MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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90002	NC_017243	AT	3	6	2859850	2859855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90003	NC_017243	AAAT	2	8	2859856	2859863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90004	NC_017243	TATAA	2	10	2859877	2859886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90005	NC_017243	A	6	6	2859901	2859906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90006	NC_017243	AATC	2	8	2859916	2859923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90007	NC_017243	TAA	2	6	2859931	2859936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90008	NC_017243	TTAAT	2	10	2859945	2859954	40 %	60 %	0 %	0 %	384209983
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90010	NC_017243	TTA	2	6	2860046	2860051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209983
90011	NC_017243	TGT	2	6	2860077	2860082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384209983
90012	NC_017243	ATA	2	6	2860181	2860186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209983
90013	NC_017243	ATT	2	6	2860209	2860214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209983
90014	NC_017243	TAT	2	6	2860232	2860237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209983
90015	NC_017243	ATT	2	6	2860260	2860265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209983
90016	NC_017243	ATA	2	6	2860317	2860322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209983
90017	NC_017243	ATA	2	6	2860345	2860350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209983
90018	NC_017243	AT	3	6	2860403	2860408	50 %	50 %	0 %	0 %	384209983
90019	NC_017243	ACATAA	2	12	2860444	2860455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384209983
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90021	NC_017243	TTG	2	6	2860522	2860527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384209983
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90025	NC_017243	GTA	2	6	2860621	2860626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209983
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90032	NC_017243	T	6	6	2860716	2860721	0 %	100 %	0 %	0 %	384209983
90033	NC_017243	ATA	2	6	2860726	2860731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209983
90034	NC_017243	TAAA	2	8	2860742	2860749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90035	NC_017243	A	6	6	2860747	2860752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90036	NC_017243	TAA	2	6	2860850	2860855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90037	NC_017243	T	6	6	2860861	2860866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90038	NC_017243	AATAA	2	10	2860881	2860890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90039	NC_017243	ATT	2	6	2860898	2860903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90040	NC_017243	A	6	6	2860904	2860909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90043	NC_017243	A	6	6	2860946	2860951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90044	NC_017243	TAGA	2	8	2860953	2860960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90045	NC_017243	GATGC	4	20	2860968	2860987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90046	NC_017243	AAACA	2	10	2860999	2861008	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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90048	NC_017243	T	6	6	2861024	2861029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90050	NC_017243	ATT	2	6	2861054	2861059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90051	NC_017243	AAT	2	6	2861086	2861091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90052	NC_017243	TAA	2	6	2861101	2861106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90053	NC_017243	T	6	6	2861116	2861121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90055	NC_017243	TAA	2	6	2861150	2861155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90056	NC_017243	ATT	2	6	2861158	2861163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90057	NC_017243	C	8	8	2861170	2861177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90058	NC_017243	CACC	2	8	2861248	2861255	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90059	NC_017243	GTT	2	6	2861259	2861264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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90061	NC_017243	TAA	2	6	2861306	2861311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90062	NC_017243	TAAT	2	8	2861314	2861321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90063	NC_017243	ATT	2	6	2861327	2861332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90064	NC_017243	TGCG	2	8	2861360	2861367	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90065	NC_017243	AAAT	2	8	2861386	2861393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90066	NC_017243	TGGG	2	8	2861396	2861403	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90067	NC_017243	ATAA	2	8	2861420	2861427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90070	NC_017243	ATT	2	6	2861448	2861453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90072	NC_017243	TA	3	6	2861468	2861473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90073	NC_017243	A	6	6	2861495	2861500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90099	NC_017243	TCT	3	9	2862059	2862067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209984
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90107	NC_017243	ATTTT	2	10	2862232	2862241	20 %	80 %	0 %	0 %	384209985
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90114	NC_017243	TCTA	2	8	2862330	2862337	25 %	50 %	0 %	25 %	384209985
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