MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_017243	T	6	6	1851610	1851615	0 %	100 %	0 %	0 %	384209113
58502	NC_017243	ATA	2	6	1851639	1851644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58503	NC_017243	ATA	2	6	1851665	1851670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58504	NC_017243	TTTAT	2	10	1851671	1851680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58505	NC_017243	A	6	6	1851687	1851692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58506	NC_017243	ATT	2	6	1851723	1851728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58507	NC_017243	TA	3	6	1851738	1851743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58508	NC_017243	ATT	2	6	1851748	1851753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58509	NC_017243	T	6	6	1851752	1851757	0 %	100 %	0 %	0 %	384209114
58510	NC_017243	T	7	7	1851853	1851859	0 %	100 %	0 %	0 %	384209114
58511	NC_017243	CAG	2	6	1851865	1851870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209114
58512	NC_017243	TAT	2	6	1851875	1851880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58513	NC_017243	TAT	2	6	1851883	1851888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58514	NC_017243	TAATCT	2	12	1851899	1851910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384209114
58515	NC_017243	TATCAA	2	12	1851922	1851933	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384209114
58516	NC_017243	GAA	2	6	1851961	1851966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209114
58517	NC_017243	AAG	2	6	1851988	1851993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209114
58518	NC_017243	ACTTCT	2	12	1852011	1852022	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384209114
58519	NC_017243	CAT	4	12	1852024	1852035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209114
58520	NC_017243	ATA	2	6	1852096	1852101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58521	NC_017243	AAT	2	6	1852121	1852126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58522	NC_017243	TAG	2	6	1852159	1852164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209114
58523	NC_017243	AAGT	2	8	1852169	1852176	50 %	25 %	25 %	0 %	384209114
58524	NC_017243	GAATCC	2	12	1852193	1852204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384209114
58525	NC_017243	CCAT	2	8	1852207	1852214	25 %	25 %	0 %	50 %	384209114
58526	NC_017243	AAT	2	6	1852229	1852234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58527	NC_017243	AAGT	2	8	1852246	1852253	50 %	25 %	25 %	0 %	384209114
58528	NC_017243	ATA	2	6	1852270	1852275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58529	NC_017243	ATGA	2	8	1852290	1852297	50 %	25 %	25 %	0 %	384209114
58530	NC_017243	AAG	2	6	1852326	1852331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209114
58531	NC_017243	CAG	2	6	1852342	1852347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209114
58532	NC_017243	TGA	2	6	1852396	1852401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209114
58533	NC_017243	CAT	2	6	1852430	1852435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209114
58534	NC_017243	GAA	2	6	1852442	1852447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209114
58535	NC_017243	ATAC	2	8	1852457	1852464	50 %	25 %	0 %	25 %	384209114
58536	NC_017243	TAA	2	6	1852595	1852600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58537	NC_017243	GAA	2	6	1852607	1852612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209114
58538	NC_017243	TAT	2	6	1852646	1852651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58539	NC_017243	CTA	2	6	1852666	1852671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209114
58540	NC_017243	TAC	2	6	1852715	1852720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209114
58541	NC_017243	CAT	2	6	1852721	1852726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209114
58542	NC_017243	ATT	2	6	1852740	1852745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58543	NC_017243	TCT	2	6	1852754	1852759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209114
58544	NC_017243	AATTT	2	10	1852788	1852797	40 %	60 %	0 %	0 %	384209114
58545	NC_017243	TAT	2	6	1852807	1852812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58546	NC_017243	CCT	2	6	1852818	1852823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384209114
58547	NC_017243	TTA	2	6	1852857	1852862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209114
58548	NC_017243	CAG	2	6	1852876	1852881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209114
58549	NC_017243	AAC	2	6	1852943	1852948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209114
58550	NC_017243	CAA	2	6	1852957	1852962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209114
58551	NC_017243	AGC	3	9	1852973	1852981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209114
58552	NC_017243	CCG	2	6	1853055	1853060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384209114
58553	NC_017243	TAA	2	6	1853065	1853070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209114
58554	NC_017243	CCG	2	6	1853091	1853096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384209114
58555	NC_017243	CCAT	2	8	1853099	1853106	25 %	25 %	0 %	50 %	384209114
58556	NC_017243	GCT	2	6	1853142	1853147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384209114
58557	NC_017243	AT	3	6	1853208	1853213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58558	NC_017243	A	6	6	1853228	1853233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58559	NC_017243	ATT	2	6	1853237	1853242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58560	NC_017243	TTAT	2	8	1853268	1853275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58561	NC_017243	TAT	2	6	1853278	1853283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58562	NC_017243	TAT	2	6	1853288	1853293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58563	NC_017243	TTA	2	6	1853299	1853304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58564	NC_017243	T	6	6	1853310	1853315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58565	NC_017243	TAAA	2	8	1853336	1853343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58566	NC_017243	A	6	6	1853341	1853346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58567	NC_017243	ATT	2	6	1853352	1853357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58568	NC_017243	TATAT	2	10	1853358	1853367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58569	NC_017243	TAT	2	6	1853389	1853394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58570	NC_017243	T	6	6	1853399	1853404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58571	NC_017243	ATAAA	2	10	1853438	1853447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58572	NC_017243	ATT	2	6	1853484	1853489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209115
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58580	NC_017243	GAT	2	6	1853914	1853919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209115
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58582	NC_017243	TAAA	2	8	1853937	1853944	75 %	25 %	0 %	0 %	384209115
58583	NC_017243	A	6	6	1853942	1853947	100 %	0 %	0 %	0 %	384209115
58584	NC_017243	AT	4	8	1853950	1853957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58585	NC_017243	TTA	3	9	1853962	1853970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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58588	NC_017243	TTTATT	2	12	1853992	1854003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384209116
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58591	NC_017243	TA	3	6	1854037	1854042	50 %	50 %	0 %	0 %	384209116
58592	NC_017243	TTA	2	6	1854084	1854089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209116
58593	NC_017243	ATT	3	9	1854092	1854100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209116
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58604	NC_017243	TATAA	2	10	1854445	1854454	60 %	40 %	0 %	0 %	384209116
58605	NC_017243	TCT	2	6	1854456	1854461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209116
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58615	NC_017243	TGA	2	6	1854795	1854800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209116
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