MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 223660

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017249	ATG	2	6	246962	246967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017249	TTTTG	2	10	246993	247002	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017249	CGA	2	6	247077	247082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213980
6004	NC_017249	CCT	2	6	247083	247088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213980
6005	NC_017249	TCA	2	6	247089	247094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213980
6006	NC_017249	GAA	2	6	247096	247101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384213980
6007	NC_017249	GTT	2	6	247137	247142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384213980
6008	NC_017249	TCC	2	6	247163	247168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384213980
6009	NC_017249	CGA	2	6	247212	247217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213980
6010	NC_017249	CTT	2	6	247333	247338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213980
6011	NC_017249	GCG	2	6	247361	247366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213980
6012	NC_017249	GCG	2	6	247396	247401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213980
6013	NC_017249	GCCG	2	8	247455	247462	0 %	0 %	50 %	50 %	384213980
6014	NC_017249	GAA	2	6	247520	247525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017249	GAA	2	6	247551	247556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017249	TTA	2	6	247557	247562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017249	GCA	2	6	247604	247609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_017249	CG	3	6	247696	247701	0 %	0 %	50 %	50 %	384213981
6019	NC_017249	CGG	2	6	247762	247767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213981
6020	NC_017249	GGC	2	6	247820	247825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213981
6021	NC_017249	CAT	2	6	247849	247854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213981
6022	NC_017249	CGC	2	6	247930	247935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213981
6023	NC_017249	CGC	2	6	247939	247944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213981
6024	NC_017249	GCC	2	6	247962	247967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213981
6025	NC_017249	CAT	2	6	248023	248028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213981
6026	NC_017249	CAT	2	6	248038	248043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213981
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6030	NC_017249	GGC	2	6	248125	248130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213981
6031	NC_017249	GGC	2	6	248132	248137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213981
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6033	NC_017249	TGG	2	6	248179	248184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384213981
6034	NC_017249	CGC	2	6	248308	248313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213981
6035	NC_017249	CG	4	8	248321	248328	0 %	0 %	50 %	50 %	384213981
6036	NC_017249	TCG	2	6	248412	248417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213981
6037	NC_017249	TCG	2	6	248433	248438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213981
6038	NC_017249	GAC	2	6	248441	248446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213981
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6041	NC_017249	GCG	2	6	248697	248702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_017249	GTC	2	6	248727	248732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_017249	GAA	2	6	248786	248791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017249	CG	3	6	248800	248805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_017249	AAGA	2	8	248810	248817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017249	CTT	2	6	248931	248936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384213982
6047	NC_017249	CGT	2	6	248973	248978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213982
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6051	NC_017249	GCG	2	6	249110	249115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213982
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6053	NC_017249	CG	3	6	249162	249167	0 %	0 %	50 %	50 %	384213982
6054	NC_017249	CGC	2	6	249212	249217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213982
6055	NC_017249	CGC	2	6	249224	249229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213982
6056	NC_017249	GC	4	8	249228	249235	0 %	0 %	50 %	50 %	384213982
6057	NC_017249	GC	3	6	249251	249256	0 %	0 %	50 %	50 %	384213982
6058	NC_017249	TCGCTG	2	12	249265	249276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213982
6059	NC_017249	CCA	2	6	249293	249298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213982
6060	NC_017249	GAC	2	6	249398	249403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213982
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6063	NC_017249	AGC	2	6	249571	249576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213982
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6065	NC_017249	GCG	2	6	249681	249686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213982
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6069	NC_017249	GC	3	6	249751	249756	0 %	0 %	50 %	50 %	384213982
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6089	NC_017249	GCA	2	6	250544	250549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213982
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6097	NC_017249	CG	3	6	250800	250805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6100	NC_017249	CGA	2	6	250875	250880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_017249	GAG	2	6	250909	250914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_017249	CT	3	6	250916	250921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_017249	CA	3	6	250923	250928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_017249	GAA	2	6	251013	251018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_017249	GCC	2	6	251081	251086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213983
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6113	NC_017249	CG	3	6	251430	251435	0 %	0 %	50 %	50 %	384213983
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6119	NC_017249	GCC	2	6	251599	251604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213983
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6122	NC_017249	CGT	2	6	251652	251657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213983
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6246	NC_017249	ACGCG	2	10	256848	256857	20 %	0 %	40 %	40 %	384213987
6247	NC_017249	CGC	2	6	256894	256899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213987
6248	NC_017249	ACCG	2	8	256975	256982	25 %	0 %	25 %	50 %	384213987
6249	NC_017249	CAT	2	6	256993	256998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384213987
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6251	NC_017249	CCA	2	6	257079	257084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213987
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6253	NC_017249	CACGAT	2	12	257092	257103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384213987
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6266	NC_017249	CTG	2	6	257725	257730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213988
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6269	NC_017249	CGAC	2	8	257849	257856	25 %	0 %	25 %	50 %	384213988
6270	NC_017249	GTC	2	6	257887	257892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213988
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6273	NC_017249	CGGC	2	8	257954	257961	0 %	0 %	50 %	50 %	384213988
6274	NC_017249	GCA	2	6	257999	258004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213988
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6281	NC_017249	CGA	2	6	258516	258521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213988
6282	NC_017249	CAA	2	6	258531	258536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384213988
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6284	NC_017249	GGC	2	6	258591	258596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213988
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6291	NC_017249	TCG	2	6	258903	258908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213989
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6312	NC_017249	GA	3	6	259903	259908	50 %	0 %	50 %	0 %	384213990
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6331	NC_017249	GC	3	6	260596	260601	0 %	0 %	50 %	50 %	384213990
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6342	NC_017249	GC	3	6	260807	260812	0 %	0 %	50 %	50 %	384213990
6343	NC_017249	CAG	2	6	260844	260849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384213990
6344	NC_017249	ATG	3	9	260905	260913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384213990
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6348	NC_017249	CGCAG	2	10	261011	261020	20 %	0 %	40 %	40 %	384213990
6349	NC_017249	CAATC	2	10	261041	261050	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6350	NC_017249	CCG	2	6	261096	261101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213991
6351	NC_017249	CGT	2	6	261121	261126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213991
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6354	NC_017249	CAC	2	6	261238	261243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384213991
6355	NC_017249	GCTGAC	2	12	261250	261261	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384213991
6356	NC_017249	GGA	2	6	261262	261267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213991
6357	NC_017249	GA	3	6	261306	261311	50 %	0 %	50 %	0 %	384213991
6358	NC_017249	GGA	2	6	261313	261318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384213991
6359	NC_017249	GGC	2	6	261331	261336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384213991
6360	NC_017249	GGCGC	2	10	261341	261350	0 %	0 %	60 %	40 %	384213991
6361	NC_017249	CG	3	6	261351	261356	0 %	0 %	50 %	50 %	384213991
6362	NC_017249	GCC	2	6	261357	261362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213991
6363	NC_017249	TGC	2	6	261393	261398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213991
6364	NC_017249	CG	3	6	261544	261549	0 %	0 %	50 %	50 %	384213991
6365	NC_017249	GTC	3	9	261572	261580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213991
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6367	NC_017249	GCC	2	6	261721	261726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384213991
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6493	NC_017249	CGT	2	6	267234	267239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384213996
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6495	NC_017249	GTGC	2	8	267390	267397	0 %	25 %	50 %	25 %	384213996
6496	NC_017249	GC	3	6	267399	267404	0 %	0 %	50 %	50 %	384213996
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