MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017243	TAT	2	6	343506	343511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207813
11003	NC_017243	TAA	2	6	343567	343572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207813
11004	NC_017243	ATG	2	6	343587	343592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207813
11005	NC_017243	TAT	2	6	343606	343611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207813
11006	NC_017243	ATA	2	6	343617	343622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207813
11007	NC_017243	ATA	2	6	343635	343640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207813
11008	NC_017243	AT	3	6	343683	343688	50 %	50 %	0 %	0 %	384207813
11009	NC_017243	A	6	6	343713	343718	100 %	0 %	0 %	0 %	384207813
11010	NC_017243	A	6	6	343728	343733	100 %	0 %	0 %	0 %	384207813
11011	NC_017243	TAAA	2	8	343766	343773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017243	TA	3	6	343786	343791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_017243	TAT	2	6	343805	343810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017243	ATT	2	6	343815	343820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207814
11015	NC_017243	T	6	6	343828	343833	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11016	NC_017243	AT	3	6	343834	343839	50 %	50 %	0 %	0 %	384207814
11017	NC_017243	TCTGT	2	10	343844	343853	0 %	60 %	20 %	20 %	384207814
11018	NC_017243	T	6	6	343855	343860	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11019	NC_017243	CAT	2	6	343871	343876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207814
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11023	NC_017243	T	8	8	344017	344024	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11024	NC_017243	T	8	8	344033	344040	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11025	NC_017243	A	7	7	344058	344064	100 %	0 %	0 %	0 %	384207814
11026	NC_017243	A	6	6	344086	344091	100 %	0 %	0 %	0 %	384207814
11027	NC_017243	AAG	2	6	344156	344161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207814
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11029	NC_017243	TTTC	2	8	344202	344209	0 %	75 %	0 %	25 %	384207814
11030	NC_017243	ATGT	2	8	344227	344234	25 %	50 %	25 %	0 %	384207814
11031	NC_017243	ATA	2	6	344289	344294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
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11034	NC_017243	TTCA	2	8	344343	344350	25 %	50 %	0 %	25 %	384207814
11035	NC_017243	CAT	2	6	344406	344411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207814
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11038	NC_017243	TTTA	2	8	344481	344488	25 %	75 %	0 %	0 %	384207814
11039	NC_017243	T	6	6	344510	344515	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11040	NC_017243	ATA	2	6	344562	344567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
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11046	NC_017243	TAA	2	6	344699	344704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
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11049	NC_017243	ATT	2	6	344874	344879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207814
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11051	NC_017243	T	6	6	344889	344894	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11052	NC_017243	T	6	6	344896	344901	0 %	100 %	0 %	0 %	384207814
11053	NC_017243	ATA	2	6	344902	344907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207814
11054	NC_017243	TTC	2	6	344908	344913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207814
11055	NC_017243	AAT	2	6	344918	344923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017243	TTA	2	6	344928	344933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_017243	ATT	2	6	344945	344950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_017243	ATT	2	6	344962	344967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207815
11059	NC_017243	ATA	2	6	344996	345001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207815
11060	NC_017243	ATC	2	6	345008	345013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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11062	NC_017243	TTC	3	9	345074	345082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207815
11063	NC_017243	AGT	2	6	345098	345103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207815
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11065	NC_017243	CCG	2	6	345228	345233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384207815
11066	NC_017243	TGCT	2	8	345253	345260	0 %	50 %	25 %	25 %	384207815
11067	NC_017243	ATC	2	6	345314	345319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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11069	NC_017243	TGAA	2	8	345396	345403	50 %	25 %	25 %	0 %	384207815
11070	NC_017243	TCA	2	6	345492	345497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207815
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11072	NC_017243	ATT	2	6	345597	345602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207815
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11082	NC_017243	AGT	2	6	346160	346165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207815
11083	NC_017243	CTC	2	6	346180	346185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384207815
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11085	NC_017243	TAAAA	2	10	346286	346295	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_017243	A	7	7	346292	346298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_017243	GCC	2	6	346299	346304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_017243	A	6	6	346336	346341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_017243	ATT	3	9	346345	346353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11093	NC_017243	TAA	2	6	346453	346458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017243	TA	3	6	346471	346476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017243	ATT	2	6	346487	346492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_017243	TAAT	2	8	346501	346508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_017243	TA	3	6	346520	346525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_017243	TG	3	6	346634	346639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_017243	AT	3	6	346666	346671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_017243	ATAAA	2	10	346679	346688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_017243	GTT	2	6	346689	346694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_017243	TA	4	8	346695	346702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_017243	A	6	6	346705	346710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017243	ATT	2	6	346715	346720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_017243	T	6	6	346731	346736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_017243	A	6	6	346744	346749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017243	A	6	6	346755	346760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017243	AT	3	6	346801	346806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_017243	GTT	2	6	346839	346844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017243	A	7	7	346931	346937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017243	A	7	7	346971	346977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017243	T	6	6	346998	347003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_017243	A	6	6	347066	347071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_017243	AGCTT	2	10	347074	347083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11115	NC_017243	TTAA	2	8	347084	347091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017243	TAA	2	6	347116	347121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017243	TATAA	2	10	347134	347143	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_017243	TTG	2	6	347164	347169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384207816
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11123	NC_017243	T	8	8	347236	347243	0 %	100 %	0 %	0 %	384207816
11124	NC_017243	TAT	2	6	347265	347270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207816
11125	NC_017243	T	6	6	347270	347275	0 %	100 %	0 %	0 %	384207816
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