MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_017243	AAT	2	6	2162289	2162294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68002	NC_017243	ATTAT	2	10	2162295	2162304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68003	NC_017243	A	7	7	2162313	2162319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68004	NC_017243	AATG	2	8	2162337	2162344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68005	NC_017243	ATA	2	6	2162352	2162357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68006	NC_017243	AAT	2	6	2162448	2162453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68007	NC_017243	AAT	3	9	2162458	2162466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68008	NC_017243	TTG	2	6	2162472	2162477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68009	NC_017243	AAAT	2	8	2162499	2162506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68010	NC_017243	ATT	4	12	2162519	2162530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68011	NC_017243	TA	3	6	2162542	2162547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68012	NC_017243	TAA	3	9	2162554	2162562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68013	NC_017243	ACTT	2	8	2162567	2162574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68014	NC_017243	ATT	2	6	2162590	2162595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68015	NC_017243	TTC	2	6	2162642	2162647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209361
68016	NC_017243	TAG	3	9	2162776	2162784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209361
68017	NC_017243	TTA	2	6	2162883	2162888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68018	NC_017243	TTA	2	6	2162905	2162910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68019	NC_017243	CAT	2	6	2162968	2162973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209361
68020	NC_017243	ATT	2	6	2162996	2163001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68021	NC_017243	TAA	2	6	2163005	2163010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209361
68022	NC_017243	TAC	2	6	2163017	2163022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209361
68023	NC_017243	TTC	2	6	2163028	2163033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209361
68024	NC_017243	AGC	2	6	2163041	2163046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209361
68025	NC_017243	AT	3	6	2163047	2163052	50 %	50 %	0 %	0 %	384209361
68026	NC_017243	TTA	2	6	2163103	2163108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68027	NC_017243	AAT	2	6	2163134	2163139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209361
68028	NC_017243	CAT	2	6	2163146	2163151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209361
68029	NC_017243	CT	3	6	2163209	2163214	0 %	50 %	0 %	50 %	384209361
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68033	NC_017243	CAG	2	6	2163439	2163444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209361
68034	NC_017243	CAT	2	6	2163490	2163495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209361
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68036	NC_017243	AAG	2	6	2163530	2163535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209361
68037	NC_017243	TTA	2	6	2163598	2163603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68038	NC_017243	TTG	2	6	2163627	2163632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384209361
68039	NC_017243	TAT	2	6	2163644	2163649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209361
68040	NC_017243	AGG	2	6	2163662	2163667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384209361
68041	NC_017243	AATAT	2	10	2163685	2163694	60 %	40 %	0 %	0 %	384209361
68042	NC_017243	TAAT	2	8	2163718	2163725	50 %	50 %	0 %	0 %	384209361
68043	NC_017243	ATA	2	6	2163738	2163743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209361
68044	NC_017243	CAT	2	6	2163764	2163769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68045	NC_017243	AT	3	6	2163776	2163781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68046	NC_017243	ATT	2	6	2163787	2163792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68047	NC_017243	TAT	2	6	2163801	2163806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68048	NC_017243	T	6	6	2163811	2163816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68049	NC_017243	T	7	7	2163819	2163825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68050	NC_017243	A	6	6	2163829	2163834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68051	NC_017243	ATT	2	6	2163837	2163842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68052	NC_017243	TACGTA	2	12	2163857	2163868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68053	NC_017243	TTA	2	6	2163869	2163874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68054	NC_017243	AGG	2	6	2163886	2163891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68055	NC_017243	A	6	6	2163914	2163919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68056	NC_017243	T	6	6	2163921	2163926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68057	NC_017243	ATTT	2	8	2163928	2163935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68058	NC_017243	T	6	6	2163944	2163949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68059	NC_017243	ATA	2	6	2163992	2163997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209362
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68062	NC_017243	TTAATA	2	12	2164087	2164098	50 %	50 %	0 %	0 %	384209362
68063	NC_017243	GAC	2	6	2164111	2164116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209362
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68066	NC_017243	CATGGA	2	12	2164195	2164206	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384209362
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68069	NC_017243	AT	4	8	2164340	2164347	50 %	50 %	0 %	0 %	384209362
68070	NC_017243	ATA	2	6	2164363	2164368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209362
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68076	NC_017243	TAAA	3	12	2164733	2164744	75 %	25 %	0 %	0 %	384209362
68077	NC_017243	A	6	6	2164742	2164747	100 %	0 %	0 %	0 %	384209362
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68082	NC_017243	ATA	2	6	2164787	2164792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68086	NC_017243	TA	3	6	2164882	2164887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68087	NC_017243	CAAA	2	8	2164890	2164897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68088	NC_017243	AGA	2	6	2164953	2164958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68089	NC_017243	AGAAA	2	10	2165056	2165065	80 %	0 %	20 %	0 %	384209363
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68093	NC_017243	TAT	2	6	2165266	2165271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68104	NC_017243	ATA	2	6	2165707	2165712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68106	NC_017243	ATT	2	6	2165725	2165730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68111	NC_017243	TA	3	6	2165819	2165824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68114	NC_017243	ATT	2	6	2165877	2165882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68115	NC_017243	ATT	3	9	2165996	2166004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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68118	NC_017243	AAATAA	2	12	2166033	2166044	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68119	NC_017243	A	7	7	2166043	2166049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68120	NC_017243	ATA	2	6	2166104	2166109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68121	NC_017243	T	7	7	2166175	2166181	0 %	100 %	0 %	0 %	384209365
68122	NC_017243	ATA	2	6	2166237	2166242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209365
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