MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_017243	ATT	2	6	718644	718649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208134
23003	NC_017243	A	6	6	718662	718667	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23004	NC_017243	A	6	6	718672	718677	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23005	NC_017243	ATA	2	6	718687	718692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23006	NC_017243	TA	3	6	718763	718768	50 %	50 %	0 %	0 %	384208134
23007	NC_017243	ATT	2	6	718787	718792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208134
23008	NC_017243	TAA	2	6	718842	718847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23009	NC_017243	TAA	2	6	718905	718910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23010	NC_017243	ATA	2	6	718975	718980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23011	NC_017243	GAA	2	6	718981	718986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208134
23012	NC_017243	TTGATA	2	12	719057	719068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384208134
23013	NC_017243	ATT	2	6	719088	719093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208134
23014	NC_017243	TGA	2	6	719270	719275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208134
23015	NC_017243	A	7	7	719304	719310	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23016	NC_017243	GA	3	6	719322	719327	50 %	0 %	50 %	0 %	384208134
23017	NC_017243	TGA	2	6	719334	719339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208134
23018	NC_017243	ATA	2	6	719359	719364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23019	NC_017243	TGA	2	6	719376	719381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208134
23020	NC_017243	AGA	2	6	719385	719390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208134
23021	NC_017243	GAA	2	6	719434	719439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208134
23022	NC_017243	A	8	8	719485	719492	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23023	NC_017243	AAG	2	6	719520	719525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208134
23024	NC_017243	ATT	2	6	719568	719573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208134
23025	NC_017243	A	7	7	719590	719596	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23026	NC_017243	GAT	2	6	719611	719616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208134
23027	NC_017243	ATA	2	6	719627	719632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23028	NC_017243	ATT	2	6	719636	719641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208134
23029	NC_017243	AAT	2	6	719664	719669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208134
23030	NC_017243	A	7	7	719676	719682	100 %	0 %	0 %	0 %	384208134
23031	NC_017243	GTT	2	6	719771	719776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23032	NC_017243	TTTA	2	8	719784	719791	25 %	75 %	0 %	0 %	384208135
23033	NC_017243	A	6	6	719844	719849	100 %	0 %	0 %	0 %	384208135
23034	NC_017243	CT	3	6	719866	719871	0 %	50 %	0 %	50 %	384208135
23035	NC_017243	TAA	2	6	719889	719894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208135
23036	NC_017243	AG	4	8	719910	719917	50 %	0 %	50 %	0 %	384208135
23037	NC_017243	ATT	2	6	719985	719990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208135
23038	NC_017243	TGC	2	6	719991	719996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384208135
23039	NC_017243	ATT	2	6	720053	720058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208135
23040	NC_017243	GAA	2	6	720070	720075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208135
23041	NC_017243	T	7	7	720132	720138	0 %	100 %	0 %	0 %	384208135
23042	NC_017243	TA	3	6	720163	720168	50 %	50 %	0 %	0 %	384208135
23043	NC_017243	A	6	6	720198	720203	100 %	0 %	0 %	0 %	384208135
23044	NC_017243	GA	4	8	720226	720233	50 %	0 %	50 %	0 %	384208135
23045	NC_017243	GAT	2	6	720247	720252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208135
23046	NC_017243	AT	3	6	720251	720256	50 %	50 %	0 %	0 %	384208135
23047	NC_017243	CTT	2	6	720263	720268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208135
23048	NC_017243	TGA	2	6	720276	720281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208135
23049	NC_017243	AT	3	6	720285	720290	50 %	50 %	0 %	0 %	384208135
23050	NC_017243	GT	4	8	720296	720303	0 %	50 %	50 %	0 %	384208135
23051	NC_017243	A	6	6	720312	720317	100 %	0 %	0 %	0 %	384208135
23052	NC_017243	TTTAA	2	10	720343	720352	40 %	60 %	0 %	0 %	384208135
23053	NC_017243	T	6	6	720426	720431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_017243	ATT	2	6	720524	720529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208136
23055	NC_017243	TAT	2	6	720553	720558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208136
23056	NC_017243	ATAA	2	8	720621	720628	75 %	25 %	0 %	0 %	384208136
23057	NC_017243	GAAGT	2	10	720649	720658	40 %	20 %	40 %	0 %	384208136
23058	NC_017243	AGA	2	6	720717	720722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208136
23059	NC_017243	AAAG	2	8	720789	720796	75 %	0 %	25 %	0 %	384208136
23060	NC_017243	ATT	2	6	720815	720820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208136
23061	NC_017243	ATAA	2	8	720843	720850	75 %	25 %	0 %	0 %	384208136
23062	NC_017243	TACA	2	8	720874	720881	50 %	25 %	0 %	25 %	384208136
23063	NC_017243	ACT	3	9	720885	720893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208136
23064	NC_017243	AGA	2	6	720932	720937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208136
23065	NC_017243	CTA	2	6	720943	720948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208136
23066	NC_017243	GTT	2	6	720951	720956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384208136
23067	NC_017243	TGA	2	6	720959	720964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208136
23068	NC_017243	GTT	2	6	720969	720974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384208136
23069	NC_017243	AAG	2	6	720997	721002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208136
23070	NC_017243	A	6	6	721013	721018	100 %	0 %	0 %	0 %	384208136
23071	NC_017243	TA	3	6	721023	721028	50 %	50 %	0 %	0 %	384208136
23072	NC_017243	ATCA	2	8	721042	721049	50 %	25 %	0 %	25 %	384208136
23073	NC_017243	AGA	2	6	721118	721123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208136
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23075	NC_017243	AAT	2	6	721185	721190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208136
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23078	NC_017243	TAA	2	6	721309	721314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208136
23079	NC_017243	AATT	2	8	721339	721346	50 %	50 %	0 %	0 %	384208136
23080	NC_017243	TA	3	6	721372	721377	50 %	50 %	0 %	0 %	384208136
23081	NC_017243	AGA	2	6	721450	721455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208136
23082	NC_017243	TGA	2	6	721460	721465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208136
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23087	NC_017243	T	6	6	721518	721523	0 %	100 %	0 %	0 %	384208137
23088	NC_017243	T	6	6	721533	721538	0 %	100 %	0 %	0 %	384208137
23089	NC_017243	AT	3	6	721549	721554	50 %	50 %	0 %	0 %	384208137
23090	NC_017243	TCA	2	6	721611	721616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208137
23091	NC_017243	TA	3	6	721631	721636	50 %	50 %	0 %	0 %	384208137
23092	NC_017243	TA	3	6	721642	721647	50 %	50 %	0 %	0 %	384208137
23093	NC_017243	CCA	2	6	721659	721664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384208137
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23095	NC_017243	CTT	2	6	721708	721713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208137
23096	NC_017243	TTTCT	2	10	721753	721762	0 %	80 %	0 %	20 %	384208137
23097	NC_017243	TCA	4	12	721767	721778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208137
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23102	NC_017243	ATA	2	6	721883	721888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208137
23103	NC_017243	TAT	2	6	721904	721909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
23104	NC_017243	T	8	8	721984	721991	0 %	100 %	0 %	0 %	384208137
23105	NC_017243	T	6	6	722010	722015	0 %	100 %	0 %	0 %	384208137
23106	NC_017243	ATT	2	6	722048	722053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
23107	NC_017243	TA	4	8	722084	722091	50 %	50 %	0 %	0 %	384208137
23108	NC_017243	AAG	2	6	722130	722135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384208137
23109	NC_017243	AT	3	6	722137	722142	50 %	50 %	0 %	0 %	384208137
23110	NC_017243	CTT	3	9	722149	722157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208137
23111	NC_017243	TAT	2	6	722179	722184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
23112	NC_017243	TCA	3	9	722211	722219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208137
23113	NC_017243	TAT	2	6	722260	722265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
23114	NC_017243	ATT	2	6	722355	722360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
23115	NC_017243	AAT	2	6	722380	722385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208137
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23117	NC_017243	ATT	2	6	722451	722456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208137
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23120	NC_017243	ATC	2	6	722510	722515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208137
23121	NC_017243	AAT	2	6	722550	722555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208137
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