MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 52979

< Previous12...3435363738394041424344...105106Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017221	CGGG	2	8	859068	859075	0 %	0 %	75 %	25 %	384201271
19002	NC_017221	TGG	3	9	859082	859090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201271
19003	NC_017221	CGG	2	6	859100	859105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201271
19004	NC_017221	CAT	2	6	859127	859132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201271
19005	NC_017221	GGC	2	6	859236	859241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201271
19006	NC_017221	GGC	2	6	859260	859265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201271
19007	NC_017221	CGG	2	6	859283	859288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201271
19008	NC_017221	GCCA	2	8	859312	859319	25 %	0 %	25 %	50 %	384201271
19009	NC_017221	TCG	2	6	859351	859356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201271
19010	NC_017221	CAT	2	6	859358	859363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201271
19011	NC_017221	ACGGTC	2	12	859414	859425	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384201271
19012	NC_017221	TTG	2	6	859537	859542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384201271
19013	NC_017221	GAT	2	6	859553	859558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201271
19014	NC_017221	GC	3	6	859571	859576	0 %	0 %	50 %	50 %	384201271
19015	NC_017221	CCTTG	2	10	859694	859703	0 %	40 %	20 %	40 %	384201271
19016	NC_017221	AATCG	2	10	859706	859715	40 %	20 %	20 %	20 %	384201271
19017	NC_017221	CGG	2	6	859745	859750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201271
19018	NC_017221	AAT	2	6	859751	859756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384201271
19019	NC_017221	GTG	2	6	859790	859795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201271
19020	NC_017221	TGG	2	6	859831	859836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_017221	ATA	2	6	859914	859919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_017221	CAT	2	6	859970	859975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_017221	AGG	2	6	860088	860093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_017221	CG	3	6	860211	860216	0 %	0 %	50 %	50 %	384201272
19025	NC_017221	CAA	2	6	860260	860265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201272
19026	NC_017221	TGC	3	9	860332	860340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201272
19027	NC_017221	GGT	2	6	860356	860361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201272
19028	NC_017221	CGT	2	6	860408	860413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201272
19029	NC_017221	GCAT	2	8	860415	860422	25 %	25 %	25 %	25 %	384201272
19030	NC_017221	GTG	2	6	860423	860428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201272
19031	NC_017221	TGG	2	6	860445	860450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201272
19032	NC_017221	TGC	2	6	860469	860474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201272
19033	NC_017221	GTG	2	6	860540	860545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201272
19034	NC_017221	ACA	2	6	860616	860621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201272
19035	NC_017221	TGC	2	6	860628	860633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201272
19036	NC_017221	CCG	2	6	860664	860669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201272
19037	NC_017221	GCC	2	6	860713	860718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201272
19038	NC_017221	TGG	2	6	860769	860774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201272
19039	NC_017221	CAG	2	6	860777	860782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201272
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19044	NC_017221	TGC	2	6	861060	861065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201272
19045	NC_017221	CGG	2	6	861066	861071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201272
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19050	NC_017221	GCC	2	6	861302	861307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201273
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19052	NC_017221	CAC	2	6	861425	861430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201273
19053	NC_017221	TCG	2	6	861477	861482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201273
19054	NC_017221	TGG	2	6	861493	861498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201273
19055	NC_017221	TCGTAT	2	12	861543	861554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384201273
19056	NC_017221	CGCC	2	8	861568	861575	0 %	0 %	25 %	75 %	384201273
19057	NC_017221	TGCT	2	8	861621	861628	0 %	50 %	25 %	25 %	384201273
19058	NC_017221	CTA	2	6	861651	861656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_017221	GAA	2	6	861658	861663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_017221	CAG	2	6	861758	861763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201274
19061	NC_017221	GGGTC	2	10	861859	861868	0 %	20 %	60 %	20 %	384201274
19062	NC_017221	GGA	2	6	861902	861907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384201274
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19064	NC_017221	GGC	2	6	861965	861970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201274
19065	NC_017221	TCG	2	6	861978	861983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201274
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19069	NC_017221	GGC	3	9	862139	862147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201274
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19071	NC_017221	AGC	2	6	862188	862193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201274
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19087	NC_017221	GAC	2	6	862747	862752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201274
19088	NC_017221	GC	3	6	862820	862825	0 %	0 %	50 %	50 %	384201275
19089	NC_017221	GCGT	2	8	862899	862906	0 %	25 %	50 %	25 %	384201275
19090	NC_017221	GGA	2	6	862988	862993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_017221	ATC	2	6	863003	863008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19092	NC_017221	GC	3	6	863017	863022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19093	NC_017221	CAG	2	6	863042	863047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201276
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19099	NC_017221	CGGC	2	8	863588	863595	0 %	0 %	50 %	50 %	384201276
19100	NC_017221	CAC	3	9	863618	863626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201276
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19102	NC_017221	ATG	2	6	863757	863762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201276
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19104	NC_017221	CAGG	2	8	863841	863848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19105	NC_017221	GGAGC	2	10	863849	863858	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19106	NC_017221	TCAAA	2	10	863897	863906	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19107	NC_017221	TTC	2	6	863929	863934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_017221	AACC	2	8	864058	864065	50 %	0 %	0 %	50 %	384201277
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19110	NC_017221	TAC	2	6	864197	864202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201277
19111	NC_017221	CGCC	2	8	864280	864287	0 %	0 %	25 %	75 %	384201277
19112	NC_017221	TAT	2	6	864299	864304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384201277
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19118	NC_017221	AG	3	6	864521	864526	50 %	0 %	50 %	0 %	384201277
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19120	NC_017221	TGG	2	6	864549	864554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201277
19121	NC_017221	TGAACA	2	12	864555	864566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384201277
19122	NC_017221	AC	3	6	864639	864644	50 %	0 %	0 %	50 %	384201277
19123	NC_017221	AAG	2	6	864689	864694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384201277
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19127	NC_017221	CGA	2	6	864865	864870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201277
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19134	NC_017221	TCA	3	9	865286	865294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19237	NC_017221	CCA	2	6	869729	869734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201283
19238	NC_017221	CG	3	6	869745	869750	0 %	0 %	50 %	50 %	384201283
19239	NC_017221	GAT	2	6	869802	869807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384201283
19240	NC_017221	GCA	2	6	869817	869822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384201283
19241	NC_017221	CGC	2	6	869844	869849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201283
19242	NC_017221	TGGTGC	2	12	869850	869861	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384201283
19243	NC_017221	GCG	2	6	869878	869883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201283
19244	NC_017221	GCC	3	9	869899	869907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201283
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19262	NC_017221	ACGAG	2	10	870643	870652	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19263	NC_017221	GCG	2	6	870710	870715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19264	NC_017221	GCG	2	6	870992	870997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201284
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19477	NC_017221	TGG	2	6	880552	880557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384201292
19478	NC_017221	GCC	2	6	880567	880572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19479	NC_017221	CCG	2	6	880603	880608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19480	NC_017221	GCC	2	6	880611	880616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19481	NC_017221	CTCGTG	2	12	880647	880658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201292
19482	NC_017221	TGC	2	6	880666	880671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384201292
19483	NC_017221	ACCCG	2	10	880729	880738	20 %	0 %	20 %	60 %	384201292
19484	NC_017221	GCC	2	6	880752	880757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19485	NC_017221	GCC	2	6	880761	880766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19486	NC_017221	CGC	2	6	880784	880789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19487	NC_017221	CAT	2	6	880790	880795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201292
19488	NC_017221	CGC	2	6	880798	880803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19489	NC_017221	CGG	2	6	880832	880837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384201292
19490	NC_017221	CAA	2	6	880838	880843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384201292
19491	NC_017221	TCA	2	6	880855	880860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201292
19492	NC_017221	CGC	3	9	880865	880873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19493	NC_017221	TCA	2	6	880876	880881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384201292
19494	NC_017221	CGC	2	6	880892	880897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384201292
19495	NC_017221	CTGC	2	8	880901	880908	0 %	25 %	25 %	50 %	384201292
19496	NC_017221	TCG	2	6	881067	881072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19497	NC_017221	TG	3	6	881153	881158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19498	NC_017221	AGTA	2	8	881181	881188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19499	NC_017221	AG	3	6	881243	881248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_017221	ACC	2	6	881315	881320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384201293

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