MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017243	TAT	2	6	280072	280077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017243	CGC	2	6	280105	280110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_017243	AAC	2	6	280150	280155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_017243	A	7	7	280156	280162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017243	TA	3	6	280189	280194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017243	GCCC	2	8	280210	280217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9007	NC_017243	TTTATA	2	12	280218	280229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_017243	T	6	6	280278	280283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_017243	T	7	7	280299	280305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_017243	TAT	2	6	280337	280342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_017243	TAT	2	6	280379	280384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9012	NC_017243	AATT	2	8	280385	280392	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9013	NC_017243	AT	3	6	280413	280418	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9014	NC_017243	A	6	6	280579	280584	100 %	0 %	0 %	0 %	384207753
9015	NC_017243	ATAC	2	8	280592	280599	50 %	25 %	0 %	25 %	384207753
9016	NC_017243	TAAG	2	8	280609	280616	50 %	25 %	25 %	0 %	384207753
9017	NC_017243	TGAA	2	8	280622	280629	50 %	25 %	25 %	0 %	384207753
9018	NC_017243	TAA	2	6	280661	280666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9019	NC_017243	TTTTTA	2	12	280781	280792	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384207753
9020	NC_017243	TA	3	6	280791	280796	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9021	NC_017243	TATT	2	8	280874	280881	25 %	75 %	0 %	0 %	384207753
9022	NC_017243	TATT	2	8	280915	280922	25 %	75 %	0 %	0 %	384207753
9023	NC_017243	CAT	2	6	280923	280928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207753
9024	NC_017243	A	7	7	280938	280944	100 %	0 %	0 %	0 %	384207753
9025	NC_017243	AT	3	6	280949	280954	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9026	NC_017243	TTA	2	6	280955	280960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
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9028	NC_017243	TAT	2	6	281007	281012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9029	NC_017243	TTAAAA	2	12	281020	281031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9030	NC_017243	TAA	2	6	281034	281039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9031	NC_017243	TATAA	2	10	281048	281057	60 %	40 %	0 %	0 %	384207753
9032	NC_017243	ATA	2	6	281060	281065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9033	NC_017243	AT	3	6	281126	281131	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9034	NC_017243	TAA	2	6	281148	281153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9035	NC_017243	A	6	6	281152	281157	100 %	0 %	0 %	0 %	384207753
9036	NC_017243	TAT	2	6	281172	281177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9037	NC_017243	ATG	2	6	281189	281194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207753
9038	NC_017243	T	6	6	281195	281200	0 %	100 %	0 %	0 %	384207753
9039	NC_017243	AGA	2	6	281223	281228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207753
9040	NC_017243	AGA	2	6	281232	281237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384207753
9041	NC_017243	A	6	6	281250	281255	100 %	0 %	0 %	0 %	384207753
9042	NC_017243	A	6	6	281264	281269	100 %	0 %	0 %	0 %	384207753
9043	NC_017243	TA	3	6	281277	281282	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9044	NC_017243	ATC	2	6	281283	281288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207753
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9046	NC_017243	TAT	2	6	281355	281360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9047	NC_017243	ATT	2	6	281365	281370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9048	NC_017243	ATG	2	6	281378	281383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384207753
9049	NC_017243	ATA	2	6	281393	281398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207753
9050	NC_017243	TTGT	2	8	281412	281419	0 %	75 %	25 %	0 %	384207753
9051	NC_017243	TAT	2	6	281426	281431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9052	NC_017243	CTA	2	6	281552	281557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207753
9053	NC_017243	AAAT	2	8	281564	281571	75 %	25 %	0 %	0 %	384207753
9054	NC_017243	TA	3	6	281588	281593	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9055	NC_017243	AT	3	6	281603	281608	50 %	50 %	0 %	0 %	384207753
9056	NC_017243	AATAA	2	10	281617	281626	80 %	20 %	0 %	0 %	384207753
9057	NC_017243	TTA	2	6	281636	281641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207753
9058	NC_017243	TAA	2	6	281694	281699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017243	AT	3	6	281789	281794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_017243	TATT	2	8	281832	281839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_017243	TA	3	6	281846	281851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017243	TAA	2	6	281853	281858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_017243	A	6	6	281857	281862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_017243	A	6	6	281873	281878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_017243	TTA	2	6	281889	281894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_017243	A	6	6	281894	281899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_017243	ATT	2	6	281907	281912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017243	ATC	2	6	281936	281941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207754
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9073	NC_017243	ATT	2	6	282131	282136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207754
9074	NC_017243	ATC	2	6	282292	282297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207754
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9080	NC_017243	AT	5	10	282547	282556	50 %	50 %	0 %	0 %	384207754
9081	NC_017243	GCA	2	6	282566	282571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207754
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9085	NC_017243	CATT	2	8	282800	282807	25 %	50 %	0 %	25 %	384207754
9086	NC_017243	TTCT	2	8	282849	282856	0 %	75 %	0 %	25 %	384207754
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9089	NC_017243	AT	3	6	282881	282886	50 %	50 %	0 %	0 %	384207754
9090	NC_017243	TAATG	2	10	282912	282921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_017243	TTAA	2	8	282952	282959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_017243	A	7	7	282966	282972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017243	TAA	3	9	282981	282989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_017243	T	6	6	282993	282998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_017243	ATT	2	6	283022	283027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_017243	ATG	2	6	283050	283055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_017243	TAA	2	6	283075	283080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_017243	ATA	2	6	283085	283090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_017243	TA	3	6	283089	283094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_017243	A	6	6	283094	283099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_017243	ATTTTT	2	12	283126	283137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_017243	TAT	2	6	283138	283143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_017243	TAA	2	6	283147	283152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_017243	TAA	2	6	283248	283253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9107	NC_017243	TGG	2	6	283319	283324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017243	AGC	2	6	283374	283379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9110	NC_017243	ATT	2	6	283437	283442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_017243	CTT	2	6	283443	283448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_017243	TAT	2	6	283449	283454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_017243	TAA	2	6	283458	283463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017243	ATT	2	6	283547	283552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207755
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9116	NC_017243	ATA	2	6	283565	283570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384207755
9117	NC_017243	AT	4	8	283572	283579	50 %	50 %	0 %	0 %	384207755
9118	NC_017243	TCT	2	6	283600	283605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384207755
9119	NC_017243	CTATG	2	10	283634	283643	20 %	40 %	20 %	20 %	384207755
9120	NC_017243	TTA	2	6	283691	283696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384207755
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9125	NC_017243	AGC	2	6	283869	283874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384207755
9126	NC_017243	CT	3	6	283875	283880	0 %	50 %	0 %	50 %	384207755
9127	NC_017243	TCA	2	6	283904	283909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384207755
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