MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_017243	ATA	2	6	526636	526641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17002	NC_017243	ATTT	2	8	526651	526658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_017243	TA	4	8	526659	526666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_017243	A	6	6	526666	526671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_017243	TTA	2	6	526706	526711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_017243	A	6	6	526713	526718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_017243	ATT	2	6	526729	526734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207970
17008	NC_017243	TGAAG	2	10	526740	526749	40 %	20 %	40 %	0 %	384207970
17009	NC_017243	TGTTC	2	10	526812	526821	0 %	60 %	20 %	20 %	384207970
17010	NC_017243	CTT	2	6	526843	526848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207970
17011	NC_017243	T	7	7	526847	526853	0 %	100 %	0 %	0 %	384207970
17012	NC_017243	AG	3	6	526866	526871	50 %	0 %	50 %	0 %	384207970
17013	NC_017243	AAT	2	6	526906	526911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207970
17014	NC_017243	TTTG	2	8	526944	526951	0 %	75 %	25 %	0 %	384207970
17015	NC_017243	TCTT	2	8	526961	526968	0 %	75 %	0 %	25 %	384207970
17016	NC_017243	AATTTT	2	12	526986	526997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207970
17017	NC_017243	CAA	2	6	526999	527004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207970
17018	NC_017243	TCA	2	6	527010	527015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207970
17019	NC_017243	AT	3	6	527049	527054	50 %	50 %	0 %	0 %	384207970
17020	NC_017243	ATA	2	6	527128	527133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207970
17021	NC_017243	ATA	2	6	527139	527144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207970
17022	NC_017243	TAA	2	6	527178	527183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_017243	TA	3	6	527194	527199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_017243	GGT	2	6	527214	527219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384207971
17025	NC_017243	CCAAG	2	10	527249	527258	40 %	0 %	20 %	40 %	384207971
17026	NC_017243	TCT	2	6	527318	527323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207971
17027	NC_017243	AATA	2	8	527403	527410	75 %	25 %	0 %	0 %	384207971
17028	NC_017243	ATGA	2	8	527460	527467	50 %	25 %	25 %	0 %	384207971
17029	NC_017243	TCCA	2	8	527484	527491	25 %	25 %	0 %	50 %	384207971
17030	NC_017243	AAAG	2	8	527524	527531	75 %	0 %	25 %	0 %	384207971
17031	NC_017243	CATCAG	2	12	527631	527642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384207971
17032	NC_017243	CAT	2	6	527757	527762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17033	NC_017243	ATT	2	6	527789	527794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17034	NC_017243	TAG	2	6	527928	527933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207971
17035	NC_017243	AAT	2	6	527940	527945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17036	NC_017243	CTG	2	6	527951	527956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207971
17037	NC_017243	TTA	2	6	528032	528037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17038	NC_017243	T	7	7	528055	528061	0 %	100 %	0 %	0 %	384207971
17039	NC_017243	CTG	2	6	528124	528129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207971
17040	NC_017243	TGA	2	6	528147	528152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207971
17041	NC_017243	AAT	2	6	528159	528164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17042	NC_017243	ATA	2	6	528175	528180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17043	NC_017243	AT	3	6	528310	528315	50 %	50 %	0 %	0 %	384207971
17044	NC_017243	CTG	2	6	528364	528369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207971
17045	NC_017243	AAG	2	6	528413	528418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207971
17046	NC_017243	CCT	3	9	528473	528481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207971
17047	NC_017243	ATTTAA	2	12	528511	528522	50 %	50 %	0 %	0 %	384207971
17048	NC_017243	CAG	2	6	528537	528542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207971
17049	NC_017243	TAT	2	6	528585	528590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17050	NC_017243	TCTT	2	8	528595	528602	0 %	75 %	0 %	25 %	384207971
17051	NC_017243	CT	3	6	528606	528611	0 %	50 %	0 %	50 %	384207971
17052	NC_017243	TGT	2	6	528619	528624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207971
17053	NC_017243	TATTT	2	10	528757	528766	20 %	80 %	0 %	0 %	384207971
17054	NC_017243	CATTAA	2	12	528771	528782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384207971
17055	NC_017243	AT	3	6	528804	528809	50 %	50 %	0 %	0 %	384207971
17056	NC_017243	TATT	2	8	528824	528831	25 %	75 %	0 %	0 %	384207971
17057	NC_017243	TA	3	6	528870	528875	50 %	50 %	0 %	0 %	384207971
17058	NC_017243	T	6	6	528883	528888	0 %	100 %	0 %	0 %	384207971
17059	NC_017243	TAT	2	6	528909	528914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17060	NC_017243	ATG	2	6	528923	528928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207971
17061	NC_017243	ATA	2	6	528958	528963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17062	NC_017243	TAT	2	6	528991	528996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17063	NC_017243	TAA	2	6	529070	529075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17064	NC_017243	ATA	2	6	529087	529092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17065	NC_017243	TTTATC	2	12	529102	529113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384207971
17066	NC_017243	CTA	2	6	529254	529259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17067	NC_017243	CAT	2	6	529371	529376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17068	NC_017243	CAT	2	6	529428	529433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17069	NC_017243	TA	3	6	529465	529470	50 %	50 %	0 %	0 %	384207971
17070	NC_017243	TAT	2	6	529483	529488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17071	NC_017243	CTA	2	6	529500	529505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17072	NC_017243	ACT	2	6	529517	529522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17073	NC_017243	CAT	2	6	529524	529529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207971
17074	NC_017243	AAT	2	6	529562	529567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207971
17075	NC_017243	T	7	7	529582	529588	0 %	100 %	0 %	0 %	384207971
17076	NC_017243	ATTT	2	8	529597	529604	25 %	75 %	0 %	0 %	384207971
17077	NC_017243	ATT	2	6	529642	529647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17078	NC_017243	TAT	2	6	529648	529653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207971
17079	NC_017243	AAAAT	2	10	529800	529809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17080	NC_017243	TAA	2	6	529824	529829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17081	NC_017243	ATTT	2	8	529896	529903	25 %	75 %	0 %	0 %	384207972
17082	NC_017243	T	6	6	529936	529941	0 %	100 %	0 %	0 %	384207972
17083	NC_017243	TTC	2	6	529994	529999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207972
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17085	NC_017243	TAAATA	2	12	530052	530063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207972
17086	NC_017243	TAT	2	6	530096	530101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
17087	NC_017243	CTG	2	6	530125	530130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207972
17088	NC_017243	ACT	2	6	530158	530163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
17089	NC_017243	TA	3	6	530178	530183	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17090	NC_017243	CTT	2	6	530236	530241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207972
17091	NC_017243	GCT	2	6	530270	530275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207972
17092	NC_017243	GTATA	2	10	530402	530411	40 %	40 %	20 %	0 %	384207972
17093	NC_017243	GAT	2	6	530443	530448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207972
17094	NC_017243	AT	3	6	530479	530484	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17095	NC_017243	ATA	2	6	530550	530555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207972
17096	NC_017243	T	6	6	530556	530561	0 %	100 %	0 %	0 %	384207972
17097	NC_017243	TAT	2	6	530583	530588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
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17099	NC_017243	TA	3	6	530659	530664	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17100	NC_017243	TAT	2	6	530717	530722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
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17102	NC_017243	CTA	2	6	530762	530767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
17103	NC_017243	AT	3	6	530817	530822	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17104	NC_017243	GAAG	2	8	530866	530873	50 %	0 %	50 %	0 %	384207972
17105	NC_017243	AGTA	2	8	530904	530911	50 %	25 %	25 %	0 %	384207972
17106	NC_017243	TAAATT	2	12	530991	531002	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17107	NC_017243	TGA	2	6	531030	531035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207972
17108	NC_017243	TAA	2	6	531036	531041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207972
17109	NC_017243	TGT	2	6	531062	531067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207972
17110	NC_017243	TTA	2	6	531133	531138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
17111	NC_017243	CTA	2	6	531170	531175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
17112	NC_017243	ATC	2	6	531180	531185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
17113	NC_017243	AT	3	6	531188	531193	50 %	50 %	0 %	0 %	384207972
17114	NC_017243	T	7	7	531216	531222	0 %	100 %	0 %	0 %	384207972
17115	NC_017243	TAT	2	6	531378	531383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
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17117	NC_017243	T	6	6	531424	531429	0 %	100 %	0 %	0 %	384207972
17118	NC_017243	TCA	2	6	531454	531459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
17119	NC_017243	TTA	2	6	531460	531465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207972
17120	NC_017243	CTT	2	6	531497	531502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207972
17121	NC_017243	CTA	2	6	531506	531511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207972
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17496	NC_017243	ATC	2	6	543328	543333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207983
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17498	NC_017243	TAAA	2	8	543388	543395	75 %	25 %	0 %	0 %	384207983
17499	NC_017243	TAT	2	6	543480	543485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207983
17500	NC_017243	T	8	8	543510	543517	0 %	100 %	0 %	0 %	384207983

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