MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
69501	NC_017243	A	7	7	2211894	2211900	100 %	0 %	0 %	0 %	384209405
69502	NC_017243	GTAAA	2	10	2211913	2211922	60 %	20 %	20 %	0 %	384209405
69503	NC_017243	TAAA	2	8	2211932	2211939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69504	NC_017243	T	6	6	2211982	2211987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69505	NC_017243	ATAA	2	8	2211991	2211998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69506	NC_017243	TA	3	6	2212000	2212005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69507	NC_017243	TA	4	8	2212011	2212018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69508	NC_017243	CGC	2	6	2212063	2212068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69509	NC_017243	ATTAA	2	10	2212144	2212153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69510	NC_017243	CTT	2	6	2212174	2212179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69511	NC_017243	CAA	2	6	2212185	2212190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69512	NC_017243	AAG	2	6	2212191	2212196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69513	NC_017243	ATAAAA	2	12	2212222	2212233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69514	NC_017243	ATTA	2	8	2212282	2212289	50 %	50 %	0 %	0 %	384209406
69515	NC_017243	TAT	2	6	2212292	2212297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209406
69516	NC_017243	CAT	2	6	2212305	2212310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209406
69517	NC_017243	AGTA	2	8	2212314	2212321	50 %	25 %	25 %	0 %	384209406
69518	NC_017243	AGCA	2	8	2212467	2212474	50 %	0 %	25 %	25 %	384209406
69519	NC_017243	T	6	6	2212481	2212486	0 %	100 %	0 %	0 %	384209406
69520	NC_017243	TTA	2	6	2212492	2212497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209406
69521	NC_017243	TA	3	6	2212500	2212505	50 %	50 %	0 %	0 %	384209406
69522	NC_017243	CTT	2	6	2212514	2212519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209406
69523	NC_017243	AAT	2	6	2212557	2212562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209406
69524	NC_017243	CTT	2	6	2212595	2212600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209406
69525	NC_017243	TTC	2	6	2212658	2212663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209406
69526	NC_017243	T	8	8	2212774	2212781	0 %	100 %	0 %	0 %	384209406
69527	NC_017243	T	6	6	2212819	2212824	0 %	100 %	0 %	0 %	384209406
69528	NC_017243	CTT	2	6	2212895	2212900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209406
69529	NC_017243	ACTTT	2	10	2212936	2212945	20 %	60 %	0 %	20 %	384209406
69530	NC_017243	CAT	2	6	2212949	2212954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209406
69531	NC_017243	CTT	2	6	2212978	2212983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209406
69532	NC_017243	AGA	2	6	2212989	2212994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209406
69533	NC_017243	CTC	2	6	2213075	2213080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384209406
69534	NC_017243	TTACAA	2	12	2213081	2213092	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384209406
69535	NC_017243	TAAA	2	8	2213102	2213109	75 %	25 %	0 %	0 %	384209406
69536	NC_017243	ATA	2	6	2213113	2213118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209406
69537	NC_017243	AATAA	2	10	2213119	2213128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69538	NC_017243	TAA	2	6	2213191	2213196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209407
69539	NC_017243	CAG	2	6	2213207	2213212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209407
69540	NC_017243	TC	3	6	2213234	2213239	0 %	50 %	0 %	50 %	384209407
69541	NC_017243	ACCATA	2	12	2213253	2213264	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384209407
69542	NC_017243	TAA	2	6	2213285	2213290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209407
69543	NC_017243	AAT	2	6	2213323	2213328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209407
69544	NC_017243	AAC	2	6	2213406	2213411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209407
69545	NC_017243	AGC	2	6	2213469	2213474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209407
69546	NC_017243	TATTT	2	10	2213478	2213487	20 %	80 %	0 %	0 %	384209407
69547	NC_017243	TCA	2	6	2213497	2213502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209407
69548	NC_017243	TCTT	2	8	2213647	2213654	0 %	75 %	0 %	25 %	384209407
69549	NC_017243	CT	3	6	2213669	2213674	0 %	50 %	0 %	50 %	384209407
69550	NC_017243	TAA	2	6	2213690	2213695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209407
69551	NC_017243	AGT	2	6	2213715	2213720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209407
69552	NC_017243	TGA	2	6	2213752	2213757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209407
69553	NC_017243	ATT	2	6	2213758	2213763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209407
69554	NC_017243	TCA	3	9	2213767	2213775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209407
69555	NC_017243	AAG	2	6	2213837	2213842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209407
69556	NC_017243	CAG	2	6	2213843	2213848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209407
69557	NC_017243	TAC	2	6	2213874	2213879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209407
69558	NC_017243	TAT	3	9	2213957	2213965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209407
69559	NC_017243	CAA	2	6	2213996	2214001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209407
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69561	NC_017243	AGCA	2	8	2214102	2214109	50 %	0 %	25 %	25 %	384209407
69562	NC_017243	TTA	2	6	2214181	2214186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209407
69563	NC_017243	CAG	2	6	2214236	2214241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209407
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69587	NC_017243	AGC	2	6	2215323	2215328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209407
69588	NC_017243	TAGGAT	2	12	2215346	2215357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209407
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69590	NC_017243	TAG	2	6	2215532	2215537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209407
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69593	NC_017243	AT	3	6	2215699	2215704	50 %	50 %	0 %	0 %	384209407
69594	NC_017243	TCC	2	6	2215705	2215710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69595	NC_017243	TA	3	6	2215712	2215717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69596	NC_017243	AAT	2	6	2215777	2215782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69597	NC_017243	ATT	2	6	2215796	2215801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209408
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69602	NC_017243	CAT	2	6	2215943	2215948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209408
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69605	NC_017243	TAG	2	6	2216177	2216182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209408
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