MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-2

Total Repeats: 847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017239	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017239	ATTT	2	8	17	24	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017239	TA	3	6	33	38	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017239	TA	3	6	41	46	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017239	TTA	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017239	A	6	6	88	93	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
7	NC_017239	AGA	3	9	190	198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
8	NC_017239	ATC	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
9	NC_017239	GCT	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206339
10	NC_017239	ATAG	2	8	311	318	50 %	25 %	25 %	0 %	384206339
11	NC_017239	T	9	9	322	330	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
12	NC_017239	A	6	6	339	344	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
13	NC_017239	AGA	2	6	346	351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
14	NC_017239	CTT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206339
15	NC_017239	T	6	6	428	433	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
16	NC_017239	TGG	2	6	460	465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206339
17	NC_017239	CTC	2	6	513	518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206339
18	NC_017239	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
19	NC_017239	A	6	6	601	606	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
20	NC_017239	TAG	2	6	625	630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206339
21	NC_017239	A	6	6	640	645	100 %	0 %	0 %	0 %	384206339
22	NC_017239	TAT	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
23	NC_017239	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206339
24	NC_017239	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
25	NC_017239	CA	3	6	760	765	50 %	0 %	0 %	50 %	384206339
26	NC_017239	T	7	7	804	810	0 %	100 %	0 %	0 %	384206339
27	NC_017239	TTA	2	6	824	829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206339
28	NC_017239	TCA	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206339
29	NC_017239	GAA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206339
30	NC_017239	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206339
31	NC_017239	TAT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017239	TCT	2	6	1120	1125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017239	AAG	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017239	AAT	3	9	1180	1188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017239	TAA	2	6	1237	1242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017239	ACT	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017239	ATT	2	6	1418	1423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017239	AGG	2	6	1424	1429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017239	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
40	NC_017239	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206340
41	NC_017239	CAAA	2	8	1509	1516	75 %	0 %	0 %	25 %	384206340
42	NC_017239	A	7	7	1514	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	384206340
43	NC_017239	TA	3	6	1521	1526	50 %	50 %	0 %	0 %	384206340
44	NC_017239	AAT	2	6	1530	1535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206340
45	NC_017239	T	9	9	1567	1575	0 %	100 %	0 %	0 %	384206340
46	NC_017239	CTT	2	6	1590	1595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017239	T	6	6	1606	1611	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
48	NC_017239	A	6	6	1624	1629	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
49	NC_017239	T	8	8	1635	1642	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
50	NC_017239	A	8	8	1686	1693	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
51	NC_017239	T	6	6	1698	1703	0 %	100 %	0 %	0 %	384206341
52	NC_017239	AT	3	6	1725	1730	50 %	50 %	0 %	0 %	384206341
53	NC_017239	A	6	6	1738	1743	100 %	0 %	0 %	0 %	384206341
54	NC_017239	TAA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017239	ATT	2	6	1833	1838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206342
56	NC_017239	AAAT	2	8	1845	1852	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
57	NC_017239	AG	4	8	1895	1902	50 %	0 %	50 %	0 %	384206342
58	NC_017239	AAAT	2	8	1929	1936	75 %	25 %	0 %	0 %	384206342
59	NC_017239	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	384206342
60	NC_017239	AAT	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017239	ACT	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017239	AC	3	6	2077	2082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017239	TTA	3	9	2106	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017239	AG	3	6	2116	2121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017239	TAAA	2	8	2143	2150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017239	T	6	6	2175	2180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017239	TTAAAA	2	12	2214	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017239	ATTTGT	2	12	2229	2240	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017239	A	7	7	2310	2316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017239	ATA	2	6	2323	2328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017239	AT	3	6	2335	2340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017239	A	6	6	2375	2380	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
73	NC_017239	ACA	2	6	2401	2406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
74	NC_017239	AAG	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
75	NC_017239	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
76	NC_017239	AAC	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
77	NC_017239	ACT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206343
78	NC_017239	A	7	7	2660	2666	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
79	NC_017239	ATCA	2	8	2682	2689	50 %	25 %	0 %	25 %	384206343
80	NC_017239	A	8	8	2701	2708	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
81	NC_017239	TAA	2	6	2756	2761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
82	NC_017239	ATA	2	6	2794	2799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
83	NC_017239	ATA	3	9	2803	2811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
84	NC_017239	A	7	7	2813	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
85	NC_017239	GAA	3	9	2820	2828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
86	NC_017239	A	7	7	2858	2864	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
87	NC_017239	CAA	2	6	2870	2875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206343
88	NC_017239	TTC	2	6	2899	2904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206343
89	NC_017239	TTA	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
90	NC_017239	A	7	7	2937	2943	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
91	NC_017239	AAT	2	6	2948	2953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
92	NC_017239	TAA	2	6	2983	2988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
93	NC_017239	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
94	NC_017239	A	8	8	3079	3086	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
95	NC_017239	AAAT	2	8	3109	3116	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
96	NC_017239	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
97	NC_017239	TAT	2	6	3158	3163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
98	NC_017239	AATTG	2	10	3218	3227	40 %	40 %	20 %	0 %	384206343
99	NC_017239	A	6	6	3228	3233	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
100	NC_017239	A	6	6	3302	3307	100 %	0 %	0 %	0 %	384206343
101	NC_017239	AAAT	2	8	3359	3366	75 %	25 %	0 %	0 %	384206343
102	NC_017239	ATA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
103	NC_017239	ATT	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206343
104	NC_017239	TAA	2	6	3415	3420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206343
105	NC_017239	AAAATA	2	12	3421	3432	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384206343
106	NC_017239	AAG	2	6	3448	3453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206343
107	NC_017239	TAA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
108	NC_017239	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
109	NC_017239	ATG	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206344
110	NC_017239	TAA	2	6	3617	3622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
111	NC_017239	A	8	8	3624	3631	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
112	NC_017239	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
113	NC_017239	ATT	2	6	3656	3661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
114	NC_017239	CAAT	2	8	3662	3669	50 %	25 %	0 %	25 %	384206344
115	NC_017239	GAA	2	6	3678	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206344
116	NC_017239	ATTT	2	8	3688	3695	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
117	NC_017239	TATT	2	8	3725	3732	25 %	75 %	0 %	0 %	384206344
118	NC_017239	A	6	6	3741	3746	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
119	NC_017239	A	6	6	3837	3842	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
120	NC_017239	T	6	6	3850	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	384206344
121	NC_017239	GTT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206344
122	NC_017239	A	7	7	3884	3890	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
123	NC_017239	ATT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206344
124	NC_017239	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206344
125	NC_017239	A	6	6	3972	3977	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
126	NC_017239	A	7	7	4012	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
127	NC_017239	A	6	6	4025	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	384206344
128	NC_017239	GAG	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206345
129	NC_017239	CTT	2	6	4080	4085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206345
130	NC_017239	AAT	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
131	NC_017239	TAA	2	6	4108	4113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
132	NC_017239	TTGATC	2	12	4134	4145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384206345
133	NC_017239	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
134	NC_017239	AATT	2	8	4197	4204	50 %	50 %	0 %	0 %	384206345
135	NC_017239	ATTCTT	2	12	4215	4226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384206345
136	NC_017239	TAA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
137	NC_017239	TGT	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206345
138	NC_017239	AAG	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
139	NC_017239	ATT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
140	NC_017239	AGA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206345
141	NC_017239	CTC	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206345
142	NC_017239	ATC	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206345
143	NC_017239	TAA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
144	NC_017239	AAT	2	6	4538	4543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206345
145	NC_017239	ATT	2	6	4565	4570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
146	NC_017239	ATT	2	6	4731	4736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206345
147	NC_017239	AGTTT	2	10	4765	4774	20 %	60 %	20 %	0 %	384206345
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149	NC_017239	T	7	7	4801	4807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017239	A	6	6	4820	4825	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
151	NC_017239	ATA	3	9	4843	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206346
152	NC_017239	AAG	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
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155	NC_017239	A	6	6	4923	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
156	NC_017239	GAT	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206346
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158	NC_017239	ATTTT	2	10	5045	5054	20 %	80 %	0 %	0 %	384206346
159	NC_017239	TTTA	2	8	5166	5173	25 %	75 %	0 %	0 %	384206346
160	NC_017239	A	6	6	5188	5193	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
161	NC_017239	GTTAG	2	10	5230	5239	20 %	40 %	40 %	0 %	384206346
162	NC_017239	AAG	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206346
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164	NC_017239	A	7	7	5312	5318	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
165	NC_017239	AAC	2	6	5324	5329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206346
166	NC_017239	A	6	6	5335	5340	100 %	0 %	0 %	0 %	384206346
167	NC_017239	ATAA	2	8	5357	5364	75 %	25 %	0 %	0 %	384206346
168	NC_017239	TA	3	6	5389	5394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017239	AATT	2	8	5413	5420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017239	T	7	7	5470	5476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017239	CTAA	2	8	5489	5496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_017239	ATT	2	6	5539	5544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017239	T	6	6	5565	5570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017239	TCT	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017239	AAT	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017239	AT	3	6	5700	5705	50 %	50 %	0 %	0 %	384206347
177	NC_017239	CTA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017239	TTCG	2	8	5901	5908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_017239	T	6	6	5949	5954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017239	TTTTG	2	10	5995	6004	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017239	T	6	6	6030	6035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017239	TTC	2	6	6040	6045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_017239	T	6	6	6090	6095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017239	TTC	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_017239	T	7	7	6233	6239	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
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188	NC_017239	T	7	7	6360	6366	0 %	100 %	0 %	0 %	384206348
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192	NC_017239	T	6	6	6551	6556	0 %	100 %	0 %	0 %	384206349
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213	NC_017239	A	6	6	7448	7453	100 %	0 %	0 %	0 %	384206354
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216	NC_017239	GTA	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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221	NC_017239	TATG	2	8	7892	7899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_017239	TA	4	8	8232	8239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_017239	TA	3	6	8243	8248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017239	CTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206357
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257	NC_017239	TAATAT	2	12	9361	9372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017239	AT	3	6	9397	9402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017239	ATA	3	9	9412	9420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017239	AT	3	6	9474	9479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017239	TGAT	2	8	9483	9490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017239	ATTT	3	12	9500	9511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017239	TTA	2	6	9522	9527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017239	TTA	3	9	9534	9542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017239	TATG	2	8	9552	9559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017239	ATTT	2	8	9578	9585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_017239	TA	3	6	9750	9755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017239	GAT	2	6	9762	9767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017239	ATA	2	6	9821	9826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
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282	NC_017239	ATT	2	6	10132	10137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206358
283	NC_017239	TAA	2	6	10143	10148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206358
284	NC_017239	A	6	6	10147	10152	100 %	0 %	0 %	0 %	384206358
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