MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo chromosome

Total Repeats: 25284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017238	AT	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017238	A	8	8	60	67	100 %	0 %	0 %	0 %	384206504
3	NC_017238	TA	3	6	75	80	50 %	50 %	0 %	0 %	384206504
4	NC_017238	ATA	3	9	78	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206504
5	NC_017238	TTA	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206504
6	NC_017238	TA	3	6	91	96	50 %	50 %	0 %	0 %	384206504
7	NC_017238	TGAAA	2	10	110	119	60 %	20 %	20 %	0 %	384206504
8	NC_017238	T	6	6	128	133	0 %	100 %	0 %	0 %	384206504
9	NC_017238	TTA	3	9	141	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206504
10	NC_017238	ATTT	2	8	160	167	25 %	75 %	0 %	0 %	384206504
11	NC_017238	AAAT	2	8	176	183	75 %	25 %	0 %	0 %	384206504
12	NC_017238	A	10	10	225	234	100 %	0 %	0 %	0 %	384206504
13	NC_017238	TA	3	6	261	266	50 %	50 %	0 %	0 %	384206504
14	NC_017238	AATG	2	8	330	337	50 %	25 %	25 %	0 %	384206504
15	NC_017238	T	6	6	365	370	0 %	100 %	0 %	0 %	384206504
16	NC_017238	CAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206504
17	NC_017238	TTC	2	6	477	482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206504
18	NC_017238	ACT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206504
19	NC_017238	AAC	2	6	533	538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206504
20	NC_017238	TAA	2	6	602	607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206504
21	NC_017238	AT	3	6	714	719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017238	AC	3	6	720	725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017238	CAA	2	6	741	746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017238	CTA	2	6	762	767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
25	NC_017238	ATA	2	6	874	879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206505
26	NC_017238	ATA	2	6	976	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206505
27	NC_017238	AGC	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206505
28	NC_017238	AAAC	2	8	1001	1008	75 %	0 %	0 %	25 %	384206505
29	NC_017238	A	6	6	1030	1035	100 %	0 %	0 %	0 %	384206505
30	NC_017238	TCC	2	6	1086	1091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206505
31	NC_017238	TCC	2	6	1188	1193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206505
32	NC_017238	T	7	7	1373	1379	0 %	100 %	0 %	0 %	384206505
33	NC_017238	CTA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
34	NC_017238	TCA	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
35	NC_017238	CAA	2	6	1424	1429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206505
36	NC_017238	T	7	7	1470	1476	0 %	100 %	0 %	0 %	384206505
37	NC_017238	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	384206505
38	NC_017238	T	7	7	1532	1538	0 %	100 %	0 %	0 %	384206505
39	NC_017238	TCG	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206505
40	NC_017238	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206505
41	NC_017238	TCA	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206505
42	NC_017238	AAAT	2	8	1734	1741	75 %	25 %	0 %	0 %	384206505
43	NC_017238	A	7	7	1748	1754	100 %	0 %	0 %	0 %	384206505
44	NC_017238	A	6	6	1756	1761	100 %	0 %	0 %	0 %	384206505
45	NC_017238	GCA	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206506
46	NC_017238	TAG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206506
47	NC_017238	ATT	2	6	1865	1870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
48	NC_017238	CT	3	6	1873	1878	0 %	50 %	0 %	50 %	384206506
49	NC_017238	ATAC	2	8	1888	1895	50 %	25 %	0 %	25 %	384206506
50	NC_017238	ATAA	2	8	1932	1939	75 %	25 %	0 %	0 %	384206506
51	NC_017238	AT	3	6	2034	2039	50 %	50 %	0 %	0 %	384206506
52	NC_017238	T	6	6	2080	2085	0 %	100 %	0 %	0 %	384206506
53	NC_017238	TAT	2	6	2087	2092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
54	NC_017238	TCA	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206506
55	NC_017238	T	6	6	2103	2108	0 %	100 %	0 %	0 %	384206506
56	NC_017238	GAA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
57	NC_017238	TCC	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206506
58	NC_017238	CTC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384206506
59	NC_017238	AGA	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
60	NC_017238	AATT	2	8	2341	2348	50 %	50 %	0 %	0 %	384206506
61	NC_017238	AT	4	8	2376	2383	50 %	50 %	0 %	0 %	384206506
62	NC_017238	AAAT	2	8	2412	2419	75 %	25 %	0 %	0 %	384206506
63	NC_017238	TGACCA	2	12	2442	2453	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384206506
64	NC_017238	ATT	3	9	2474	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
65	NC_017238	TAT	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206506
66	NC_017238	ATC	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206506
67	NC_017238	T	6	6	2576	2581	0 %	100 %	0 %	0 %	384206506
68	NC_017238	AATCA	2	10	2606	2615	60 %	20 %	0 %	20 %	384206506
69	NC_017238	AAAT	2	8	2621	2628	75 %	25 %	0 %	0 %	384206506
70	NC_017238	AAAT	2	8	2644	2651	75 %	25 %	0 %	0 %	384206506
71	NC_017238	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	384206506
72	NC_017238	TTTTTA	2	12	2889	2900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384206506
73	NC_017238	GAAA	2	8	2945	2952	75 %	0 %	25 %	0 %	384206506
74	NC_017238	AAG	2	6	2992	2997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206506
75	NC_017238	A	6	6	2998	3003	100 %	0 %	0 %	0 %	384206506
76	NC_017238	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206506
77	NC_017238	CTT	2	6	3016	3021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206506
78	NC_017238	T	7	7	3056	3062	0 %	100 %	0 %	0 %	384206506
79	NC_017238	TTAAAC	2	12	3087	3098	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384206506
80	NC_017238	T	6	6	3200	3205	0 %	100 %	0 %	0 %	384206506
81	NC_017238	A	6	6	3220	3225	100 %	0 %	0 %	0 %	384206506
82	NC_017238	CATT	2	8	3241	3248	25 %	50 %	0 %	25 %	384206506
83	NC_017238	A	7	7	3292	3298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017238	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017238	ATT	2	6	3333	3338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017238	TAT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017238	AAT	2	6	3353	3358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017238	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017238	A	6	6	3426	3431	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
90	NC_017238	A	6	6	3488	3493	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
91	NC_017238	TAA	2	6	3547	3552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
92	NC_017238	ATT	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
93	NC_017238	AATCC	2	10	3583	3592	40 %	20 %	0 %	40 %	384206507
94	NC_017238	GGATTA	2	12	3603	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
95	NC_017238	ATT	2	6	3636	3641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
96	NC_017238	TAA	2	6	3664	3669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
97	NC_017238	A	8	8	3675	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
98	NC_017238	T	6	6	3690	3695	0 %	100 %	0 %	0 %	384206507
99	NC_017238	A	6	6	3731	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
100	NC_017238	TGG	2	6	3821	3826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206507
101	NC_017238	ATA	2	6	3855	3860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
102	NC_017238	ATA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
103	NC_017238	TAA	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
104	NC_017238	TAAT	2	8	3907	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	384206507
105	NC_017238	TGA	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
106	NC_017238	ATA	2	6	3966	3971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
107	NC_017238	AAAGA	2	10	4076	4085	80 %	0 %	20 %	0 %	384206507
108	NC_017238	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
109	NC_017238	AAT	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
110	NC_017238	AATG	2	8	4118	4125	50 %	25 %	25 %	0 %	384206507
111	NC_017238	TCAAT	2	10	4138	4147	40 %	40 %	0 %	20 %	384206507
112	NC_017238	TA	3	6	4189	4194	50 %	50 %	0 %	0 %	384206507
113	NC_017238	ATA	2	6	4219	4224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
114	NC_017238	AATG	2	8	4248	4255	50 %	25 %	25 %	0 %	384206507
115	NC_017238	CTA	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
116	NC_017238	ATC	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
117	NC_017238	A	6	6	4390	4395	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
118	NC_017238	GTA	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
119	NC_017238	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
120	NC_017238	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
121	NC_017238	A	6	6	4498	4503	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
122	NC_017238	T	6	6	4511	4516	0 %	100 %	0 %	0 %	384206507
123	NC_017238	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206507
124	NC_017238	GATT	2	8	4591	4598	25 %	50 %	25 %	0 %	384206507
125	NC_017238	GGGA	2	8	4612	4619	25 %	0 %	75 %	0 %	384206507
126	NC_017238	TAC	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
127	NC_017238	ATT	2	6	4691	4696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206507
128	NC_017238	ACT	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
129	NC_017238	ACA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206507
130	NC_017238	ATC	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
131	NC_017238	A	6	6	4901	4906	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
132	NC_017238	AGG	2	6	5000	5005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206507
133	NC_017238	TAA	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
134	NC_017238	TTG	2	6	5038	5043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206507
135	NC_017238	TAA	2	6	5080	5085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
136	NC_017238	TTAT	2	8	5101	5108	25 %	75 %	0 %	0 %	384206507
137	NC_017238	CTA	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206507
138	NC_017238	TAA	2	6	5144	5149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
139	NC_017238	TAA	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206507
140	NC_017238	A	6	6	5159	5164	100 %	0 %	0 %	0 %	384206507
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