MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017243	A	6	6	467522	467527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_017243	GA	3	6	467536	467541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_017243	TATTT	2	10	467567	467576	20 %	80 %	0 %	0 %	384207921
15004	NC_017243	ATTTTA	2	12	467577	467588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207921
15005	NC_017243	ACTC	2	8	467627	467634	25 %	25 %	0 %	50 %	384207921
15006	NC_017243	AGA	2	6	467664	467669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207921
15007	NC_017243	AAG	2	6	467737	467742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207921
15008	NC_017243	TGA	2	6	467750	467755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207921
15009	NC_017243	AAAC	2	8	467814	467821	75 %	0 %	0 %	25 %	384207921
15010	NC_017243	GGCTG	2	10	467829	467838	0 %	20 %	60 %	20 %	384207921
15011	NC_017243	TGT	2	6	467858	467863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207921
15012	NC_017243	TGC	2	6	468047	468052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207921
15013	NC_017243	GGAAG	2	10	468060	468069	40 %	0 %	60 %	0 %	384207921
15014	NC_017243	TTA	2	6	468084	468089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207921
15015	NC_017243	A	6	6	468093	468098	100 %	0 %	0 %	0 %	384207921
15016	NC_017243	GAT	2	6	468182	468187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207921
15017	NC_017243	ACGT	2	8	468208	468215	25 %	25 %	25 %	25 %	384207921
15018	NC_017243	CTT	2	6	468226	468231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207921
15019	NC_017243	AAT	4	12	468235	468246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207921
15020	NC_017243	TAA	2	6	468269	468274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_017243	TTTA	2	8	468285	468292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_017243	TTAAT	2	10	468301	468310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_017243	ATT	2	6	468314	468319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_017243	ATA	2	6	468324	468329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_017243	CTA	2	6	468330	468335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207922
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15027	NC_017243	TTA	2	6	468372	468377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207922
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15029	NC_017243	AG	3	6	468449	468454	50 %	0 %	50 %	0 %	384207922
15030	NC_017243	TAA	2	6	468463	468468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15031	NC_017243	ATA	2	6	468500	468505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15032	NC_017243	CTA	2	6	468552	468557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207922
15033	NC_017243	ATA	2	6	468639	468644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15034	NC_017243	T	6	6	468655	468660	0 %	100 %	0 %	0 %	384207922
15035	NC_017243	CAG	2	6	468682	468687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207922
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15037	NC_017243	TAA	2	6	468709	468714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15038	NC_017243	GAG	2	6	468719	468724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207922
15039	NC_017243	TA	4	8	468733	468740	50 %	50 %	0 %	0 %	384207922
15040	NC_017243	GAG	2	6	468758	468763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207922
15041	NC_017243	ATA	2	6	468828	468833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15042	NC_017243	TA	3	6	468875	468880	50 %	50 %	0 %	0 %	384207922
15043	NC_017243	AGA	2	6	468884	468889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207922
15044	NC_017243	TAGT	2	8	468915	468922	25 %	50 %	25 %	0 %	384207922
15045	NC_017243	AGAA	2	8	468973	468980	75 %	0 %	25 %	0 %	384207922
15046	NC_017243	TTC	2	6	469026	469031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207922
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15050	NC_017243	TAA	2	6	469132	469137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207922
15051	NC_017243	AGA	2	6	469138	469143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207922
15052	NC_017243	A	7	7	469147	469153	100 %	0 %	0 %	0 %	384207922
15053	NC_017243	TA	3	6	469263	469268	50 %	50 %	0 %	0 %	384207922
15054	NC_017243	TTA	3	9	469292	469300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_017243	AGT	2	6	469345	469350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017243	TA	3	6	469360	469365	50 %	50 %	0 %	0 %	384207923
15057	NC_017243	A	8	8	469372	469379	100 %	0 %	0 %	0 %	384207923
15058	NC_017243	ATA	3	9	469385	469393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207923
15059	NC_017243	TAAA	2	8	469403	469410	75 %	25 %	0 %	0 %	384207923
15060	NC_017243	A	6	6	469408	469413	100 %	0 %	0 %	0 %	384207923
15061	NC_017243	T	6	6	469419	469424	0 %	100 %	0 %	0 %	384207923
15062	NC_017243	ATTT	2	8	469427	469434	25 %	75 %	0 %	0 %	384207923
15063	NC_017243	T	6	6	469432	469437	0 %	100 %	0 %	0 %	384207923
15064	NC_017243	TAA	3	9	469535	469543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207923
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15089	NC_017243	TAT	2	6	470504	470509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207925
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15094	NC_017243	A	7	7	470726	470732	100 %	0 %	0 %	0 %	384207925
15095	NC_017243	TA	3	6	470736	470741	50 %	50 %	0 %	0 %	384207925
15096	NC_017243	TA	3	6	470755	470760	50 %	50 %	0 %	0 %	384207925
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15105	NC_017243	GTT	2	6	471060	471065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207925
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15112	NC_017243	ATATA	2	10	471473	471482	60 %	40 %	0 %	0 %	384207925
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15120	NC_017243	T	6	6	471741	471746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_017243	AT	3	6	471755	471760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_017243	ATT	2	6	471768	471773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15496	NC_017243	TCTTTT	2	12	483954	483965	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384207937
15497	NC_017243	CAT	2	6	484033	484038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207937
15498	NC_017243	GAT	2	6	484045	484050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207937
15499	NC_017243	AT	3	6	484060	484065	50 %	50 %	0 %	0 %	384207937
15500	NC_017243	TTA	2	6	484114	484119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207937

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