MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 43548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017217	CGA	2	6	46904	46909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194666
1002	NC_017217	AAC	2	6	47019	47024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017217	GT	3	6	47133	47138	0 %	50 %	50 %	0 %	384194667
1004	NC_017217	GCC	2	6	47216	47221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194667
1005	NC_017217	GAG	2	6	47234	47239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194667
1006	NC_017217	CGGT	2	8	47241	47248	0 %	25 %	50 %	25 %	384194667
1007	NC_017217	GCG	2	6	47249	47254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194667
1008	NC_017217	CG	3	6	47274	47279	0 %	0 %	50 %	50 %	384194667
1009	NC_017217	GAT	2	6	47349	47354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194668
1010	NC_017217	CCA	2	6	47399	47404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194668
1011	NC_017217	GC	4	8	47432	47439	0 %	0 %	50 %	50 %	384194668
1012	NC_017217	GAG	2	6	47442	47447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194668
1013	NC_017217	CAG	2	6	47451	47456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194668
1014	NC_017217	CCG	2	6	47539	47544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194668
1015	NC_017217	CCGAC	2	10	47665	47674	20 %	0 %	20 %	60 %	384194668
1016	NC_017217	GCTG	2	8	47728	47735	0 %	25 %	50 %	25 %	384194668
1017	NC_017217	TCG	2	6	47749	47754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194668
1018	NC_017217	CTTCGA	2	12	47804	47815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384194668
1019	NC_017217	CGA	2	6	47822	47827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194668
1020	NC_017217	TTC	2	6	47871	47876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194668
1021	NC_017217	GC	4	8	47924	47931	0 %	0 %	50 %	50 %	384194668
1022	NC_017217	TA	3	6	47947	47952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017217	GTG	3	9	47978	47986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017217	CCA	2	6	48015	48020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_017217	ATG	2	6	48062	48067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194669
1026	NC_017217	CGGC	2	8	48080	48087	0 %	0 %	50 %	50 %	384194669
1027	NC_017217	CAG	2	6	48097	48102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1028	NC_017217	TGG	2	6	48108	48113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194669
1029	NC_017217	AGC	2	6	48134	48139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1030	NC_017217	ATG	2	6	48164	48169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194669
1031	NC_017217	CTG	2	6	48181	48186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1032	NC_017217	GCC	2	6	48220	48225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194669
1033	NC_017217	GTC	2	6	48232	48237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1034	NC_017217	TCG	2	6	48245	48250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1035	NC_017217	GGA	2	6	48256	48261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384194669
1036	NC_017217	TGA	2	6	48328	48333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194669
1037	NC_017217	CTCGG	2	10	48383	48392	0 %	20 %	40 %	40 %	384194669
1038	NC_017217	CTG	2	6	48410	48415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1039	NC_017217	TCT	2	6	48462	48467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384194669
1040	NC_017217	GGGC	2	8	48486	48493	0 %	0 %	75 %	25 %	384194669
1041	NC_017217	GGC	2	6	48496	48501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194669
1042	NC_017217	GC	3	6	48545	48550	0 %	0 %	50 %	50 %	384194669
1043	NC_017217	CCTG	2	8	48669	48676	0 %	25 %	25 %	50 %	384194669
1044	NC_017217	GTA	2	6	48688	48693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384194669
1045	NC_017217	TCG	2	6	48767	48772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1046	NC_017217	GCC	2	6	48850	48855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194669
1047	NC_017217	AGC	2	6	48866	48871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1048	NC_017217	ACC	2	6	48944	48949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194669
1049	NC_017217	GAA	2	6	49060	49065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194669
1050	NC_017217	CAC	2	6	49069	49074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194669
1051	NC_017217	GCCAT	2	10	49083	49092	20 %	20 %	20 %	40 %	384194669
1052	NC_017217	GCG	2	6	49115	49120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194669
1053	NC_017217	ACG	2	6	49197	49202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1054	NC_017217	CCCT	2	8	49234	49241	0 %	25 %	0 %	75 %	384194669
1055	NC_017217	GTGC	2	8	49253	49260	0 %	25 %	50 %	25 %	384194669
1056	NC_017217	CGG	2	6	49296	49301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194669
1057	NC_017217	AGC	2	6	49331	49336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1058	NC_017217	CTG	2	6	49405	49410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1059	NC_017217	AGC	2	6	49420	49425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1060	NC_017217	CAA	2	6	49480	49485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384194669
1061	NC_017217	ACC	2	6	49505	49510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194669
1062	NC_017217	GGC	2	6	49529	49534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194669
1063	NC_017217	CAC	2	6	49600	49605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384194669
1064	NC_017217	TCG	2	6	49622	49627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1065	NC_017217	AGC	2	6	49643	49648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1066	NC_017217	CG	3	6	49778	49783	0 %	0 %	50 %	50 %	384194669
1067	NC_017217	CGGT	2	8	49796	49803	0 %	25 %	50 %	25 %	384194669
1068	NC_017217	GTT	2	6	49810	49815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384194669
1069	NC_017217	CGC	2	6	49816	49821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194669
1070	NC_017217	CGAA	2	8	49920	49927	50 %	0 %	25 %	25 %	384194669
1071	NC_017217	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	384194669
1072	NC_017217	AGC	2	6	49970	49975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1073	NC_017217	CGG	2	6	50068	50073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194669
1074	NC_017217	GCC	2	6	50219	50224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194669
1075	NC_017217	CTG	2	6	50263	50268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194669
1076	NC_017217	TG	3	6	50318	50323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017217	TGAA	2	8	50378	50385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017217	GC	3	6	50398	50403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_017217	AT	3	6	50445	50450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017217	GCT	2	6	50466	50471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_017217	CAAT	2	8	50520	50527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_017217	GGTCGA	2	12	50664	50675	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1083	NC_017217	TCG	2	6	50696	50701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017217	ATG	2	6	50705	50710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017217	AGT	2	6	50721	50726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017217	GAT	2	6	50773	50778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017217	CGT	2	6	50787	50792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017217	GCA	2	6	50937	50942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017217	CGC	2	6	51006	51011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017217	CG	3	6	51016	51021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_017217	AGC	2	6	51026	51031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_017217	GGTA	2	8	51056	51063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017217	GTC	2	6	51103	51108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017217	GC	3	6	51112	51117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_017217	CGC	2	6	51139	51144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_017217	GCC	2	6	51184	51189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_017217	CG	3	6	51204	51209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_017217	GAG	2	6	51218	51223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017217	CTG	2	6	51224	51229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017217	GT	3	6	51297	51302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017217	GGAAAA	2	12	51364	51375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017217	GA	3	6	51487	51492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017217	GA	3	6	51497	51502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017217	CGC	2	6	51519	51524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_017217	AAG	2	6	51713	51718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384194670
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1108	NC_017217	TGG	2	6	51897	51902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194670
1109	NC_017217	TGC	2	6	51927	51932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194670
1110	NC_017217	TG	3	6	51948	51953	0 %	50 %	50 %	0 %	384194670
1111	NC_017217	TGG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017217	GAA	2	6	52163	52168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017217	GT	3	6	52312	52317	0 %	50 %	50 %	0 %	384194671
1114	NC_017217	GCT	2	6	52336	52341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1115	NC_017217	TGG	2	6	52368	52373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384194671
1116	NC_017217	GAGG	2	8	52507	52514	25 %	0 %	75 %	0 %	384194671
1117	NC_017217	CGGTC	2	10	52543	52552	0 %	20 %	40 %	40 %	384194671
1118	NC_017217	GTC	2	6	52555	52560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1119	NC_017217	CAT	2	6	52573	52578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194671
1120	NC_017217	CGC	2	6	52584	52589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384194671
1121	NC_017217	GTC	2	6	52597	52602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1122	NC_017217	CGT	2	6	52635	52640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1123	NC_017217	TCG	2	6	52718	52723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1124	NC_017217	CAG	2	6	52729	52734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194671
1125	NC_017217	GC	3	6	52736	52741	0 %	0 %	50 %	50 %	384194671
1126	NC_017217	GGC	2	6	52800	52805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384194671
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1128	NC_017217	ACG	2	6	52841	52846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384194671
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1254	NC_017217	C	7	7	58453	58459	0 %	0 %	0 %	100 %	384194674
1255	NC_017217	CTGG	2	8	58480	58487	0 %	25 %	50 %	25 %	384194674
1256	NC_017217	TAC	2	6	58520	58525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384194674
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