MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 43548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_017217	CTT	2	6	1699777	1699782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384196024
38003	NC_017217	GAA	2	6	1699819	1699824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384196024
38004	NC_017217	ATC	2	6	1699840	1699845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384196024
38005	NC_017217	TCT	2	6	1699934	1699939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384196024
38006	NC_017217	CAC	2	6	1699983	1699988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38007	NC_017217	CATT	2	8	1699993	1700000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38008	NC_017217	ATTA	2	8	1700008	1700015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38009	NC_017217	TA	3	6	1700014	1700019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38010	NC_017217	CTT	2	6	1700105	1700110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384196025
38011	NC_017217	GC	3	6	1700154	1700159	0 %	0 %	50 %	50 %	384196025
38012	NC_017217	C	6	6	1700182	1700187	0 %	0 %	0 %	100 %	384196025
38013	NC_017217	CCA	2	6	1700189	1700194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384196025
38014	NC_017217	CGA	2	6	1700272	1700277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196025
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38016	NC_017217	CTG	2	6	1700344	1700349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196025
38017	NC_017217	TGCT	2	8	1700439	1700446	0 %	50 %	25 %	25 %	384196025
38018	NC_017217	GCG	2	6	1700499	1700504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196025
38019	NC_017217	TCC	2	6	1700590	1700595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384196025
38020	NC_017217	CGC	2	6	1700615	1700620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384196025
38021	NC_017217	CTC	2	6	1701025	1701030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384196025
38022	NC_017217	TCT	2	6	1701088	1701093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384196025
38023	NC_017217	CCTG	2	8	1701098	1701105	0 %	25 %	25 %	50 %	384196025
38024	NC_017217	GCT	2	6	1701118	1701123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196025
38025	NC_017217	CGAAT	2	10	1701208	1701217	40 %	20 %	20 %	20 %	384196025
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38030	NC_017217	GTAT	2	8	1701287	1701294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38031	NC_017217	GAGC	2	8	1701647	1701654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38032	NC_017217	CGG	2	6	1701660	1701665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38033	NC_017217	CAA	2	6	1701695	1701700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38034	NC_017217	CCT	2	6	1701775	1701780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38035	NC_017217	TAG	2	6	1701802	1701807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38037	NC_017217	AT	3	6	1701840	1701845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38038	NC_017217	AGG	2	6	1701864	1701869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38039	NC_017217	GGCA	2	8	1701902	1701909	25 %	0 %	50 %	25 %	384196026
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38043	NC_017217	ACG	2	6	1702036	1702041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196026
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38051	NC_017217	CTG	2	6	1702446	1702451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196026
38052	NC_017217	CTA	2	6	1702571	1702576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384196026
38053	NC_017217	CAG	2	6	1702713	1702718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196026
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38055	NC_017217	CGAT	2	8	1702975	1702982	25 %	25 %	25 %	25 %	384196026
38056	NC_017217	GC	4	8	1703057	1703064	0 %	0 %	50 %	50 %	384196026
38057	NC_017217	AAC	2	6	1703079	1703084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384196026
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38062	NC_017217	CCGG	2	8	1703335	1703342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38063	NC_017217	ACCGTC	2	12	1703451	1703462	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384196027
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38090	NC_017217	TGCA	2	8	1704596	1704603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38091	NC_017217	AAT	2	6	1704759	1704764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38092	NC_017217	ATT	2	6	1704771	1704776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38093	NC_017217	ATC	2	6	1704839	1704844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38095	NC_017217	CAGCT	2	10	1704861	1704870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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38099	NC_017217	AGG	2	6	1705204	1705209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38100	NC_017217	CCG	2	6	1705223	1705228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38101	NC_017217	CATG	2	8	1705364	1705371	25 %	25 %	25 %	25 %	384196028
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38103	NC_017217	GCA	2	6	1705418	1705423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196029
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38106	NC_017217	CCTT	2	8	1705497	1705504	0 %	50 %	0 %	50 %	384196029
38107	NC_017217	TGT	2	6	1705513	1705518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384196029
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38109	NC_017217	GGC	2	6	1705551	1705556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196029
38110	NC_017217	TGC	2	6	1705597	1705602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196029
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38112	NC_017217	CCCAG	2	10	1705681	1705690	20 %	0 %	20 %	60 %	384196029
38113	NC_017217	CGG	2	6	1705720	1705725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196029
38114	NC_017217	GCACGC	2	12	1705789	1705800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384196029
38115	NC_017217	GAGCAC	2	12	1705805	1705816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196029
38116	NC_017217	AGC	2	6	1705824	1705829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196029
38117	NC_017217	CA	3	6	1705839	1705844	50 %	0 %	0 %	50 %	384196029
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38119	NC_017217	TGA	2	6	1705861	1705866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384196029
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38225	NC_017217	CCTA	2	8	1710446	1710453	25 %	25 %	0 %	50 %	384196032
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38231	NC_017217	GCAT	2	8	1710656	1710663	25 %	25 %	25 %	25 %	384196032
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38314	NC_017217	CGT	2	6	1715235	1715240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196032
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38319	NC_017217	CG	3	6	1715417	1715422	0 %	0 %	50 %	50 %	384196032
38320	NC_017217	GGC	2	6	1715470	1715475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196032
38321	NC_017217	TTC	2	6	1715653	1715658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384196032
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38324	NC_017217	GCC	2	6	1715720	1715725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38326	NC_017217	GC	3	6	1715745	1715750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38327	NC_017217	TCC	2	6	1715796	1715801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384196033
38328	NC_017217	TTCCT	2	10	1715804	1715813	0 %	60 %	0 %	40 %	384196033
38329	NC_017217	TCG	2	6	1715826	1715831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196033
38330	NC_017217	CGC	2	6	1715843	1715848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384196033
38331	NC_017217	CGA	2	6	1715889	1715894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384196033
38332	NC_017217	ATGGCG	2	12	1715910	1715921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384196033
38333	NC_017217	CGC	2	6	1715950	1715955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384196033
38334	NC_017217	CTG	2	6	1716164	1716169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196033
38335	NC_017217	ACC	2	6	1716214	1716219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384196033
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38343	NC_017217	CAC	2	6	1716408	1716413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384196033
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38345	NC_017217	CAGC	2	8	1716442	1716449	25 %	0 %	25 %	50 %	384196033
38346	NC_017217	CCG	2	6	1716595	1716600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384196033
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38348	NC_017217	CGG	2	6	1716646	1716651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196033
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38451	NC_017217	TCG	2	6	1722109	1722114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38452	NC_017217	GC	3	6	1722128	1722133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38453	NC_017217	ACG	2	6	1722141	1722146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38455	NC_017217	CA	3	6	1722227	1722232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38456	NC_017217	TGA	2	6	1722305	1722310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384196037
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38459	NC_017217	CTG	2	6	1722424	1722429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196037
38460	NC_017217	ACGC	2	8	1722434	1722441	25 %	0 %	25 %	50 %	384196037
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38462	NC_017217	GCT	2	6	1722474	1722479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196037
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38464	NC_017217	G	6	6	1722554	1722559	0 %	0 %	100 %	0 %	384196037
38465	NC_017217	GCCG	2	8	1722588	1722595	0 %	0 %	50 %	50 %	384196037
38466	NC_017217	GCGTCT	2	12	1722606	1722617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196037
38467	NC_017217	GGA	2	6	1722678	1722683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384196037
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38483	NC_017217	TACCC	2	10	1723072	1723081	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38484	NC_017217	GC	3	6	1723157	1723162	0 %	0 %	50 %	50 %	384196038
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38491	NC_017217	CAT	2	6	1723420	1723425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384196038
38492	NC_017217	CGG	2	6	1723456	1723461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384196038
38493	NC_017217	GGA	2	6	1723480	1723485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384196038
38494	NC_017217	CGT	2	6	1723525	1723530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196038
38495	NC_017217	TGA	2	6	1723609	1723614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384196038
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38499	NC_017217	CTG	2	6	1723766	1723771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384196038
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