16312	NC_017249	GCT	2	6	655893	655898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214354
16313	NC_017249	GCC	2	6	655906	655911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214354
16314	NC_017249	TTC	2	6	655969	655974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214354
16315	NC_017249	GGGC	2	8	656018	656025	0 %	0 %	75 %	25 %	384214354
16316	NC_017249	TTG	2	6	656032	656037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214354
16317	NC_017249	CGC	2	6	656066	656071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214354
16318	NC_017249	TGCG	2	8	656102	656109	0 %	25 %	50 %	25 %	384214354
16319	NC_017249	CGTT	2	8	656310	656317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16320	NC_017249	GC	3	6	656326	656331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16321	NC_017249	GTG	2	6	656356	656361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16322	NC_017249	GCA	2	6	656386	656391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16324	NC_017249	TGA	2	6	656571	656576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16325	NC_017249	GC	3	6	656621	656626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16326	NC_017249	CGC	2	6	656713	656718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214355
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16329	NC_017249	TGA	2	6	656796	656801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214355
16330	NC_017249	CGA	2	6	656811	656816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214355
16331	NC_017249	CAG	2	6	656818	656823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214355
16332	NC_017249	GCG	2	6	656897	656902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214355
16333	NC_017249	GTC	2	6	656929	656934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214355
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16341	NC_017249	CGG	2	6	657208	657213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214355
16342	NC_017249	TCA	2	6	657231	657236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214355
16343	NC_017249	GAC	2	6	657280	657285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214355
16344	NC_017249	GGAT	2	8	657296	657303	25 %	25 %	50 %	0 %	384214355
16345	NC_017249	CGG	2	6	657346	657351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214355
16346	NC_017249	GCA	3	9	657360	657368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214355
16347	NC_017249	TCG	2	6	657431	657436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214355
16348	NC_017249	GCC	2	6	657648	657653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214356
16349	NC_017249	GCG	2	6	657676	657681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214356
16350	NC_017249	AGCC	2	8	657738	657745	25 %	0 %	25 %	50 %	384214356
16351	NC_017249	GCG	2	6	657750	657755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214356
16352	NC_017249	GAT	2	6	657758	657763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214356
16353	NC_017249	GCT	3	9	657766	657774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214356
16354	NC_017249	GC	3	6	657776	657781	0 %	0 %	50 %	50 %	384214356
16355	NC_017249	GGC	2	6	657794	657799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214356
16356	NC_017249	CG	3	6	657812	657817	0 %	0 %	50 %	50 %	384214356
16357	NC_017249	CGA	2	6	657829	657834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214356
16358	NC_017249	GCG	3	9	657848	657856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214356
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16482	NC_017249	GAT	2	6	662106	662111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214360
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16485	NC_017249	GC	4	8	662245	662252	0 %	0 %	50 %	50 %	384214360
16486	NC_017249	GC	3	6	662265	662270	0 %	0 %	50 %	50 %	384214360
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