MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_017243	AAAT	2	8	510711	510718	75 %	25 %	0 %	0 %	384207955
16503	NC_017243	TTAC	2	8	510735	510742	25 %	50 %	0 %	25 %	384207955
16504	NC_017243	AT	4	8	510780	510787	50 %	50 %	0 %	0 %	384207955
16505	NC_017243	TGC	2	6	510841	510846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207955
16506	NC_017243	CTTCA	2	10	510871	510880	20 %	40 %	0 %	40 %	384207955
16507	NC_017243	GGC	2	6	510926	510931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384207955
16508	NC_017243	TAA	2	6	510937	510942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207955
16509	NC_017243	GTA	2	6	510944	510949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207955
16510	NC_017243	TAT	2	6	510973	510978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207955
16511	NC_017243	GAT	3	9	510992	511000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207955
16512	NC_017243	CTT	2	6	511089	511094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207955
16513	NC_017243	ATG	3	9	511113	511121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207955
16514	NC_017243	CTG	2	6	511143	511148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207955
16515	NC_017243	T	6	6	511153	511158	0 %	100 %	0 %	0 %	384207955
16516	NC_017243	TTA	2	6	511213	511218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207955
16517	NC_017243	CTTT	2	8	511239	511246	0 %	75 %	0 %	25 %	384207955
16518	NC_017243	AAAT	2	8	511269	511276	75 %	25 %	0 %	0 %	384207955
16519	NC_017243	ATT	3	9	511395	511403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_017243	A	8	8	511420	511427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_017243	AT	3	6	511436	511441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_017243	ATT	2	6	511464	511469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207956
16523	NC_017243	TAA	2	6	511490	511495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207956
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16527	NC_017243	TTA	2	6	511640	511645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207956
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16530	NC_017243	TTA	2	6	511779	511784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207956
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16532	NC_017243	ATT	2	6	511814	511819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207956
16533	NC_017243	TTA	2	6	511904	511909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207956
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16538	NC_017243	AG	3	6	512293	512298	50 %	0 %	50 %	0 %	384207956
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16540	NC_017243	A	6	6	512332	512337	100 %	0 %	0 %	0 %	384207956
16541	NC_017243	TAAA	2	8	512338	512345	75 %	25 %	0 %	0 %	384207956
16542	NC_017243	AAG	2	6	512409	512414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207957
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16547	NC_017243	A	6	6	512539	512544	100 %	0 %	0 %	0 %	384207957
16548	NC_017243	TAC	2	6	512566	512571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207957
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16551	NC_017243	TAT	2	6	512631	512636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207957
16552	NC_017243	AATG	2	8	512665	512672	50 %	25 %	25 %	0 %	384207957
16553	NC_017243	AGT	2	6	512674	512679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207957
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16555	NC_017243	CAT	2	6	512732	512737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207957
16556	NC_017243	ATT	2	6	512786	512791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207957
16557	NC_017243	ATG	2	6	512793	512798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207957
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16569	NC_017243	TAT	2	6	513100	513105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16597	NC_017243	TAT	2	6	513850	513855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16601	NC_017243	ATA	2	6	513929	513934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_017243	AT	3	6	513965	513970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16603	NC_017243	ATT	2	6	513973	513978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16604	NC_017243	AT	3	6	513979	513984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_017243	ATT	2	6	513988	513993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16606	NC_017243	AT	3	6	514014	514019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16607	NC_017243	A	8	8	514025	514032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16611	NC_017243	TAA	2	6	514278	514283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207959
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16615	NC_017243	TCTT	2	8	514434	514441	0 %	75 %	0 %	25 %	384207959
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16619	NC_017243	A	6	6	514576	514581	100 %	0 %	0 %	0 %	384207959
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16621	NC_017243	A	6	6	514615	514620	100 %	0 %	0 %	0 %	384207959
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16998	NC_017243	TAT	2	6	526591	526596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16999	NC_017243	T	7	7	526596	526602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17000	NC_017243	AT	3	6	526619	526624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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