MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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91502	NC_017243	TAA	2	6	2909404	2909409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91503	NC_017243	TGC	2	6	2909429	2909434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210041
91504	NC_017243	A	6	6	2909457	2909462	100 %	0 %	0 %	0 %	384210041
91505	NC_017243	TTTCT	2	10	2909495	2909504	0 %	80 %	0 %	20 %	384210041
91506	NC_017243	AG	3	6	2909514	2909519	50 %	0 %	50 %	0 %	384210041
91507	NC_017243	AGA	2	6	2909549	2909554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210041
91508	NC_017243	AAAAT	2	10	2909557	2909566	80 %	20 %	0 %	0 %	384210041
91509	NC_017243	ATA	2	6	2909578	2909583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91510	NC_017243	CTT	2	6	2909597	2909602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210041
91511	NC_017243	ATG	2	6	2909679	2909684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210041
91512	NC_017243	TAA	2	6	2909710	2909715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91513	NC_017243	CTTT	2	8	2909734	2909741	0 %	75 %	0 %	25 %	384210041
91514	NC_017243	AAT	2	6	2909742	2909747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91515	NC_017243	AGTA	2	8	2909753	2909760	50 %	25 %	25 %	0 %	384210041
91516	NC_017243	AT	3	6	2909783	2909788	50 %	50 %	0 %	0 %	384210041
91517	NC_017243	GAA	2	6	2909880	2909885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210041
91518	NC_017243	GAA	3	9	2909925	2909933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210041
91519	NC_017243	A	6	6	2909932	2909937	100 %	0 %	0 %	0 %	384210041
91520	NC_017243	ACA	2	6	2910003	2910008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384210041
91521	NC_017243	TAA	2	6	2910020	2910025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91522	NC_017243	ATA	2	6	2910031	2910036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91523	NC_017243	A	7	7	2910045	2910051	100 %	0 %	0 %	0 %	384210041
91524	NC_017243	TGA	2	6	2910059	2910064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210041
91525	NC_017243	ATA	2	6	2910082	2910087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91526	NC_017243	ACT	3	9	2910126	2910134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210041
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91528	NC_017243	TAC	2	6	2910170	2910175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384210041
91529	NC_017243	A	6	6	2910177	2910182	100 %	0 %	0 %	0 %	384210041
91530	NC_017243	AAT	2	6	2910192	2910197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91531	NC_017243	ATA	2	6	2910223	2910228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91532	NC_017243	ATG	2	6	2910229	2910234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384210041
91533	NC_017243	TAA	2	6	2910247	2910252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91534	NC_017243	TAA	3	9	2910266	2910274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91535	NC_017243	AAT	2	6	2910282	2910287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91536	NC_017243	ATA	3	9	2910325	2910333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91537	NC_017243	GAAAA	2	10	2910334	2910343	80 %	0 %	20 %	0 %	384210041
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91539	NC_017243	AAT	2	6	2910390	2910395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91540	NC_017243	TAA	2	6	2910484	2910489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91541	NC_017243	ATA	2	6	2910508	2910513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91542	NC_017243	TGT	2	6	2910515	2910520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384210041
91543	NC_017243	AAT	3	9	2910531	2910539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
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91552	NC_017243	A	6	6	2910671	2910676	100 %	0 %	0 %	0 %	384210041
91553	NC_017243	ATA	3	9	2910691	2910699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
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91573	NC_017243	ATA	2	6	2911023	2911028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210041
91574	NC_017243	CTT	2	6	2911053	2911058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210041
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91578	NC_017243	CAG	2	6	2911268	2911273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210041
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91581	NC_017243	AT	3	6	2911314	2911319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91582	NC_017243	TA	4	8	2911326	2911333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91583	NC_017243	TTA	2	6	2911340	2911345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91584	NC_017243	TA	4	8	2911344	2911351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91585	NC_017243	GTAT	2	8	2911358	2911365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91586	NC_017243	AT	3	6	2911364	2911369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91589	NC_017243	AAT	2	6	2911435	2911440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384210042
91590	NC_017243	TTA	2	6	2911450	2911455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384210042
91591	NC_017243	AAG	2	6	2911461	2911466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384210042
91592	NC_017243	GAAG	2	8	2911498	2911505	50 %	0 %	50 %	0 %	384210042
91593	NC_017243	AT	3	6	2911648	2911653	50 %	50 %	0 %	0 %	384210042
91594	NC_017243	ATCTA	2	10	2911655	2911664	40 %	40 %	0 %	20 %	384210042
91595	NC_017243	TAAT	2	8	2911702	2911709	50 %	50 %	0 %	0 %	384210042
91596	NC_017243	ATTA	2	8	2911718	2911725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91597	NC_017243	ATA	2	6	2911731	2911736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91598	NC_017243	TAT	4	12	2911774	2911785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91599	NC_017243	TAA	2	6	2911794	2911799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91600	NC_017243	A	6	6	2911803	2911808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91601	NC_017243	TA	4	8	2911809	2911816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91602	NC_017243	TA	3	6	2911834	2911839	50 %	50 %	0 %	0 %	384210043
91603	NC_017243	A	7	7	2911845	2911851	100 %	0 %	0 %	0 %	384210043
91604	NC_017243	TCT	2	6	2911852	2911857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210043
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91607	NC_017243	TGTC	2	8	2912158	2912165	0 %	50 %	25 %	25 %	384210043
91608	NC_017243	TCC	2	6	2912189	2912194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384210043
91609	NC_017243	TTTC	2	8	2912223	2912230	0 %	75 %	0 %	25 %	384210043
91610	NC_017243	CTG	2	6	2912236	2912241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384210043
91611	NC_017243	CTT	2	6	2912325	2912330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210043
91612	NC_017243	T	6	6	2912338	2912343	0 %	100 %	0 %	0 %	384210043
91613	NC_017243	CTT	2	6	2912346	2912351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210043
91614	NC_017243	TCT	2	6	2912369	2912374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384210043
91615	NC_017243	T	6	6	2912374	2912379	0 %	100 %	0 %	0 %	384210043
91616	NC_017243	AGC	2	6	2912449	2912454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384210043
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91618	NC_017243	TA	3	6	2912491	2912496	50 %	50 %	0 %	0 %	384210043
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