MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017243	TA	4	8	451479	451486	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14502	NC_017243	ATC	2	6	451500	451505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207909
14503	NC_017243	CTTG	2	8	451522	451529	0 %	50 %	25 %	25 %	384207909
14504	NC_017243	GCT	2	6	451537	451542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207909
14505	NC_017243	ATA	2	6	451548	451553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207909
14506	NC_017243	AT	3	6	451574	451579	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14507	NC_017243	TCC	2	6	451588	451593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207909
14508	NC_017243	AAT	2	6	451661	451666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207909
14509	NC_017243	ATT	2	6	451674	451679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207909
14510	NC_017243	AGC	2	6	451710	451715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207909
14511	NC_017243	CTT	2	6	451753	451758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207909
14512	NC_017243	T	6	6	451765	451770	0 %	100 %	0 %	0 %	384207909
14513	NC_017243	GAAA	2	8	451788	451795	75 %	0 %	25 %	0 %	384207909
14514	NC_017243	AGG	2	6	451845	451850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207909
14515	NC_017243	CTCTC	2	10	451851	451860	0 %	40 %	0 %	60 %	384207909
14516	NC_017243	ATAC	2	8	451918	451925	50 %	25 %	0 %	25 %	384207909
14517	NC_017243	AAT	2	6	451927	451932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207909
14518	NC_017243	CTG	2	6	451940	451945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384207909
14519	NC_017243	TA	3	6	451962	451967	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14520	NC_017243	TAT	2	6	451970	451975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207909
14521	NC_017243	AT	3	6	451997	452002	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14522	NC_017243	AGG	2	6	452022	452027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384207909
14523	NC_017243	TTGC	2	8	452038	452045	0 %	50 %	25 %	25 %	384207909
14524	NC_017243	TA	3	6	452094	452099	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14525	NC_017243	TTTC	2	8	452155	452162	0 %	75 %	0 %	25 %	384207909
14526	NC_017243	TCT	2	6	452175	452180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207909
14527	NC_017243	AAG	3	9	452211	452219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207909
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14529	NC_017243	TCTG	2	8	452298	452305	0 %	50 %	25 %	25 %	384207909
14530	NC_017243	T	6	6	452318	452323	0 %	100 %	0 %	0 %	384207909
14531	NC_017243	TTA	2	6	452339	452344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207909
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14533	NC_017243	TA	4	8	452385	452392	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14534	NC_017243	TA	3	6	452406	452411	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14535	NC_017243	TAAA	2	8	452483	452490	75 %	25 %	0 %	0 %	384207909
14536	NC_017243	AGC	2	6	452517	452522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207909
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14538	NC_017243	ATTG	2	8	452607	452614	25 %	50 %	25 %	0 %	384207909
14539	NC_017243	TTAT	2	8	452662	452669	25 %	75 %	0 %	0 %	384207909
14540	NC_017243	CAA	2	6	452744	452749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207909
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14543	NC_017243	ATC	2	6	452820	452825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207909
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14545	NC_017243	AAT	2	6	452843	452848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207909
14546	NC_017243	TA	3	6	452873	452878	50 %	50 %	0 %	0 %	384207909
14547	NC_017243	CAA	2	6	452891	452896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207909
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14551	NC_017243	ATA	2	6	452969	452974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207909
14552	NC_017243	ATT	3	9	452995	453003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207909
14553	NC_017243	CAT	2	6	453042	453047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207910
14554	NC_017243	ACA	2	6	453080	453085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207910
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14557	NC_017243	TAT	2	6	453192	453197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207910
14558	NC_017243	ATA	2	6	453222	453227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207910
14559	NC_017243	TACT	2	8	453261	453268	25 %	50 %	0 %	25 %	384207910
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14570	NC_017243	AAGTA	2	10	453559	453568	60 %	20 %	20 %	0 %	384207910
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14582	NC_017243	T	6	6	453932	453937	0 %	100 %	0 %	0 %	384207911
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14595	NC_017243	T	7	7	454194	454200	0 %	100 %	0 %	0 %	384207911
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14606	NC_017243	TAATT	2	10	454505	454514	40 %	60 %	0 %	0 %	384207911
14607	NC_017243	T	7	7	454535	454541	0 %	100 %	0 %	0 %	384207911
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14610	NC_017243	CAT	2	6	454629	454634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207911
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14618	NC_017243	T	7	7	454849	454855	0 %	100 %	0 %	0 %	384207911
14619	NC_017243	TTA	2	6	454949	454954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_017243	TAT	2	6	454971	454976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_017243	TAC	2	6	454978	454983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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