MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017249	TCC	2	6	605627	605632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214305
15003	NC_017249	TCCG	2	8	605647	605654	0 %	25 %	25 %	50 %	384214305
15004	NC_017249	GGCG	2	8	605677	605684	0 %	0 %	75 %	25 %	384214305
15005	NC_017249	CGCT	2	8	605726	605733	0 %	25 %	25 %	50 %	384214305
15006	NC_017249	TGC	2	6	605742	605747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214305
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15010	NC_017249	CGA	2	6	605860	605865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214305
15011	NC_017249	GC	3	6	605883	605888	0 %	0 %	50 %	50 %	384214305
15012	NC_017249	GC	3	6	605894	605899	0 %	0 %	50 %	50 %	384214305
15013	NC_017249	CTG	2	6	605978	605983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214305
15014	NC_017249	CGAC	2	8	605997	606004	25 %	0 %	25 %	50 %	384214305
15015	NC_017249	CGG	2	6	606043	606048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214305
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15018	NC_017249	CGC	2	6	606078	606083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214305
15019	NC_017249	CAC	2	6	606100	606105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214305
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15031	NC_017249	GTCG	2	8	606622	606629	0 %	25 %	50 %	25 %	384214305
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15130	NC_017249	ATGC	2	8	610323	610330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15131	NC_017249	G	6	6	610356	610361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15132	NC_017249	TTA	2	6	610368	610373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_017249	TTG	2	6	610374	610379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15138	NC_017249	GC	3	6	610607	610612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15172	NC_017249	GCC	2	6	611928	611933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15187	NC_017249	TTG	2	6	612654	612659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15188	NC_017249	AAGA	2	8	612688	612695	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15189	NC_017249	CG	5	10	612877	612886	0 %	0 %	50 %	50 %	384214313
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15243	NC_017249	GCA	2	6	614770	614775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214314
15244	NC_017249	GCA	2	6	614791	614796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214314
15245	NC_017249	GTC	2	6	614892	614897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214314
15246	NC_017249	CCG	2	6	614927	614932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214314
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15260	NC_017249	CCG	2	6	615589	615594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15261	NC_017249	CCG	2	6	615639	615644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15262	NC_017249	GCC	2	6	615731	615736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214315
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15310	NC_017249	GAA	3	9	617584	617592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214315
15311	NC_017249	CGA	2	6	617605	617610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214315
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15313	NC_017249	CCCG	2	8	617665	617672	0 %	0 %	25 %	75 %	384214315
15314	NC_017249	CGA	2	6	617692	617697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214315
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15333	NC_017249	GTC	2	6	618663	618668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214316
15334	NC_017249	ACG	2	6	618693	618698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214316
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15336	NC_017249	GCC	2	6	618780	618785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214316
15337	NC_017249	CTCGC	2	10	618811	618820	0 %	20 %	20 %	60 %	384214316
15338	NC_017249	TTC	2	6	618825	618830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214316
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15340	NC_017249	CGG	2	6	618875	618880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15341	NC_017249	ATT	2	6	618896	618901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15342	NC_017249	CCGA	2	8	619011	619018	25 %	0 %	25 %	50 %	384214317
15343	NC_017249	GC	3	6	619059	619064	0 %	0 %	50 %	50 %	384214317
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15347	NC_017249	TCG	2	6	619160	619165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214317
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15349	NC_017249	CGG	2	6	619191	619196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214317
15350	NC_017249	CGC	2	6	619198	619203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214317
15351	NC_017249	TCCGCG	2	12	619208	619219	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384214317
15352	NC_017249	GCT	2	6	619367	619372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214317
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15354	NC_017249	CG	3	6	619453	619458	0 %	0 %	50 %	50 %	384214317
15355	NC_017249	CGG	2	6	619476	619481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214317
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15357	NC_017249	TCG	2	6	619607	619612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214317
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15359	NC_017249	TCG	2	6	619640	619645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214317
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15362	NC_017249	CCG	2	6	619769	619774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214317
15363	NC_017249	GGC	2	6	619783	619788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214317
15364	NC_017249	CGC	2	6	619860	619865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214317
15365	NC_017249	ATC	2	6	619867	619872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214317
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15373	NC_017249	CGA	2	6	620051	620056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15374	NC_017249	GCTTC	2	10	620094	620103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15375	NC_017249	GA	3	6	620121	620126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15376	NC_017249	CG	3	6	620183	620188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15377	NC_017249	GAA	2	6	620266	620271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15378	NC_017249	GC	3	6	620315	620320	0 %	0 %	50 %	50 %	384214318
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15482	NC_017249	CT	3	6	624887	624892	0 %	50 %	0 %	50 %	384214321
15483	NC_017249	GTT	2	6	624962	624967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15484	NC_017249	AAC	2	6	625014	625019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15485	NC_017249	GCT	2	6	625050	625055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15486	NC_017249	GA	4	8	625087	625094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15487	NC_017249	GAGCG	2	10	625154	625163	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15488	NC_017249	CCG	2	6	625170	625175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15489	NC_017249	TCG	2	6	625235	625240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15490	NC_017249	CTC	2	6	625247	625252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15491	NC_017249	GCC	2	6	625275	625280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15492	NC_017249	GAA	2	6	625481	625486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15493	NC_017249	CAG	2	6	625556	625561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214322
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15496	NC_017249	GTC	2	6	625707	625712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214322
15497	NC_017249	CGG	2	6	625723	625728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214322
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15499	NC_017249	CCCGA	2	10	625800	625809	20 %	0 %	20 %	60 %	384214322
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