MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis CNCM I-2494 chromosome

Total Repeats: 43527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017215	CG	4	8	252	259	0 %	0 %	50 %	50 %	384191412
2	NC_017215	GGCT	2	8	265	272	0 %	25 %	50 %	25 %	384191412
3	NC_017215	GGT	2	6	294	299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191412
4	NC_017215	CAC	2	6	303	308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191412
5	NC_017215	GC	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	384191412
6	NC_017215	GCC	2	6	435	440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
7	NC_017215	GGA	2	6	474	479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191412
8	NC_017215	GCC	2	6	511	516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
9	NC_017215	GCG	3	9	592	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191412
10	NC_017215	CGA	2	6	639	644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
11	NC_017215	GCA	2	6	687	692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
12	NC_017215	ACG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
13	NC_017215	CAC	2	6	780	785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191412
14	NC_017215	CGC	2	6	800	805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
15	NC_017215	GTTC	2	8	821	828	0 %	50 %	25 %	25 %	384191412
16	NC_017215	CGG	2	6	990	995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191412
17	NC_017215	CG	3	6	1067	1072	0 %	0 %	50 %	50 %	384191412
18	NC_017215	CGAG	2	8	1085	1092	25 %	0 %	50 %	25 %	384191412
19	NC_017215	ACGA	2	8	1099	1106	50 %	0 %	25 %	25 %	384191412
20	NC_017215	TGC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191412
21	NC_017215	CGA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
22	NC_017215	CGG	2	6	1221	1226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191412
23	NC_017215	TTC	2	6	1249	1254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191412
24	NC_017215	GCC	2	6	1311	1316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
25	NC_017215	GGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191412
26	NC_017215	GCC	2	6	1386	1391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
27	NC_017215	ACG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
28	NC_017215	CAA	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191412
29	NC_017215	CT	3	6	1542	1547	0 %	50 %	0 %	50 %	384191412
30	NC_017215	ACC	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191412
31	NC_017215	CAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191412
32	NC_017215	CAT	2	6	1632	1637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191412
33	NC_017215	CG	4	8	1638	1645	0 %	0 %	50 %	50 %	384191412
34	NC_017215	CGA	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
35	NC_017215	GCC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191412
36	NC_017215	CG	3	6	1739	1744	0 %	0 %	50 %	50 %	384191412
37	NC_017215	CGG	2	6	1785	1790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191412
38	NC_017215	ACCAC	2	10	1796	1805	40 %	0 %	0 %	60 %	384191412
39	NC_017215	CATG	2	8	1809	1816	25 %	25 %	25 %	25 %	384191412
40	NC_017215	AGC	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191412
41	NC_017215	AGC	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017215	T	6	6	1994	1999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017215	GGC	3	9	2011	2019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017215	CGG	2	6	2028	2033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017215	GAG	2	6	2093	2098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017215	TG	3	6	2156	2161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017215	CGC	2	6	2165	2170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017215	CGG	2	6	2224	2229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017215	TGT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017215	CA	3	6	2280	2285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017215	TAC	2	6	2351	2356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017215	TCG	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017215	TCA	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017215	CGG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017215	TTCG	2	8	2541	2548	0 %	50 %	25 %	25 %	384191413
56	NC_017215	GAC	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191413
57	NC_017215	ACGC	2	8	2582	2589	25 %	0 %	25 %	50 %	384191413
58	NC_017215	GGC	2	6	2625	2630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191413
59	NC_017215	CG	4	8	2673	2680	0 %	0 %	50 %	50 %	384191413
60	NC_017215	CGT	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191413
61	NC_017215	GCT	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191413
62	NC_017215	TGC	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191413
63	NC_017215	GAC	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191413
64	NC_017215	CCGGC	2	10	2813	2822	0 %	0 %	40 %	60 %	384191413
65	NC_017215	CGA	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191413
66	NC_017215	GCG	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191413
67	NC_017215	CCGTT	2	10	3126	3135	0 %	40 %	20 %	40 %	384191413
68	NC_017215	CCG	2	6	3245	3250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191413
69	NC_017215	TGG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191413
70	NC_017215	AACGC	2	10	3344	3353	40 %	0 %	20 %	40 %	384191413
71	NC_017215	CGGC	2	8	3395	3402	0 %	0 %	50 %	50 %	384191413
72	NC_017215	GAC	2	6	3537	3542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191413
73	NC_017215	GCA	2	6	3570	3575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191413
74	NC_017215	GAG	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191413
75	NC_017215	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017215	AGGA	2	8	3674	3681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017215	TCG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
78	NC_017215	TCG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
79	NC_017215	GCC	2	6	3892	3897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191414
80	NC_017215	CG	3	6	3901	3906	0 %	0 %	50 %	50 %	384191414
81	NC_017215	AGA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191414
82	NC_017215	ACA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384191414
83	NC_017215	GAC	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191414
84	NC_017215	CGG	2	6	4020	4025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191414
85	NC_017215	TCG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
86	NC_017215	CGA	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191414
87	NC_017215	CGTT	2	8	4123	4130	0 %	50 %	25 %	25 %	384191414
88	NC_017215	GCC	2	6	4141	4146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191414
89	NC_017215	CG	3	6	4207	4212	0 %	0 %	50 %	50 %	384191414
90	NC_017215	AGG	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191414
91	NC_017215	GAG	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191414
92	NC_017215	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	384191414
93	NC_017215	CGT	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
94	NC_017215	CGA	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191414
95	NC_017215	GGC	2	6	4506	4511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191414
96	NC_017215	GAC	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191414
97	NC_017215	TCG	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
98	NC_017215	CGCTGG	2	12	4652	4663	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384191414
99	NC_017215	TCT	2	6	4686	4691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191414
100	NC_017215	GTG	2	6	4720	4725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191414
101	NC_017215	CGA	2	6	4728	4733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191414
102	NC_017215	CGT	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191414
103	NC_017215	ATC	2	6	4804	4809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191414
104	NC_017215	GCG	2	6	4816	4821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191414
105	NC_017215	GCCCAT	2	12	4852	4863	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384191414
106	NC_017215	GGC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191414
107	NC_017215	GGC	2	6	4900	4905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191414
108	NC_017215	GCCG	2	8	4935	4942	0 %	0 %	50 %	50 %	384191414
109	NC_017215	GCC	2	6	4966	4971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191414
110	NC_017215	GCAT	2	8	4997	5004	25 %	25 %	25 %	25 %	384191414
111	NC_017215	GCAG	2	8	5005	5012	25 %	0 %	50 %	25 %	384191414
112	NC_017215	GAGC	2	8	5114	5121	25 %	0 %	50 %	25 %	384191414
113	NC_017215	GCCG	2	8	5162	5169	0 %	0 %	50 %	50 %	384191415
114	NC_017215	GAG	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191415
115	NC_017215	CGA	2	6	5264	5269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191415
116	NC_017215	GTT	2	6	5285	5290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384191415
117	NC_017215	CGCA	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	384191415
118	NC_017215	TGGG	2	8	5394	5401	0 %	25 %	75 %	0 %	384191415
119	NC_017215	CGT	2	6	5443	5448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191415
120	NC_017215	TGC	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191415
121	NC_017215	GCAA	2	8	5572	5579	50 %	0 %	25 %	25 %	384191415
122	NC_017215	GCG	2	6	5635	5640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017215	GC	3	6	5664	5669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017215	C	6	6	5683	5688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
125	NC_017215	TAG	2	6	5705	5710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017215	TG	3	6	5763	5768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017215	CAAC	2	8	5815	5822	50 %	0 %	0 %	50 %	384191416
128	NC_017215	CGATC	2	10	5859	5868	20 %	20 %	20 %	40 %	384191416
129	NC_017215	ACG	2	6	5903	5908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
130	NC_017215	GAC	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
131	NC_017215	ACG	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
132	NC_017215	CAC	2	6	6034	6039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191416
133	NC_017215	TCG	2	6	6053	6058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191416
134	NC_017215	CGA	2	6	6141	6146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
135	NC_017215	CGA	2	6	6165	6170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
136	NC_017215	CGG	2	6	6225	6230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
137	NC_017215	CGG	4	12	6237	6248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
138	NC_017215	CGG	2	6	6261	6266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
139	NC_017215	GGT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384191416
140	NC_017215	CG	3	6	6308	6313	0 %	0 %	50 %	50 %	384191416
141	NC_017215	CTA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191416
142	NC_017215	CGA	3	9	6408	6416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
143	NC_017215	GAC	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
144	NC_017215	GCA	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
145	NC_017215	CAG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
146	NC_017215	CGA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
147	NC_017215	GC	3	6	6571	6576	0 %	0 %	50 %	50 %	384191416
148	NC_017215	CGGCGA	2	12	6588	6599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384191416
149	NC_017215	GGA	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191416
150	NC_017215	CCA	2	6	6821	6826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191416
151	NC_017215	GGC	2	6	6832	6837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
152	NC_017215	GAG	2	6	6844	6849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191416
153	NC_017215	CG	3	6	6856	6861	0 %	0 %	50 %	50 %	384191416
154	NC_017215	CAAAGA	2	12	6909	6920	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384191416
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159	NC_017215	CAT	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191416
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161	NC_017215	GAA	2	6	7155	7160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191416
162	NC_017215	CGC	2	6	7177	7182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191416
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164	NC_017215	CGAG	2	8	7244	7251	25 %	0 %	50 %	25 %	384191416
165	NC_017215	GGC	2	6	7285	7290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
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167	NC_017215	CGG	3	9	7422	7430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384191416
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170	NC_017215	CGGC	2	8	7565	7572	0 %	0 %	50 %	50 %	384191416
171	NC_017215	GCC	2	6	7590	7595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191416
172	NC_017215	AAGGC	2	10	7673	7682	40 %	0 %	40 %	20 %	384191416
173	NC_017215	ACC	2	6	7765	7770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191416
174	NC_017215	ACC	2	6	7781	7786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191416
175	NC_017215	CGA	2	6	7827	7832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
176	NC_017215	CGA	2	6	7854	7859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191416
177	NC_017215	CCG	2	6	7869	7874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191416
178	NC_017215	CA	3	6	7895	7900	50 %	0 %	0 %	50 %	384191416
179	NC_017215	GCC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_017215	GT	3	6	7954	7959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017215	AACC	2	8	8002	8009	50 %	0 %	0 %	50 %	384191417
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251	NC_017215	CCG	2	6	10201	10206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384191417
252	NC_017215	CG	3	6	10227	10232	0 %	0 %	50 %	50 %	384191417
253	NC_017215	CGA	2	6	10235	10240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191417
254	NC_017215	GATG	2	8	10250	10257	25 %	25 %	50 %	0 %	384191417
255	NC_017215	TCG	2	6	10288	10293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191417
256	NC_017215	CGA	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191417
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258	NC_017215	GTC	2	6	10413	10418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191417
259	NC_017215	CAC	2	6	10505	10510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384191417
260	NC_017215	CGA	2	6	10544	10549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191417
261	NC_017215	ATC	2	6	10551	10556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191417
262	NC_017215	CGT	2	6	10604	10609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384191417
263	NC_017215	GAT	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191417
264	NC_017215	AG	3	6	10736	10741	50 %	0 %	50 %	0 %	384191417
265	NC_017215	GAG	2	6	11009	11014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384191418
266	NC_017215	ACCG	2	8	11016	11023	25 %	0 %	25 %	50 %	384191418
267	NC_017215	AAG	2	6	11045	11050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384191418
268	NC_017215	CGCC	2	8	11056	11063	0 %	0 %	25 %	75 %	384191418
269	NC_017215	CAT	2	6	11140	11145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384191418
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273	NC_017215	TCT	2	6	11217	11222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384191418
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281	NC_017215	CGA	2	6	11407	11412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384191418
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283	NC_017215	TGA	2	6	11485	11490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_017215	CGCA	2	8	11510	11517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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366	NC_017215	AT	3	6	15447	15452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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393	NC_017215	TCGG	2	8	16519	16526	0 %	25 %	50 %	25 %	384191423
394	NC_017215	GC	3	6	16534	16539	0 %	0 %	50 %	50 %	384191423
395	NC_017215	GAT	2	6	16610	16615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384191423
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441	NC_017215	GCG	2	6	18307	18312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_017215	GGA	2	6	19790	19795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017215	GGTG	2	8	19952	19959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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