MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-9

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017228	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017228	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017228	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017228	A	7	7	60	66	100 %	0 %	0 %	0 %	384206151
5	NC_017228	TG	3	6	67	72	0 %	50 %	50 %	0 %	384206151
6	NC_017228	TA	3	6	118	123	50 %	50 %	0 %	0 %	384206151
7	NC_017228	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
8	NC_017228	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206151
9	NC_017228	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
10	NC_017228	ACT	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206151
11	NC_017228	TTGATT	2	12	415	426	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384206151
12	NC_017228	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
13	NC_017228	ATA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
14	NC_017228	T	6	6	560	565	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
15	NC_017228	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	384206151
16	NC_017228	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	384206151
17	NC_017228	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	384206151
18	NC_017228	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206151
19	NC_017228	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206151
20	NC_017228	AGT	3	9	714	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206151
21	NC_017228	TAA	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
22	NC_017228	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
23	NC_017228	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	384206151
24	NC_017228	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206151
25	NC_017228	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
26	NC_017228	AGTA	2	8	1110	1117	50 %	25 %	25 %	0 %	384206151
27	NC_017228	AGTA	2	8	1206	1213	50 %	25 %	25 %	0 %	384206151
28	NC_017228	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206151
29	NC_017228	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206151
30	NC_017228	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206151
31	NC_017228	GAA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
32	NC_017228	AAG	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
33	NC_017228	AGG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384206152
34	NC_017228	AG	4	8	1509	1516	50 %	0 %	50 %	0 %	384206152
35	NC_017228	AGC	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206152
36	NC_017228	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206152
37	NC_017228	A	6	6	1794	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	384206152
38	NC_017228	TTC	3	9	1812	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384206152
39	NC_017228	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206152
40	NC_017228	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206152
41	NC_017228	AATT	2	8	1896	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	384206152
42	NC_017228	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206153
43	NC_017228	A	6	6	2049	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	384206153
44	NC_017228	CAA	2	6	2088	2093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206153
45	NC_017228	TGG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206153
46	NC_017228	AGC	2	6	2172	2177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206153
47	NC_017228	GCT	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384206153
48	NC_017228	GGT	4	12	2283	2294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206153
49	NC_017228	GAT	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206153
50	NC_017228	ACT	2	6	2460	2465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206153
51	NC_017228	AGA	2	6	2519	2524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206153
52	NC_017228	TTAT	2	8	2526	2533	25 %	75 %	0 %	0 %	384206153
53	NC_017228	GTAA	2	8	2573	2580	50 %	25 %	25 %	0 %	384206153
54	NC_017228	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206154
55	NC_017228	GCAG	2	8	2634	2641	25 %	0 %	50 %	25 %	384206154
56	NC_017228	CAAG	2	8	2671	2678	50 %	0 %	25 %	25 %	384206154
57	NC_017228	AGA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206154
58	NC_017228	ATTCA	2	10	2717	2726	40 %	40 %	0 %	20 %	384206154
59	NC_017228	GAT	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206154
60	NC_017228	A	6	6	2755	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	384206154
61	NC_017228	GTT	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206154
62	NC_017228	GC	3	6	2835	2840	0 %	0 %	50 %	50 %	384206154
63	NC_017228	AGA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206154
64	NC_017228	A	6	6	2904	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	384206154
65	NC_017228	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	384206154
66	NC_017228	TA	3	6	2958	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	384206154
67	NC_017228	CTGATA	2	12	2978	2989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384206154
68	NC_017228	ATGT	2	8	3008	3015	25 %	50 %	25 %	0 %	384206154
69	NC_017228	TAA	2	6	3051	3056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206154
70	NC_017228	ATAA	2	8	3115	3122	75 %	25 %	0 %	0 %	384206154
71	NC_017228	TTA	2	6	3131	3136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206154
72	NC_017228	CT	3	6	3181	3186	0 %	50 %	0 %	50 %	384206154
73	NC_017228	CAAT	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	384206154
74	NC_017228	AGAT	2	8	3240	3247	50 %	25 %	25 %	0 %	384206154
75	NC_017228	ATT	2	6	3260	3265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206154
76	NC_017228	TTAAT	2	10	3269	3278	40 %	60 %	0 %	0 %	384206154
77	NC_017228	ATA	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206154
78	NC_017228	TGG	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206154
79	NC_017228	AGG	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017228	AATG	2	8	3362	3369	50 %	25 %	25 %	0 %	384206155
81	NC_017228	GCA	2	6	3410	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206155
82	NC_017228	ATG	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
83	NC_017228	T	6	6	3499	3504	0 %	100 %	0 %	0 %	384206155
84	NC_017228	G	6	6	3511	3516	0 %	0 %	100 %	0 %	384206155
85	NC_017228	ATC	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206155
86	NC_017228	TGG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206155
87	NC_017228	CCA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384206155
88	NC_017228	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206155
89	NC_017228	TAG	2	6	3743	3748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
90	NC_017228	GCA	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206155
91	NC_017228	GCAAA	2	10	3865	3874	60 %	0 %	20 %	20 %	384206155
92	NC_017228	ATG	2	6	3881	3886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206155
93	NC_017228	GTAA	2	8	3925	3932	50 %	25 %	25 %	0 %	384206155
94	NC_017228	TAA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206155
95	NC_017228	AGG	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017228	ATT	2	6	3966	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
97	NC_017228	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206156
98	NC_017228	ATT	2	6	3980	3985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
99	NC_017228	TAT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
100	NC_017228	AGA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206156
101	NC_017228	AT	3	6	4269	4274	50 %	50 %	0 %	0 %	384206156
102	NC_017228	TAA	3	9	4284	4292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206156
103	NC_017228	ATT	2	6	4336	4341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
104	NC_017228	TTA	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206156
105	NC_017228	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	384206156
106	NC_017228	ACT	2	6	4431	4436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206156
107	NC_017228	AGA	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206156
108	NC_017228	GTG	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384206156
109	NC_017228	A	6	6	4505	4510	100 %	0 %	0 %	0 %	384206156
110	NC_017228	ATG	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384206156
111	NC_017228	CAG	2	6	4613	4618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206156
112	NC_017228	GCA	2	6	4627	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206156
113	NC_017228	TAA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384206156
114	NC_017228	TCAT	2	8	4839	4846	25 %	50 %	0 %	25 %	384206156
115	NC_017228	CTA	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384206156
116	NC_017228	TAAAT	2	10	4931	4940	60 %	40 %	0 %	0 %	384206157
117	NC_017228	GAA	3	9	4978	4986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384206157
118	NC_017228	GTT	2	6	5191	5196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206157
119	NC_017228	GAATTT	2	12	5200	5211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384206157
120	NC_017228	A	6	6	5221	5226	100 %	0 %	0 %	0 %	384206157
121	NC_017228	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206157
122	NC_017228	TAGTGG	2	12	5262	5273	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384206157
123	NC_017228	AG	3	6	5280	5285	50 %	0 %	50 %	0 %	384206157
124	NC_017228	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	384206157
125	NC_017228	AGTG	2	8	5393	5400	25 %	25 %	50 %	0 %	384206157
126	NC_017228	TGT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384206158
127	NC_017228	GAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384206158
128	NC_017228	AGTA	2	8	5535	5542	50 %	25 %	25 %	0 %	384206158
129	NC_017228	TTA	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384206158
130	NC_017228	AT	3	6	5608	5613	50 %	50 %	0 %	0 %	384206158
131	NC_017228	ATACT	2	10	5735	5744	40 %	40 %	0 %	20 %	384206158
132	NC_017228	GGAC	2	8	5767	5774	25 %	0 %	50 %	25 %	384206158
133	NC_017228	TTGG	2	8	5799	5806	0 %	50 %	50 %	0 %	384206159
134	NC_017228	GGC	2	6	5846	5851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384206159
135	NC_017228	AT	3	6	5911	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	384206159
136	NC_017228	CAA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384206159
137	NC_017228	TA	3	6	5927	5932	50 %	50 %	0 %	0 %	384206159
138	NC_017228	A	6	6	6068	6073	100 %	0 %	0 %	0 %	384206159
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267	NC_017228	AT	3	6	11966	11971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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