MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017243	TTC	2	6	484156	484161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207937
15502	NC_017243	T	6	6	484217	484222	0 %	100 %	0 %	0 %	384207937
15503	NC_017243	TTGT	2	8	484368	484375	0 %	75 %	25 %	0 %	384207937
15504	NC_017243	ATTTC	2	10	484392	484401	20 %	60 %	0 %	20 %	384207937
15505	NC_017243	TA	3	6	484472	484477	50 %	50 %	0 %	0 %	384207937
15506	NC_017243	CTT	2	6	484486	484491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207937
15507	NC_017243	CAG	2	6	484564	484569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207937
15508	NC_017243	CAT	3	9	484591	484599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207937
15509	NC_017243	CTT	2	6	484630	484635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207937
15510	NC_017243	T	6	6	484649	484654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_017243	AT	4	8	484685	484692	50 %	50 %	0 %	0 %	384207938
15512	NC_017243	CAG	2	6	484724	484729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207938
15513	NC_017243	ATTT	2	8	484737	484744	25 %	75 %	0 %	0 %	384207938
15514	NC_017243	TA	3	6	484746	484751	50 %	50 %	0 %	0 %	384207938
15515	NC_017243	AAGCA	2	10	484788	484797	60 %	0 %	20 %	20 %	384207938
15516	NC_017243	CAT	2	6	484818	484823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207938
15517	NC_017243	CCG	2	6	484831	484836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207938
15518	NC_017243	TTTTA	2	10	484842	484851	20 %	80 %	0 %	0 %	384207938
15519	NC_017243	ATT	2	6	484879	484884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207938
15520	NC_017243	CTATAA	2	12	484886	484897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384207938
15521	NC_017243	TAC	2	6	484905	484910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207938
15522	NC_017243	AT	3	6	484915	484920	50 %	50 %	0 %	0 %	384207938
15523	NC_017243	TTTTA	2	10	484943	484952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_017243	GAT	2	6	484960	484965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207939
15525	NC_017243	A	6	6	484974	484979	100 %	0 %	0 %	0 %	384207939
15526	NC_017243	TCC	2	6	484989	484994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207939
15527	NC_017243	TCA	2	6	484996	485001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15528	NC_017243	AT	3	6	485180	485185	50 %	50 %	0 %	0 %	384207939
15529	NC_017243	CTA	2	6	485195	485200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15530	NC_017243	TAGCA	2	10	485229	485238	40 %	20 %	20 %	20 %	384207939
15531	NC_017243	TCAT	2	8	485287	485294	25 %	50 %	0 %	25 %	384207939
15532	NC_017243	TTA	2	6	485299	485304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207939
15533	NC_017243	T	6	6	485310	485315	0 %	100 %	0 %	0 %	384207939
15534	NC_017243	T	6	6	485337	485342	0 %	100 %	0 %	0 %	384207939
15535	NC_017243	TCT	2	6	485374	485379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15536	NC_017243	CT	3	6	485382	485387	0 %	50 %	0 %	50 %	384207939
15537	NC_017243	ATC	2	6	485394	485399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15538	NC_017243	CTT	2	6	485414	485419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15539	NC_017243	CTAT	2	8	485437	485444	25 %	50 %	0 %	25 %	384207939
15540	NC_017243	TCT	2	6	485449	485454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15541	NC_017243	TCA	2	6	485500	485505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15542	NC_017243	TTC	2	6	485508	485513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15543	NC_017243	AT	3	6	485528	485533	50 %	50 %	0 %	0 %	384207939
15544	NC_017243	ATT	3	9	485544	485552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207939
15545	NC_017243	TCA	3	9	485566	485574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15546	NC_017243	A	6	6	485587	485592	100 %	0 %	0 %	0 %	384207939
15547	NC_017243	GAA	2	6	485626	485631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207939
15548	NC_017243	TTC	3	9	485637	485645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15549	NC_017243	T	7	7	485646	485652	0 %	100 %	0 %	0 %	384207939
15550	NC_017243	TCT	2	6	485662	485667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15551	NC_017243	ATC	2	6	485709	485714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15552	NC_017243	ATC	2	6	485718	485723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15553	NC_017243	ATC	2	6	485730	485735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15554	NC_017243	TTA	2	6	485767	485772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207939
15555	NC_017243	TTC	2	6	485787	485792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15556	NC_017243	TTC	2	6	485796	485801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15557	NC_017243	ATC	2	6	485805	485810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15558	NC_017243	TCA	2	6	485830	485835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15559	NC_017243	TCT	2	6	485860	485865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15560	NC_017243	ATC	3	9	485871	485879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15561	NC_017243	AT	3	6	485882	485887	50 %	50 %	0 %	0 %	384207939
15562	NC_017243	TCA	2	6	485908	485913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
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15564	NC_017243	TCT	2	6	485950	485955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15565	NC_017243	TTA	2	6	485959	485964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207939
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15620	NC_017243	AGT	2	6	487083	487088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207939
15621	NC_017243	ATC	2	6	487089	487094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15622	NC_017243	CAT	2	6	487121	487126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
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15624	NC_017243	ATT	2	6	487152	487157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207939
15625	NC_017243	TCA	2	6	487162	487167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15626	NC_017243	TCA	3	9	487210	487218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
15627	NC_017243	GAT	2	6	487246	487251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207939
15628	NC_017243	TCT	2	6	487255	487260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207939
15629	NC_017243	ATCTTC	2	12	487269	487280	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384207939
15630	NC_017243	TCA	2	6	487285	487290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207939
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15651	NC_017243	CTAT	2	8	487870	487877	25 %	50 %	0 %	25 %	384207939
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15668	NC_017243	TAA	2	6	488414	488419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207939
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15682	NC_017243	T	7	7	488771	488777	0 %	100 %	0 %	0 %	384207940
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