MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_017243	AAT	2	6	1309254	1309259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208642
41503	NC_017243	GAA	2	6	1309336	1309341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208642
41504	NC_017243	AGT	2	6	1309365	1309370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208642
41505	NC_017243	ACGGT	2	10	1309376	1309385	20 %	20 %	40 %	20 %	384208642
41506	NC_017243	CGG	2	6	1309389	1309394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384208642
41507	NC_017243	GAA	2	6	1309400	1309405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208642
41508	NC_017243	ATGAAT	2	12	1309445	1309456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384208642
41509	NC_017243	TAAA	2	8	1309487	1309494	75 %	25 %	0 %	0 %	384208642
41510	NC_017243	AACA	2	8	1309568	1309575	75 %	0 %	0 %	25 %	384208642
41511	NC_017243	TTA	2	6	1309610	1309615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208642
41512	NC_017243	CAA	2	6	1309664	1309669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384208642
41513	NC_017243	TGA	2	6	1309689	1309694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208642
41514	NC_017243	TAA	2	6	1309701	1309706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208642
41515	NC_017243	ATG	2	6	1309721	1309726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208642
41516	NC_017243	TTA	2	6	1309727	1309732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208642
41517	NC_017243	TA	3	6	1309771	1309776	50 %	50 %	0 %	0 %	384208642
41518	NC_017243	TTA	2	6	1309791	1309796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208642
41519	NC_017243	TCA	2	6	1309810	1309815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208642
41520	NC_017243	TCA	2	6	1309843	1309848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208642
41521	NC_017243	TAA	2	6	1309878	1309883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208642
41522	NC_017243	CTA	2	6	1309913	1309918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208642
41523	NC_017243	ATTT	2	8	1309930	1309937	25 %	75 %	0 %	0 %	384208642
41524	NC_017243	CTT	2	6	1309987	1309992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208642
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41527	NC_017243	AAAT	2	8	1310151	1310158	75 %	25 %	0 %	0 %	384208642
41528	NC_017243	TA	3	6	1310165	1310170	50 %	50 %	0 %	0 %	384208642
41529	NC_017243	GTG	2	6	1310177	1310182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384208642
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41534	NC_017243	GAT	2	6	1310356	1310361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208642
41535	NC_017243	TAAT	2	8	1310363	1310370	50 %	50 %	0 %	0 %	384208642
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41545	NC_017243	GACA	2	8	1310728	1310735	50 %	0 %	25 %	25 %	384208642
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41551	NC_017243	AAT	2	6	1311007	1311012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41552	NC_017243	TA	3	6	1311036	1311041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41555	NC_017243	AT	3	6	1311139	1311144	50 %	50 %	0 %	0 %	384208643
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41578	NC_017243	GAA	2	6	1311920	1311925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208644
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41602	NC_017243	TGC	2	6	1312616	1312621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384208645
41603	NC_017243	AT	3	6	1312632	1312637	50 %	50 %	0 %	0 %	384208645
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41606	NC_017243	GATG	2	8	1312751	1312758	25 %	25 %	50 %	0 %	384208645
41607	NC_017243	TAT	2	6	1312775	1312780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208645
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41610	NC_017243	GGC	3	9	1312860	1312868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384208645
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41613	NC_017243	AAAT	2	8	1312936	1312943	75 %	25 %	0 %	0 %	384208645
41614	NC_017243	TTA	2	6	1312959	1312964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208645
41615	NC_017243	T	6	6	1312974	1312979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41616	NC_017243	ATA	2	6	1312980	1312985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41617	NC_017243	TA	3	6	1313029	1313034	50 %	50 %	0 %	0 %	384208646
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