MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 104131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57501	NC_017243	TAA	2	6	1818117	1818122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57502	NC_017243	AT	3	6	1818140	1818145	50 %	50 %	0 %	0 %	384209078
57503	NC_017243	CTGC	2	8	1818244	1818251	0 %	25 %	25 %	50 %	384209078
57504	NC_017243	AAC	2	6	1818261	1818266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209078
57505	NC_017243	AT	3	6	1818349	1818354	50 %	50 %	0 %	0 %	384209078
57506	NC_017243	TAT	2	6	1818366	1818371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209078
57507	NC_017243	TAAATT	2	12	1818381	1818392	50 %	50 %	0 %	0 %	384209078
57508	NC_017243	TCT	2	6	1818454	1818459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209079
57509	NC_017243	AGT	2	6	1818515	1818520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209079
57510	NC_017243	ATT	2	6	1818524	1818529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209079
57511	NC_017243	TCA	2	6	1818567	1818572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209079
57512	NC_017243	AT	3	6	1818647	1818652	50 %	50 %	0 %	0 %	384209079
57513	NC_017243	TATTT	2	10	1818704	1818713	20 %	80 %	0 %	0 %	384209079
57514	NC_017243	ATA	2	6	1818720	1818725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209079
57515	NC_017243	TA	3	6	1818754	1818759	50 %	50 %	0 %	0 %	384209080
57516	NC_017243	AAT	2	6	1818787	1818792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209080
57517	NC_017243	CTT	2	6	1818841	1818846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209080
57518	NC_017243	CTTAC	2	10	1818855	1818864	20 %	40 %	0 %	40 %	384209080
57519	NC_017243	TCC	2	6	1818887	1818892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384209080
57520	NC_017243	AGC	2	6	1818941	1818946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209080
57521	NC_017243	ATC	2	6	1818947	1818952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209080
57522	NC_017243	CT	3	6	1819004	1819009	0 %	50 %	0 %	50 %	384209080
57523	NC_017243	TAA	2	6	1819081	1819086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209080
57524	NC_017243	CGC	2	6	1819093	1819098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384209080
57525	NC_017243	GAT	2	6	1819122	1819127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209080
57526	NC_017243	AT	3	6	1819161	1819166	50 %	50 %	0 %	0 %	384209080
57527	NC_017243	GCTAT	2	10	1819248	1819257	20 %	40 %	20 %	20 %	384209080
57528	NC_017243	T	6	6	1819311	1819316	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57529	NC_017243	CACC	2	8	1819419	1819426	25 %	0 %	0 %	75 %	384209081
57530	NC_017243	ACA	2	6	1819430	1819435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209081
57531	NC_017243	GGCA	2	8	1819441	1819448	25 %	0 %	50 %	25 %	384209081
57532	NC_017243	ATTT	2	8	1819489	1819496	25 %	75 %	0 %	0 %	384209081
57533	NC_017243	TAG	2	6	1819551	1819556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209081
57534	NC_017243	TTG	2	6	1819566	1819571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384209081
57535	NC_017243	AT	4	8	1819663	1819670	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57536	NC_017243	GCA	2	6	1819729	1819734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209081
57537	NC_017243	CTT	2	6	1819743	1819748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209081
57538	NC_017243	TAT	2	6	1819773	1819778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209081
57539	NC_017243	AAT	2	6	1819923	1819928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209081
57540	NC_017243	T	6	6	1819933	1819938	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57541	NC_017243	AAT	2	6	1819950	1819955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209081
57542	NC_017243	TCA	2	6	1819961	1819966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209081
57543	NC_017243	TGT	2	6	1819984	1819989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384209081
57544	NC_017243	T	7	7	1819989	1819995	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57545	NC_017243	ATA	2	6	1820026	1820031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209081
57546	NC_017243	CAT	2	6	1820038	1820043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209081
57547	NC_017243	CTA	2	6	1820052	1820057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209081
57548	NC_017243	TAT	2	6	1820067	1820072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209081
57549	NC_017243	TC	3	6	1820100	1820105	0 %	50 %	0 %	50 %	384209081
57550	NC_017243	AT	3	6	1820168	1820173	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57551	NC_017243	TAA	2	6	1820274	1820279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209081
57552	NC_017243	TA	3	6	1820295	1820300	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57553	NC_017243	TCA	2	6	1820312	1820317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209081
57554	NC_017243	T	6	6	1820368	1820373	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57555	NC_017243	CTT	2	6	1820448	1820453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384209081
57556	NC_017243	TA	3	6	1820628	1820633	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57557	NC_017243	T	6	6	1820634	1820639	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57558	NC_017243	AT	3	6	1820651	1820656	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57559	NC_017243	T	6	6	1820666	1820671	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57560	NC_017243	ATTT	2	8	1820673	1820680	25 %	75 %	0 %	0 %	384209081
57561	NC_017243	GCA	2	6	1820724	1820729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209081
57562	NC_017243	ATA	2	6	1820774	1820779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209081
57563	NC_017243	ATC	2	6	1820785	1820790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209081
57564	NC_017243	TA	3	6	1820803	1820808	50 %	50 %	0 %	0 %	384209081
57565	NC_017243	TTA	2	6	1820837	1820842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209081
57566	NC_017243	TTA	2	6	1820865	1820870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209081
57567	NC_017243	T	6	6	1820899	1820904	0 %	100 %	0 %	0 %	384209081
57568	NC_017243	TAA	2	6	1820944	1820949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57569	NC_017243	TAT	2	6	1820958	1820963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57570	NC_017243	T	6	6	1820963	1820968	0 %	100 %	0 %	0 %	384209082
57571	NC_017243	ATTT	2	8	1820982	1820989	25 %	75 %	0 %	0 %	384209082
57572	NC_017243	TAA	2	6	1821023	1821028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209082
57573	NC_017243	AAT	2	6	1821056	1821061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209082
57574	NC_017243	CAA	2	6	1821118	1821123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209082
57575	NC_017243	ATC	2	6	1821147	1821152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209082
57576	NC_017243	T	6	6	1821168	1821173	0 %	100 %	0 %	0 %	384209082
57577	NC_017243	A	6	6	1821184	1821189	100 %	0 %	0 %	0 %	384209082
57578	NC_017243	T	7	7	1821193	1821199	0 %	100 %	0 %	0 %	384209082
57579	NC_017243	CAATA	2	10	1821201	1821210	60 %	20 %	0 %	20 %	384209082
57580	NC_017243	TCTAAT	2	12	1821235	1821246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384209082
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57582	NC_017243	ATT	2	6	1821300	1821305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209082
57583	NC_017243	T	6	6	1821304	1821309	0 %	100 %	0 %	0 %	384209082
57584	NC_017243	ATTA	2	8	1821342	1821349	50 %	50 %	0 %	0 %	384209082
57585	NC_017243	AAG	2	6	1821353	1821358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209082
57586	NC_017243	ATC	2	6	1821414	1821419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209082
57587	NC_017243	TAT	2	6	1821420	1821425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209082
57588	NC_017243	AAT	2	6	1821434	1821439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209082
57589	NC_017243	AGA	2	6	1821462	1821467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384209082
57590	NC_017243	TAGA	2	8	1821524	1821531	50 %	25 %	25 %	0 %	384209082
57591	NC_017243	TTTA	2	8	1821555	1821562	25 %	75 %	0 %	0 %	384209082
57592	NC_017243	TTA	2	6	1821569	1821574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209082
57593	NC_017243	T	6	6	1821589	1821594	0 %	100 %	0 %	0 %	384209082
57594	NC_017243	TACT	2	8	1821611	1821618	25 %	50 %	0 %	25 %	384209082
57595	NC_017243	TTA	2	6	1821630	1821635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209083
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57597	NC_017243	AAAC	2	8	1821741	1821748	75 %	0 %	0 %	25 %	384209083
57598	NC_017243	TAT	2	6	1821803	1821808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384209083
57599	NC_017243	TCTT	2	8	1821870	1821877	0 %	75 %	0 %	25 %	384209083
57600	NC_017243	CAG	2	6	1821958	1821963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209083
57601	NC_017243	TA	3	6	1821964	1821969	50 %	50 %	0 %	0 %	384209083
57602	NC_017243	TCC	2	6	1822007	1822012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384209083
57603	NC_017243	CAA	2	6	1822021	1822026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209083
57604	NC_017243	T	6	6	1822035	1822040	0 %	100 %	0 %	0 %	384209083
57605	NC_017243	AT	3	6	1822048	1822053	50 %	50 %	0 %	0 %	384209083
57606	NC_017243	AGC	2	6	1822058	1822063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384209083
57607	NC_017243	ATAGCA	2	12	1822158	1822169	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384209083
57608	NC_017243	T	6	6	1822195	1822200	0 %	100 %	0 %	0 %	384209083
57609	NC_017243	AAT	2	6	1822243	1822248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384209083
57610	NC_017243	ACA	2	6	1822251	1822256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209083
57611	NC_017243	CAA	2	6	1822318	1822323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209083
57612	NC_017243	CAATA	2	10	1822328	1822337	60 %	20 %	0 %	20 %	384209083
57613	NC_017243	AGT	2	6	1822412	1822417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384209083
57614	NC_017243	GCAT	2	8	1822495	1822502	25 %	25 %	25 %	25 %	384209084
57615	NC_017243	TCA	2	6	1822508	1822513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209084
57616	NC_017243	CAA	2	6	1822557	1822562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384209084
57617	NC_017243	TCA	2	6	1822565	1822570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384209084
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