MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017249	CGC	2	6	508564	508569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214210
12502	NC_017249	CGC	2	6	508579	508584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214210
12503	NC_017249	GCC	2	6	508614	508619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214210
12504	NC_017249	CG	3	6	508680	508685	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12505	NC_017249	GCT	2	6	508711	508716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12506	NC_017249	GAG	4	12	508724	508735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214210
12507	NC_017249	CGG	2	6	508738	508743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12508	NC_017249	TGC	2	6	508767	508772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12509	NC_017249	GGCC	2	8	508789	508796	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12510	NC_017249	ACG	2	6	508808	508813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12511	NC_017249	TTG	2	6	508836	508841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384214210
12512	NC_017249	GC	3	6	508866	508871	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12513	NC_017249	GCA	2	6	508887	508892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12514	NC_017249	GGC	2	6	508915	508920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12515	NC_017249	GGCT	2	8	508952	508959	0 %	25 %	50 %	25 %	384214210
12516	NC_017249	GC	3	6	508998	509003	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12517	NC_017249	TGA	2	6	509019	509024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214210
12518	NC_017249	GC	3	6	509044	509049	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12519	NC_017249	GCG	2	6	509082	509087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12520	NC_017249	TC	3	6	509122	509127	0 %	50 %	0 %	50 %	384214210
12521	NC_017249	CGA	2	6	509137	509142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12522	NC_017249	GGT	2	6	509170	509175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214210
12523	NC_017249	CTG	2	6	509195	509200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12524	NC_017249	CCGGCA	2	12	509214	509225	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384214210
12525	NC_017249	GC	3	6	509239	509244	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12526	NC_017249	GCG	2	6	509268	509273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12527	NC_017249	TGC	2	6	509310	509315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12528	NC_017249	CG	3	6	509351	509356	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12529	NC_017249	GAC	2	6	509378	509383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12530	NC_017249	GGA	2	6	509392	509397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214210
12531	NC_017249	ACC	2	6	509430	509435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214210
12532	NC_017249	GCG	2	6	509484	509489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12533	NC_017249	AGC	2	6	509493	509498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12534	NC_017249	CG	3	6	509509	509514	0 %	0 %	50 %	50 %	384214210
12535	NC_017249	GCT	3	9	509515	509523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12536	NC_017249	TCG	2	6	509538	509543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12537	NC_017249	CGA	2	6	509569	509574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
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12539	NC_017249	CGA	2	6	509608	509613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12540	NC_017249	CGC	2	6	509693	509698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214210
12541	NC_017249	GCG	2	6	509703	509708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12542	NC_017249	GCAAGC	2	12	509748	509759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214210
12543	NC_017249	GGC	2	6	509803	509808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214210
12544	NC_017249	TGA	2	6	509810	509815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214210
12545	NC_017249	GTC	2	6	509819	509824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_017249	GC	3	6	509830	509835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12547	NC_017249	CTC	2	6	509909	509914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12548	NC_017249	TATGGG	2	12	509917	509928	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_017249	GAC	2	6	509945	509950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_017249	ATGC	2	8	509982	509989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12551	NC_017249	GCC	2	6	509990	509995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12552	NC_017249	ATC	2	6	510084	510089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214211
12553	NC_017249	CGG	3	9	510161	510169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214211
12554	NC_017249	GCGCG	2	10	510233	510242	0 %	0 %	60 %	40 %	384214211
12555	NC_017249	CGA	2	6	510266	510271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214211
12556	NC_017249	GGC	2	6	510303	510308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214211
12557	NC_017249	TCG	2	6	510313	510318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214211
12558	NC_017249	GCA	2	6	510359	510364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214211
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12560	NC_017249	CGC	2	6	510437	510442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214211
12561	NC_017249	GAC	2	6	510449	510454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214211
12562	NC_017249	TGA	2	6	510502	510507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214211
12563	NC_017249	GCG	3	9	510514	510522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214211
12564	NC_017249	CCAC	2	8	510535	510542	25 %	0 %	0 %	75 %	384214211
12565	NC_017249	GTC	2	6	510543	510548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214211
12566	NC_017249	CTT	2	6	510683	510688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384214211
12567	NC_017249	CGC	2	6	510697	510702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214211
12568	NC_017249	CG	4	8	510715	510722	0 %	0 %	50 %	50 %	384214211
12569	NC_017249	GCA	2	6	510755	510760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214211
12570	NC_017249	TGG	2	6	510778	510783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214211
12571	NC_017249	CG	3	6	510784	510789	0 %	0 %	50 %	50 %	384214211
12572	NC_017249	CG	3	6	510800	510805	0 %	0 %	50 %	50 %	384214211
12573	NC_017249	CAA	2	6	510847	510852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12574	NC_017249	GAT	2	6	510863	510868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214212
12575	NC_017249	GC	3	6	510902	510907	0 %	0 %	50 %	50 %	384214212
12576	NC_017249	CGG	2	6	510967	510972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214212
12577	NC_017249	GCC	2	6	511125	511130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214212
12578	NC_017249	GGCG	2	8	511131	511138	0 %	0 %	75 %	25 %	384214212
12579	NC_017249	GC	3	6	511147	511152	0 %	0 %	50 %	50 %	384214212
12580	NC_017249	CCGC	2	8	511160	511167	0 %	0 %	25 %	75 %	384214212
12581	NC_017249	TAT	2	6	511182	511187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384214212
12582	NC_017249	ACA	2	6	511216	511221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384214212
12583	NC_017249	GC	3	6	511250	511255	0 %	0 %	50 %	50 %	384214212
12584	NC_017249	CACGA	2	10	511263	511272	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12585	NC_017249	CAT	2	6	511291	511296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_017249	GAT	2	6	511325	511330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214213
12587	NC_017249	GCCGAT	2	12	511331	511342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384214213
12588	NC_017249	CCCG	2	8	511346	511353	0 %	0 %	25 %	75 %	384214213
12589	NC_017249	CCG	2	6	511359	511364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214213
12590	NC_017249	GCC	3	9	511388	511396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214213
12591	NC_017249	CCG	2	6	511404	511409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214213
12592	NC_017249	CGC	2	6	511432	511437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214213
12593	NC_017249	AGA	2	6	511493	511498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214213
12594	NC_017249	CG	3	6	511507	511512	0 %	0 %	50 %	50 %	384214213
12595	NC_017249	AAAT	2	8	511661	511668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017249	CGCC	2	8	511685	511692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12597	NC_017249	TTCGT	2	10	511774	511783	0 %	60 %	20 %	20 %	384214214
12598	NC_017249	GCT	2	6	511784	511789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12599	NC_017249	ACG	2	6	511794	511799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12600	NC_017249	CGCAT	2	10	511829	511838	20 %	20 %	20 %	40 %	384214214
12601	NC_017249	GC	3	6	511846	511851	0 %	0 %	50 %	50 %	384214214
12602	NC_017249	CGC	3	9	511849	511857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12603	NC_017249	ACC	2	6	511883	511888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214214
12604	NC_017249	AGC	2	6	511906	511911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12605	NC_017249	GAAG	2	8	511916	511923	50 %	0 %	50 %	0 %	384214214
12606	NC_017249	CCG	2	6	511935	511940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12607	NC_017249	GCA	2	6	511977	511982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12608	NC_017249	CCGC	2	8	511983	511990	0 %	0 %	25 %	75 %	384214214
12609	NC_017249	GC	3	6	511998	512003	0 %	0 %	50 %	50 %	384214214
12610	NC_017249	GCC	3	9	512012	512020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12611	NC_017249	TCC	2	6	512039	512044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214214
12612	NC_017249	CGC	4	12	512047	512058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12613	NC_017249	ACC	3	9	512084	512092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214214
12614	NC_017249	CCT	2	6	512094	512099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384214214
12615	NC_017249	CGC	3	9	512131	512139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12616	NC_017249	CCG	2	6	512145	512150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12617	NC_017249	AGC	2	6	512161	512166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12618	NC_017249	CGC	2	6	512170	512175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12619	NC_017249	CAG	2	6	512193	512198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
12620	NC_017249	TGCGCC	2	12	512201	512212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384214214
12621	NC_017249	CCG	2	6	512217	512222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
12622	NC_017249	GCA	3	9	512234	512242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214214
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12625	NC_017249	CCG	2	6	512298	512303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214214
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12630	NC_017249	ACCG	2	8	512411	512418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12730	NC_017249	CGG	2	6	516048	516053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214217
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12981	NC_017249	CAA	2	6	526747	526752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12982	NC_017249	CG	3	6	526802	526807	0 %	0 %	50 %	50 %	384214227
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12987	NC_017249	GCG	2	6	526971	526976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214227
12988	NC_017249	CGG	2	6	527066	527071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214227
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