MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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73002	NC_017243	TTA	2	6	2323402	2323407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209493
73003	NC_017243	TAT	2	6	2323417	2323422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209494
73004	NC_017243	AT	3	6	2323425	2323430	50 %	50 %	0 %	0 %	384209494
73005	NC_017243	ATT	2	6	2323443	2323448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209494
73006	NC_017243	TAT	2	6	2323497	2323502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209494
73007	NC_017243	AT	3	6	2323505	2323510	50 %	50 %	0 %	0 %	384209494
73008	NC_017243	AAAGA	2	10	2323722	2323731	80 %	0 %	20 %	0 %	384209494
73009	NC_017243	CAG	2	6	2323763	2323768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209494
73010	NC_017243	TAAT	2	8	2323939	2323946	50 %	50 %	0 %	0 %	384209494
73011	NC_017243	A	7	7	2323987	2323993	100 %	0 %	0 %	0 %	384209494
73012	NC_017243	AT	3	6	2324054	2324059	50 %	50 %	0 %	0 %	384209494
73013	NC_017243	GTATA	2	10	2324075	2324084	40 %	40 %	20 %	0 %	384209494
73014	NC_017243	T	6	6	2324121	2324126	0 %	100 %	0 %	0 %	384209494
73015	NC_017243	TTC	2	6	2324156	2324161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209495
73016	NC_017243	TCA	2	6	2324171	2324176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209495
73017	NC_017243	AGG	2	6	2324197	2324202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384209495
73018	NC_017243	GCT	2	6	2324210	2324215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384209495
73019	NC_017243	TA	3	6	2324308	2324313	50 %	50 %	0 %	0 %	384209495
73020	NC_017243	TTTC	2	8	2324321	2324328	0 %	75 %	0 %	25 %	384209495
73021	NC_017243	ATT	4	12	2324348	2324359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209495
73022	NC_017243	TAT	2	6	2324395	2324400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209495
73023	NC_017243	TC	3	6	2324440	2324445	0 %	50 %	0 %	50 %	384209495
73024	NC_017243	TCTT	2	8	2324557	2324564	0 %	75 %	0 %	25 %	384209495
73025	NC_017243	T	6	6	2324641	2324646	0 %	100 %	0 %	0 %	384209495
73026	NC_017243	ATT	2	6	2324648	2324653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209495
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73028	NC_017243	AT	3	6	2324707	2324712	50 %	50 %	0 %	0 %	384209495
73029	NC_017243	AGT	2	6	2324761	2324766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209495
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73032	NC_017243	ATTA	2	8	2324892	2324899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73033	NC_017243	ATA	2	6	2324923	2324928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73034	NC_017243	TTA	3	9	2324941	2324949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73035	NC_017243	AAT	2	6	2324980	2324985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73036	NC_017243	A	6	6	2324990	2324995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73037	NC_017243	TA	3	6	2325071	2325076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73039	NC_017243	ATCGC	18	90	2325088	2325177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73040	NC_017243	TA	3	6	2325207	2325212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73041	NC_017243	T	6	6	2325223	2325228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73042	NC_017243	A	7	7	2325239	2325245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73043	NC_017243	TA	3	6	2325273	2325278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73044	NC_017243	TTA	2	6	2325279	2325284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73045	NC_017243	AAAT	2	8	2325288	2325295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73046	NC_017243	ATT	2	6	2325310	2325315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73047	NC_017243	T	6	6	2325350	2325355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73049	NC_017243	A	6	6	2325408	2325413	100 %	0 %	0 %	0 %	384209496
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73051	NC_017243	TATTT	2	10	2325422	2325431	20 %	80 %	0 %	0 %	384209496
73052	NC_017243	TGTT	2	8	2325442	2325449	0 %	75 %	25 %	0 %	384209496
73053	NC_017243	CAT	2	6	2325460	2325465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209496
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73055	NC_017243	AAT	2	6	2325519	2325524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209496
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73058	NC_017243	TGAA	2	8	2325586	2325593	50 %	25 %	25 %	0 %	384209496
73059	NC_017243	A	6	6	2325592	2325597	100 %	0 %	0 %	0 %	384209496
73060	NC_017243	TGA	2	6	2325599	2325604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209496
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73115	NC_017243	TA	3	6	2327752	2327757	50 %	50 %	0 %	0 %	384209497
73116	NC_017243	AT	3	6	2327764	2327769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73119	NC_017243	T	7	7	2327827	2327833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73120	NC_017243	T	6	6	2327851	2327856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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