MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017249	GATC	2	8	625828	625835	25 %	25 %	25 %	25 %	384214322
15502	NC_017249	TTG	2	6	625836	625841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214322
15503	NC_017249	GCC	2	6	625859	625864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214322
15504	NC_017249	GC	3	6	625923	625928	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15505	NC_017249	TCG	2	6	626010	626015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15506	NC_017249	CCG	2	6	626029	626034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214322
15507	NC_017249	ATCGAG	2	12	626060	626071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384214322
15508	NC_017249	TCACG	2	10	626083	626092	20 %	20 %	20 %	40 %	384214322
15509	NC_017249	GTG	2	6	626094	626099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214322
15510	NC_017249	TGAT	2	8	626142	626149	25 %	50 %	25 %	0 %	384214322
15511	NC_017249	ACC	2	6	626190	626195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214322
15512	NC_017249	CCG	2	6	626278	626283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214322
15513	NC_017249	CGGC	2	8	626296	626303	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15514	NC_017249	TCG	2	6	626313	626318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15515	NC_017249	GAT	2	6	626357	626362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214322
15516	NC_017249	CG	5	10	626377	626386	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15517	NC_017249	GGC	2	6	626422	626427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214322
15518	NC_017249	TCG	2	6	626457	626462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15519	NC_017249	CTTCGG	2	12	626467	626478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15520	NC_017249	CG	3	6	626504	626509	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15521	NC_017249	GAG	2	6	626567	626572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214322
15522	NC_017249	GCC	2	6	626574	626579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214322
15523	NC_017249	CG	3	6	626585	626590	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15524	NC_017249	GCC	2	6	626591	626596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214322
15525	NC_017249	GGCC	2	8	626636	626643	0 %	0 %	50 %	50 %	384214322
15526	NC_017249	CGT	2	6	626665	626670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
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15529	NC_017249	GGCT	2	8	626727	626734	0 %	25 %	50 %	25 %	384214322
15530	NC_017249	CGT	2	6	626744	626749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15531	NC_017249	CAC	2	6	626783	626788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214322
15532	NC_017249	GAC	2	6	626814	626819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15533	NC_017249	TGGTC	2	10	626830	626839	0 %	40 %	40 %	20 %	384214322
15534	NC_017249	CG	3	6	626895	626900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15535	NC_017249	GCC	2	6	626903	626908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15536	NC_017249	TGC	2	6	626917	626922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15537	NC_017249	GCA	2	6	626933	626938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_017249	AT	3	6	626958	626963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_017249	GCA	2	6	626967	626972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15540	NC_017249	TGC	2	6	626976	626981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15541	NC_017249	AGC	2	6	626985	626990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15542	NC_017249	AT	3	6	627036	627041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_017249	TGC	2	6	627086	627091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15544	NC_017249	CTT	2	6	627093	627098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_017249	GCA	2	6	627101	627106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_017249	TGC	2	6	627154	627159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_017249	GAA	2	6	627185	627190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214323
15548	NC_017249	CGG	2	6	627270	627275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214323
15549	NC_017249	TCT	2	6	627286	627291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214323
15550	NC_017249	TGA	2	6	627310	627315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214323
15551	NC_017249	TCC	2	6	627318	627323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214323
15552	NC_017249	ATG	2	6	627477	627482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214323
15553	NC_017249	GCC	2	6	627491	627496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214323
15554	NC_017249	CTC	2	6	627497	627502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214323
15555	NC_017249	GCA	2	6	627513	627518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214323
15556	NC_017249	GAA	2	6	627521	627526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214323
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15558	NC_017249	CAC	2	6	627590	627595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214323
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15563	NC_017249	CGA	2	6	627734	627739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214323
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15565	NC_017249	TCG	2	6	627792	627797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214323
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15569	NC_017249	GC	4	8	627901	627908	0 %	0 %	50 %	50 %	384214323
15570	NC_017249	CGA	2	6	627928	627933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214323
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15580	NC_017249	GCT	2	6	628300	628305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214323
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15582	NC_017249	ACGAG	2	10	628375	628384	40 %	0 %	40 %	20 %	384214323
15583	NC_017249	CGGC	2	8	628387	628394	0 %	0 %	50 %	50 %	384214323
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15585	NC_017249	GAG	2	6	628470	628475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_017249	AAGGT	2	10	628497	628506	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_017249	TGGG	2	8	628601	628608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_017249	ATG	2	6	628702	628707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214324
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15591	NC_017249	A	7	7	628808	628814	100 %	0 %	0 %	0 %	384214324
15592	NC_017249	CAGC	2	8	628860	628867	25 %	0 %	25 %	50 %	384214324
15593	NC_017249	TGA	2	6	628937	628942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214324
15594	NC_017249	AGC	2	6	628951	628956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214324
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15596	NC_017249	TCCG	2	8	629279	629286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15597	NC_017249	CG	3	6	629295	629300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_017249	CATC	2	8	629309	629316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15599	NC_017249	CGG	2	6	629336	629341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_017249	GTG	2	6	629461	629466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_017249	GAA	2	6	629468	629473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_017249	ATT	2	6	629590	629595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384214325
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15604	NC_017249	CG	4	8	629645	629652	0 %	0 %	50 %	50 %	384214325
15605	NC_017249	AGC	2	6	629719	629724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214325
15606	NC_017249	GAG	2	6	629748	629753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214325
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15615	NC_017249	TGG	2	6	630157	630162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214325
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15617	NC_017249	GAG	2	6	630273	630278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214325
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15619	NC_017249	GCT	2	6	630320	630325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214325
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15621	NC_017249	CCG	2	6	630355	630360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214325
15622	NC_017249	TC	3	6	630425	630430	0 %	50 %	0 %	50 %	384214326
15623	NC_017249	GCG	2	6	630435	630440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214326
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15626	NC_017249	TGC	2	6	630483	630488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214326
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15650	NC_017249	GCG	2	6	631641	631646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214327
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15682	NC_017249	CGG	2	6	632916	632921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15683	NC_017249	GCC	2	6	632936	632941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15684	NC_017249	CCT	2	6	633013	633018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15685	NC_017249	CG	3	6	633027	633032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15686	NC_017249	CTGTG	2	10	633103	633112	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15687	NC_017249	CG	3	6	633167	633172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15688	NC_017249	GATT	2	8	633227	633234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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15723	NC_017249	CCGAA	2	10	634306	634315	40 %	0 %	20 %	40 %	384214331
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15743	NC_017249	CGAT	2	8	635083	635090	25 %	25 %	25 %	25 %	384214331
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15749	NC_017249	GC	4	8	635274	635281	0 %	0 %	50 %	50 %	384214331
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15845	NC_017249	GC	5	10	638368	638377	0 %	0 %	50 %	50 %	384214334
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15852	NC_017249	GCT	2	6	638620	638625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214334
15853	NC_017249	GC	3	6	638661	638666	0 %	0 %	50 %	50 %	384214334
15854	NC_017249	CGA	2	6	638683	638688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214334
15855	NC_017249	G	6	6	638719	638724	0 %	0 %	100 %	0 %	384214334
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15857	NC_017249	GGAT	2	8	638833	638840	25 %	25 %	50 %	0 %	384214335
15858	NC_017249	AAGGC	2	10	638899	638908	40 %	0 %	40 %	20 %	384214335
15859	NC_017249	GCA	2	6	638933	638938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214335
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15861	NC_017249	CAT	2	6	638961	638966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214335
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