MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017243	ATG	2	6	386737	386742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207852
12503	NC_017243	AT	3	6	386744	386749	50 %	50 %	0 %	0 %	384207852
12504	NC_017243	GAA	2	6	386757	386762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207852
12505	NC_017243	TACT	2	8	386784	386791	25 %	50 %	0 %	25 %	384207852
12506	NC_017243	AT	3	6	386830	386835	50 %	50 %	0 %	0 %	384207852
12507	NC_017243	A	7	7	386864	386870	100 %	0 %	0 %	0 %	384207852
12508	NC_017243	ATG	2	6	386905	386910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207852
12509	NC_017243	ATG	2	6	386932	386937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207852
12510	NC_017243	ATG	3	9	386962	386970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207852
12511	NC_017243	A	6	6	386976	386981	100 %	0 %	0 %	0 %	384207852
12512	NC_017243	AGA	2	6	387002	387007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207852
12513	NC_017243	AAT	2	6	387042	387047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207852
12514	NC_017243	A	6	6	387106	387111	100 %	0 %	0 %	0 %	384207852
12515	NC_017243	TTA	2	6	387145	387150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207852
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12517	NC_017243	TAA	2	6	387206	387211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207852
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12519	NC_017243	ATA	2	6	387258	387263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207852
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12525	NC_017243	A	7	7	387502	387508	100 %	0 %	0 %	0 %	384207853
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12534	NC_017243	TGA	2	6	387739	387744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207853
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12540	NC_017243	A	7	7	387959	387965	100 %	0 %	0 %	0 %	384207853
12541	NC_017243	ATA	2	6	388056	388061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_017243	A	6	6	388088	388093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017243	TAAT	2	8	388104	388111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_017243	TGGG	2	8	388115	388122	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_017243	CATT	2	8	388123	388130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12546	NC_017243	AT	3	6	388149	388154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12553	NC_017243	ATA	2	6	388359	388364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12555	NC_017243	TA	3	6	388406	388411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_017243	TTA	2	6	388509	388514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12558	NC_017243	TA	3	6	388566	388571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017243	TA	3	6	388588	388593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_017243	CAT	2	6	388612	388617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207854
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12579	NC_017243	T	6	6	389285	389290	0 %	100 %	0 %	0 %	384207854
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12582	NC_017243	AT	3	6	389399	389404	50 %	50 %	0 %	0 %	384207854
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12589	NC_017243	TTA	2	6	389625	389630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_017243	T	6	6	389654	389659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_017243	TA	4	8	389729	389736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_017243	TGCG	2	8	389753	389760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12594	NC_017243	GT	3	6	389761	389766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017243	TAAAA	2	10	389778	389787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017243	TGGG	2	8	389791	389798	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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12598	NC_017243	A	6	6	389893	389898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_017243	ATT	2	6	389904	389909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017243	A	6	6	389927	389932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017243	T	6	6	389943	389948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017243	TCA	2	6	389953	389958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12605	NC_017243	TTAG	2	8	390061	390068	25 %	50 %	25 %	0 %	384207855
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12608	NC_017243	ATATT	2	10	390245	390254	40 %	60 %	0 %	0 %	384207855
12609	NC_017243	TCTGT	2	10	390275	390284	0 %	60 %	20 %	20 %	384207855
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12613	NC_017243	CAA	2	6	390411	390416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384207855
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12997	NC_017243	TAA	2	6	402755	402760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207866
12998	NC_017243	CTT	2	6	402794	402799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207866
12999	NC_017243	T	6	6	402798	402803	0 %	100 %	0 %	0 %	384207866
13000	NC_017243	AAT	2	6	402806	402811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207866

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