MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_017243	ATA	2	6	574470	574475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_017243	TAA	2	6	574519	574524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_017243	TA	3	6	574531	574536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_017243	TAA	2	6	574539	574544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_017243	GTT	2	6	574547	574552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_017243	A	9	9	574568	574576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_017243	TTTATA	2	12	574608	574619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_017243	ATA	2	6	574640	574645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_017243	TTA	2	6	574654	574659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208007
18510	NC_017243	TCA	2	6	574684	574689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384208007
18511	NC_017243	TTA	2	6	574724	574729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208007
18512	NC_017243	GATA	2	8	574744	574751	50 %	25 %	25 %	0 %	384208007
18513	NC_017243	AT	4	8	574793	574800	50 %	50 %	0 %	0 %	384208007
18514	NC_017243	TTGTTT	2	12	574804	574815	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384208007
18515	NC_017243	TTTA	2	8	574818	574825	25 %	75 %	0 %	0 %	384208007
18516	NC_017243	TTCTA	2	10	574836	574845	20 %	60 %	0 %	20 %	384208007
18517	NC_017243	TTAA	2	8	574864	574871	50 %	50 %	0 %	0 %	384208007
18518	NC_017243	TC	3	6	574897	574902	0 %	50 %	0 %	50 %	384208007
18519	NC_017243	AAC	2	6	574920	574925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384208007
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18521	NC_017243	ATA	2	6	574947	574952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
18522	NC_017243	TA	6	12	574961	574972	50 %	50 %	0 %	0 %	384208007
18523	NC_017243	TAA	2	6	574991	574996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
18524	NC_017243	T	6	6	575005	575010	0 %	100 %	0 %	0 %	384208007
18525	NC_017243	ATA	2	6	575036	575041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
18526	NC_017243	TA	3	6	575055	575060	50 %	50 %	0 %	0 %	384208007
18527	NC_017243	T	7	7	575061	575067	0 %	100 %	0 %	0 %	384208007
18528	NC_017243	ATA	2	6	575091	575096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
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18531	NC_017243	ATT	2	6	575191	575196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208007
18532	NC_017243	TAA	2	6	575207	575212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
18533	NC_017243	ATA	2	6	575224	575229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208007
18534	NC_017243	TA	3	6	575231	575236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_017243	TTA	2	6	575250	575255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18536	NC_017243	TAA	2	6	575289	575294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_017243	GC	3	6	575374	575379	0 %	0 %	50 %	50 %	384208008
18538	NC_017243	TATT	2	8	575502	575509	25 %	75 %	0 %	0 %	384208008
18539	NC_017243	TTA	2	6	575550	575555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208008
18540	NC_017243	TAAA	2	8	575607	575614	75 %	25 %	0 %	0 %	384208008
18541	NC_017243	AT	3	6	575628	575633	50 %	50 %	0 %	0 %	384208008
18542	NC_017243	ATG	2	6	575652	575657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384208008
18543	NC_017243	AACC	2	8	575675	575682	50 %	0 %	0 %	50 %	384208008
18544	NC_017243	TTC	2	6	575734	575739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208008
18545	NC_017243	AT	3	6	575796	575801	50 %	50 %	0 %	0 %	384208008
18546	NC_017243	TAT	2	6	575832	575837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208008
18547	NC_017243	TGT	2	6	575890	575895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384208008
18548	NC_017243	T	6	6	575917	575922	0 %	100 %	0 %	0 %	384208008
18549	NC_017243	CTG	2	6	575927	575932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384208008
18550	NC_017243	TAA	2	6	575948	575953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208008
18551	NC_017243	ACCAA	2	10	576103	576112	60 %	0 %	0 %	40 %	384208008
18552	NC_017243	CTG	2	6	576116	576121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384208008
18553	NC_017243	AT	3	6	576169	576174	50 %	50 %	0 %	0 %	384208008
18554	NC_017243	ACTTT	2	10	576195	576204	20 %	60 %	0 %	20 %	384208008
18555	NC_017243	ATT	2	6	576220	576225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384208008
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18557	NC_017243	AAATA	2	10	576292	576301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_017243	T	6	6	576312	576317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_017243	A	6	6	576321	576326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_017243	TA	4	8	576354	576361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_017243	T	6	6	576371	576376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_017243	T	6	6	576404	576409	0 %	100 %	0 %	0 %	384208009
18563	NC_017243	TA	3	6	576424	576429	50 %	50 %	0 %	0 %	384208009
18564	NC_017243	TTCTAT	2	12	576529	576540	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384208009
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18574	NC_017243	CT	3	6	576821	576826	0 %	50 %	0 %	50 %	384208009
18575	NC_017243	T	6	6	576847	576852	0 %	100 %	0 %	0 %	384208009
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18584	NC_017243	AAT	2	6	577145	577150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208010
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18590	NC_017243	A	7	7	577373	577379	100 %	0 %	0 %	0 %	384208010
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18597	NC_017243	T	6	6	577555	577560	0 %	100 %	0 %	0 %	384208011
18598	NC_017243	CAG	2	6	577595	577600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384208011
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18616	NC_017243	AT	3	6	578332	578337	50 %	50 %	0 %	0 %	384208011
18617	NC_017243	TAA	2	6	578343	578348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384208011
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18619	NC_017243	TAT	2	6	578406	578411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18620	NC_017243	TCT	2	6	578429	578434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384208012
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