MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017249	CG	3	6	449186	449191	0 %	0 %	50 %	50 %	384214149
11003	NC_017249	GCC	2	6	449205	449210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214149
11004	NC_017249	CGGC	2	8	449258	449265	0 %	0 %	50 %	50 %	384214149
11005	NC_017249	GC	3	6	449313	449318	0 %	0 %	50 %	50 %	384214149
11006	NC_017249	GCA	2	6	449327	449332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214149
11007	NC_017249	TGA	2	6	449357	449362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214149
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11009	NC_017249	TCG	2	6	449404	449409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214149
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11012	NC_017249	ATC	2	6	449479	449484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214149
11013	NC_017249	TCG	2	6	449512	449517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214149
11014	NC_017249	AGCAG	2	10	449519	449528	40 %	0 %	40 %	20 %	384214149
11015	NC_017249	CGC	2	6	449588	449593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214149
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11017	NC_017249	GTGCT	2	10	449680	449689	0 %	40 %	40 %	20 %	384214149
11018	NC_017249	GAA	2	6	449691	449696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384214149
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11020	NC_017249	GCA	2	6	449872	449877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214149
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11022	NC_017249	CG	3	6	450055	450060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11023	NC_017249	ATCG	2	8	450114	450121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11024	NC_017249	CAG	2	6	450142	450147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_017249	AGCT	2	8	450185	450192	25 %	25 %	25 %	25 %	384214150
11026	NC_017249	CA	3	6	450197	450202	50 %	0 %	0 %	50 %	384214150
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11029	NC_017249	CGT	2	6	450344	450349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214150
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11038	NC_017249	CG	3	6	450849	450854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_017249	GCG	2	6	450906	450911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214151
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11062	NC_017249	TCGG	2	8	452017	452024	0 %	25 %	50 %	25 %	384214152
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11121	NC_017249	CG	4	8	454013	454020	0 %	0 %	50 %	50 %	384214153
11122	NC_017249	GC	3	6	454025	454030	0 %	0 %	50 %	50 %	384214153
11123	NC_017249	ACC	2	6	454047	454052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214153
11124	NC_017249	TGC	2	6	454066	454071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214153
11125	NC_017249	CCG	2	6	454096	454101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214153
11126	NC_017249	GGT	2	6	454121	454126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214153
11127	NC_017249	TGG	2	6	454137	454142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214153
11128	NC_017249	GCT	2	6	454163	454168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214153
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11130	NC_017249	CGA	2	6	454217	454222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214153
11131	NC_017249	GGGCAT	2	12	454292	454303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384214153
11132	NC_017249	GC	3	6	454342	454347	0 %	0 %	50 %	50 %	384214153
11133	NC_017249	CGG	2	6	454379	454384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214153
11134	NC_017249	ATC	2	6	454407	454412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214153
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11140	NC_017249	CTG	2	6	454665	454670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214153
11141	NC_017249	GCA	2	6	454708	454713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214153
11142	NC_017249	GAT	2	6	454724	454729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214153
11143	NC_017249	TGA	2	6	454741	454746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214153
11144	NC_017249	CGGC	2	8	454777	454784	0 %	0 %	50 %	50 %	384214153
11145	NC_017249	CGC	2	6	454790	454795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214153
11146	NC_017249	TGG	2	6	454801	454806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384214153
11147	NC_017249	GCT	2	6	454835	454840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214153
11148	NC_017249	GGGCGA	2	12	454961	454972	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11149	NC_017249	CG	3	6	454981	454986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11150	NC_017249	CGG	2	6	455101	455106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11151	NC_017249	GCC	2	6	455196	455201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214154
11152	NC_017249	CGC	2	6	455213	455218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214154
11153	NC_017249	GC	3	6	455237	455242	0 %	0 %	50 %	50 %	384214154
11154	NC_017249	TGC	2	6	455248	455253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214154
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11167	NC_017249	GA	3	6	455956	455961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11168	NC_017249	TTTG	2	8	455995	456002	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11169	NC_017249	GCG	2	6	456038	456043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11170	NC_017249	GCCC	2	8	456070	456077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11171	NC_017249	GCCC	2	8	456085	456092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11172	NC_017249	TCCGGG	2	12	456112	456123	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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11174	NC_017249	GAG	2	6	456153	456158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11175	NC_017249	CGA	2	6	456164	456169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11177	NC_017249	GGC	2	6	456239	456244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11178	NC_017249	TCC	2	6	456282	456287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11179	NC_017249	CAG	2	6	456352	456357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214155
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11182	NC_017249	CGG	2	6	456441	456446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214155
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11196	NC_017249	TGG	2	6	456879	456884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11197	NC_017249	ACC	2	6	456923	456928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384214156
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11203	NC_017249	GGTTG	2	10	457209	457218	0 %	40 %	60 %	0 %	384214156
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11206	NC_017249	GC	3	6	457247	457252	0 %	0 %	50 %	50 %	384214156
11207	NC_017249	GCTC	2	8	457254	457261	0 %	25 %	25 %	50 %	384214156
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11210	NC_017249	CGC	2	6	457386	457391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11211	NC_017249	ACTCA	2	10	457404	457413	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11212	NC_017249	AC	3	6	457435	457440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11213	NC_017249	CGC	2	6	457501	457506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11214	NC_017249	GCC	2	6	457524	457529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11215	NC_017249	TG	3	6	457548	457553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11216	NC_017249	CG	3	6	457625	457630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11217	NC_017249	AGG	2	6	457634	457639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11218	NC_017249	GC	3	6	457703	457708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11219	NC_017249	CG	3	6	457820	457825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11220	NC_017249	C	6	6	457826	457831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11221	NC_017249	GA	3	6	457840	457845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11222	NC_017249	GCTTC	2	10	457874	457883	0 %	40 %	20 %	40 %	384214157
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11225	NC_017249	ACG	2	6	458051	458056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214157
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11228	NC_017249	CCG	2	6	458154	458159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214157
11229	NC_017249	CGC	2	6	458170	458175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214157
11230	NC_017249	TCA	2	6	458226	458231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214157
11231	NC_017249	GCG	2	6	458322	458327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214157
11232	NC_017249	CGC	2	6	458343	458348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214157
11233	NC_017249	GAT	2	6	458449	458454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214157
11234	NC_017249	GA	3	6	458468	458473	50 %	0 %	50 %	0 %	384214157
11235	NC_017249	CGG	2	6	458490	458495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214157
11236	NC_017249	AGG	2	6	458502	458507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384214157
11237	NC_017249	AGC	2	6	458508	458513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214157
11238	NC_017249	CGG	2	6	458556	458561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214157
11239	NC_017249	CGA	2	6	458574	458579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214157
11240	NC_017249	CAT	2	6	458644	458649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384214157
11241	NC_017249	CCG	2	6	458761	458766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11242	NC_017249	GGC	2	6	458802	458807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11243	NC_017249	GCC	2	6	458818	458823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11244	NC_017249	GCA	2	6	458894	458899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214158
11245	NC_017249	GCC	2	6	458913	458918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214158
11246	NC_017249	GTA	2	6	458925	458930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384214158
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11353	NC_017249	TCG	2	6	463271	463276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214160
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11355	NC_017249	CGG	3	9	463352	463360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384214160
11356	NC_017249	GC	3	6	463426	463431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11357	NC_017249	GATC	2	8	463486	463493	25 %	25 %	25 %	25 %	384214161
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11360	NC_017249	CGA	2	6	463603	463608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214161
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11364	NC_017249	CGC	2	6	463741	463746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214161
11365	NC_017249	GCC	2	6	463751	463756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214161
11366	NC_017249	GCC	2	6	463769	463774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214161
11367	NC_017249	GCT	2	6	463789	463794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214161
11368	NC_017249	GCCG	2	8	463812	463819	0 %	0 %	50 %	50 %	384214161
11369	NC_017249	CG	3	6	463846	463851	0 %	0 %	50 %	50 %	384214161
11370	NC_017249	GC	3	6	463906	463911	0 %	0 %	50 %	50 %	384214161
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11372	NC_017249	GC	4	8	463934	463941	0 %	0 %	50 %	50 %	384214161
11373	NC_017249	CGC	3	9	463939	463947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214161
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11402	NC_017249	GCC	2	6	465020	465025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11482	NC_017249	CG	3	6	468186	468191	0 %	0 %	50 %	50 %	384214167
11483	NC_017249	CGA	2	6	468195	468200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384214167
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11485	NC_017249	GCT	2	6	468294	468299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214167
11486	NC_017249	GGCGC	2	10	468300	468309	0 %	0 %	60 %	40 %	384214167
11487	NC_017249	GCC	2	6	468334	468339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214167
11488	NC_017249	GC	4	8	468347	468354	0 %	0 %	50 %	50 %	384214167
11489	NC_017249	TCG	2	6	468380	468385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214167
11490	NC_017249	AGGCCG	2	12	468389	468400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384214167
11491	NC_017249	GCC	2	6	468455	468460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214167
11492	NC_017249	TGC	2	6	468464	468469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384214167
11493	NC_017249	CG	3	6	468506	468511	0 %	0 %	50 %	50 %	384214167
11494	NC_017249	CCG	2	6	468514	468519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384214167
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