MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum KACC 91563 chromosome

Total Repeats: 52979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017221	GCA	2	6	441554	441559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200937
10002	NC_017221	GGC	2	6	441582	441587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200937
10003	NC_017221	ACGCG	2	10	441597	441606	20 %	0 %	40 %	40 %	384200937
10004	NC_017221	GC	4	8	441615	441622	0 %	0 %	50 %	50 %	384200937
10005	NC_017221	ATTCA	2	10	441651	441660	40 %	40 %	0 %	20 %	384200937
10006	NC_017221	CGCT	2	8	441703	441710	0 %	25 %	25 %	50 %	384200937
10007	NC_017221	GC	3	6	441712	441717	0 %	0 %	50 %	50 %	384200937
10008	NC_017221	TGG	3	9	441743	441751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200937
10009	NC_017221	ATGG	2	8	441803	441810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_017221	GAT	2	6	441875	441880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_017221	AAC	2	6	441965	441970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200938
10012	NC_017221	GGC	2	6	442001	442006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200938
10013	NC_017221	TGG	2	6	442022	442027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200938
10014	NC_017221	GTC	2	6	442032	442037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200938
10015	NC_017221	TAA	2	6	442079	442084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200938
10016	NC_017221	TGA	2	6	442169	442174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200938
10017	NC_017221	CGG	2	6	442213	442218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200938
10018	NC_017221	GCCCG	2	10	442254	442263	0 %	0 %	40 %	60 %	384200938
10019	NC_017221	CCG	2	6	442291	442296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200938
10020	NC_017221	GCATCC	2	12	442318	442329	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384200938
10021	NC_017221	CGA	2	6	442403	442408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200938
10022	NC_017221	GC	3	6	442411	442416	0 %	0 %	50 %	50 %	384200938
10023	NC_017221	AGG	2	6	442426	442431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200938
10024	NC_017221	CGG	2	6	442472	442477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200938
10025	NC_017221	CCCA	2	8	442479	442486	25 %	0 %	0 %	75 %	384200938
10026	NC_017221	CGT	2	6	442505	442510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200938
10027	NC_017221	CG	4	8	442526	442533	0 %	0 %	50 %	50 %	384200938
10028	NC_017221	CGG	2	6	442601	442606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200938
10029	NC_017221	CTAC	2	8	442627	442634	25 %	25 %	0 %	50 %	384200939
10030	NC_017221	GCC	2	6	442640	442645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200939
10031	NC_017221	CTGG	2	8	442663	442670	0 %	25 %	50 %	25 %	384200939
10032	NC_017221	GTGC	2	8	442721	442728	0 %	25 %	50 %	25 %	384200939
10033	NC_017221	CGC	2	6	442752	442757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200939
10034	NC_017221	TC	3	6	442825	442830	0 %	50 %	0 %	50 %	384200939
10035	NC_017221	CGG	2	6	442873	442878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200939
10036	NC_017221	CAT	2	6	442879	442884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200939
10037	NC_017221	CTG	2	6	442892	442897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10038	NC_017221	GCT	2	6	442951	442956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10039	NC_017221	ATC	2	6	442991	442996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200939
10040	NC_017221	GGC	2	6	443116	443121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200939
10041	NC_017221	TGG	2	6	443137	443142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200939
10042	NC_017221	CGC	2	6	443152	443157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200939
10043	NC_017221	ATC	2	6	443168	443173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200939
10044	NC_017221	TCG	2	6	443198	443203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10045	NC_017221	TGA	2	6	443220	443225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200939
10046	NC_017221	TGG	2	6	443226	443231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200939
10047	NC_017221	CTG	2	6	443249	443254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10048	NC_017221	TGC	2	6	443301	443306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10049	NC_017221	TCA	2	6	443316	443321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200939
10050	NC_017221	TGA	2	6	443337	443342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200939
10051	NC_017221	ATCT	2	8	443378	443385	25 %	50 %	0 %	25 %	384200939
10052	NC_017221	CTG	2	6	443405	443410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10053	NC_017221	GTT	2	6	443422	443427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200939
10054	NC_017221	CCTG	2	8	443428	443435	0 %	25 %	25 %	50 %	384200939
10055	NC_017221	GCG	2	6	443461	443466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200939
10056	NC_017221	TGCACC	2	12	443505	443516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384200939
10057	NC_017221	TTC	2	6	443612	443617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200939
10058	NC_017221	GCA	2	6	443623	443628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10059	NC_017221	GTG	3	9	443654	443662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200939
10060	NC_017221	CGCA	2	8	443740	443747	25 %	0 %	25 %	50 %	384200939
10061	NC_017221	GCA	2	6	443755	443760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200939
10062	NC_017221	GT	3	6	443915	443920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_017221	TCC	2	6	444005	444010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200940
10064	NC_017221	ATG	3	9	444037	444045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200940
10065	NC_017221	TGC	3	9	444049	444057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10066	NC_017221	TGA	2	6	444121	444126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200940
10067	NC_017221	GGT	2	6	444198	444203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200940
10068	NC_017221	TGC	2	6	444211	444216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10069	NC_017221	CGA	2	6	444233	444238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10070	NC_017221	TCG	2	6	444394	444399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10071	NC_017221	CAT	2	6	444401	444406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200940
10072	NC_017221	GAC	2	6	444516	444521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10073	NC_017221	CCA	2	6	444640	444645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200940
10074	NC_017221	GTC	2	6	444658	444663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200940
10075	NC_017221	GCC	2	6	444672	444677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200940
10076	NC_017221	ATC	2	6	444834	444839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200940
10077	NC_017221	GGC	2	6	444840	444845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200940
10078	NC_017221	CAC	2	6	444932	444937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200940
10079	NC_017221	CGGTGT	2	12	444950	444961	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384200940
10080	NC_017221	CCG	2	6	444973	444978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200940
10081	NC_017221	TGCCG	2	10	444999	445008	0 %	20 %	40 %	40 %	384200940
10082	NC_017221	ACT	2	6	445042	445047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200940
10083	NC_017221	CCT	2	6	445081	445086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200940
10084	NC_017221	CGG	2	6	445097	445102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200940
10085	NC_017221	CGCT	2	8	445105	445112	0 %	25 %	25 %	50 %	384200940
10086	NC_017221	CG	3	6	445204	445209	0 %	0 %	50 %	50 %	384200940
10087	NC_017221	AAG	2	6	445212	445217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200940
10088	NC_017221	TGA	2	6	445462	445467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200940
10089	NC_017221	ACT	2	6	445483	445488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200940
10090	NC_017221	CAA	2	6	445499	445504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384200940
10091	NC_017221	TAA	2	6	445642	445647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200941
10092	NC_017221	ATG	2	6	445689	445694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200942
10093	NC_017221	CGG	2	6	445765	445770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200942
10094	NC_017221	CGA	2	6	445771	445776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200942
10095	NC_017221	TCG	2	6	445779	445784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200942
10096	NC_017221	TCA	2	6	445845	445850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200942
10097	NC_017221	GGCCGA	2	12	445948	445959	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384200942
10098	NC_017221	TGC	2	6	445980	445985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200942
10099	NC_017221	GCT	2	6	446011	446016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200942
10100	NC_017221	AAG	2	6	446042	446047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200942
10101	NC_017221	CGCC	2	8	446125	446132	0 %	0 %	25 %	75 %	384200942
10102	NC_017221	CCGC	2	8	446158	446165	0 %	0 %	25 %	75 %	384200942
10103	NC_017221	CAT	2	6	446197	446202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200942
10104	NC_017221	CTA	2	6	446224	446229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200942
10105	NC_017221	CCCGG	2	10	446255	446264	0 %	0 %	40 %	60 %	384200942
10106	NC_017221	CGC	2	6	446287	446292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200942
10107	NC_017221	CCA	2	6	446304	446309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200942
10108	NC_017221	AGT	2	6	446322	446327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200942
10109	NC_017221	CCG	2	6	446328	446333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_017221	CTCCC	2	10	446341	446350	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10111	NC_017221	AG	3	6	446363	446368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017221	CATT	2	8	446557	446564	25 %	50 %	0 %	25 %	384200943
10113	NC_017221	GCG	2	6	446571	446576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200943
10114	NC_017221	TCA	2	6	446616	446621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200943
10115	NC_017221	TGC	2	6	446682	446687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200943
10116	NC_017221	TTGTC	2	10	446766	446775	0 %	60 %	20 %	20 %	384200943
10117	NC_017221	CTT	2	6	446782	446787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200943
10118	NC_017221	GCC	2	6	446794	446799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200943
10119	NC_017221	TCA	2	6	446901	446906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200943
10120	NC_017221	CTG	2	6	446984	446989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200943
10121	NC_017221	CAG	2	6	447183	447188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200943
10122	NC_017221	CGAC	2	8	447205	447212	25 %	0 %	25 %	50 %	384200943
10123	NC_017221	AAGG	2	8	447251	447258	50 %	0 %	50 %	0 %	384200943
10124	NC_017221	GCTC	2	8	447309	447316	0 %	25 %	25 %	50 %	384200943
10125	NC_017221	CGTG	2	8	447322	447329	0 %	25 %	50 %	25 %	384200943
10126	NC_017221	GGC	2	6	447350	447355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200943
10127	NC_017221	GAT	2	6	447415	447420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200943
10128	NC_017221	TGCGC	2	10	447462	447471	0 %	20 %	40 %	40 %	384200943
10129	NC_017221	GGC	2	6	447590	447595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200943
10130	NC_017221	AACG	2	8	447614	447621	50 %	0 %	25 %	25 %	384200943
10131	NC_017221	GTG	2	6	447647	447652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200943
10132	NC_017221	CCG	2	6	447729	447734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200943
10133	NC_017221	CGA	2	6	447760	447765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200943
10134	NC_017221	GTT	2	6	447784	447789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384200943
10135	NC_017221	TGT	2	6	447803	447808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_017221	CAG	2	6	447885	447890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10137	NC_017221	ATG	2	6	447953	447958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_017221	TGG	2	6	448113	448118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200944
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10143	NC_017221	GAT	2	6	448336	448341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200944
10144	NC_017221	CTG	2	6	448505	448510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200944
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10146	NC_017221	GTG	2	6	448540	448545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200944
10147	NC_017221	CTC	2	6	448574	448579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384200944
10148	NC_017221	A	6	6	448603	448608	100 %	0 %	0 %	0 %	384200944
10149	NC_017221	AG	3	6	448688	448693	50 %	0 %	50 %	0 %	384200944
10150	NC_017221	GT	3	6	448727	448732	0 %	50 %	50 %	0 %	384200944
10151	NC_017221	AGC	2	6	448763	448768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200944
10152	NC_017221	CTT	2	6	448817	448822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200944
10153	NC_017221	GTATC	2	10	448836	448845	20 %	40 %	20 %	20 %	384200944
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10155	NC_017221	AAGCA	2	10	448915	448924	60 %	0 %	20 %	20 %	384200944
10156	NC_017221	CTT	2	6	448946	448951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384200944
10157	NC_017221	GAA	2	6	449041	449046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384200944
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10160	NC_017221	TGG	2	6	449131	449136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384200944
10161	NC_017221	CTG	2	6	449176	449181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200944
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10173	NC_017221	GAT	2	6	450040	450045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200944
10174	NC_017221	TGA	2	6	450090	450095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200944
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10183	NC_017221	GGAA	2	8	450422	450429	50 %	0 %	50 %	0 %	384200944
10184	NC_017221	ATA	2	6	450479	450484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384200944
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10191	NC_017221	ATG	2	6	450956	450961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200944
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10195	NC_017221	TGA	2	6	451077	451082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384200944
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10200	NC_017221	TCGTA	2	10	451356	451365	20 %	40 %	20 %	20 %	384200944
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10202	NC_017221	GTC	2	6	451522	451527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200945
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10206	NC_017221	CATG	2	8	451690	451697	25 %	25 %	25 %	25 %	384200945
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10217	NC_017221	CTG	2	6	452161	452166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200945
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10221	NC_017221	GCA	2	6	452280	452285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200945
10222	NC_017221	GGC	2	6	452370	452375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10223	NC_017221	ACGGCA	2	12	452417	452428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10224	NC_017221	TGC	2	6	452429	452434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10225	NC_017221	TTAG	2	8	452571	452578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10226	NC_017221	ATC	2	6	452596	452601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10227	NC_017221	CGG	2	6	452611	452616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10228	NC_017221	TCT	2	6	452625	452630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10229	NC_017221	GAA	2	6	452649	452654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_017221	CAAA	2	8	452751	452758	75 %	0 %	0 %	25 %	384200946
10231	NC_017221	CAG	2	6	452798	452803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200946
10232	NC_017221	ACC	2	6	452834	452839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384200946
10233	NC_017221	GAG	2	6	452867	452872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200946
10234	NC_017221	CGA	2	6	452902	452907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384200946
10235	NC_017221	CG	3	6	452920	452925	0 %	0 %	50 %	50 %	384200946
10236	NC_017221	GGCC	2	8	452959	452966	0 %	0 %	50 %	50 %	384200946
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10238	NC_017221	GAG	2	6	453074	453079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384200946
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10361	NC_017221	AC	3	6	458046	458051	50 %	0 %	0 %	50 %	384200947
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10364	NC_017221	CCGT	2	8	458076	458083	0 %	25 %	25 %	50 %	384200947
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10483	NC_017221	TGC	2	6	463257	463262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200952
10484	NC_017221	CCG	2	6	463350	463355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200952
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10486	NC_017221	CGC	3	9	463426	463434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384200952
10487	NC_017221	CG	4	8	463495	463502	0 %	0 %	50 %	50 %	384200952
10488	NC_017221	CGG	2	6	463531	463536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384200952
10489	NC_017221	CAT	2	6	463552	463557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384200952
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10493	NC_017221	CG	3	6	463716	463721	0 %	0 %	50 %	50 %	384200952
10494	NC_017221	CCGT	2	8	463858	463865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10495	NC_017221	AGA	2	6	463980	463985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10496	NC_017221	TCG	2	6	464148	464153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384200953
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