MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 chromosome

Total Repeats: 43512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017214	CGG	2	6	110938	110943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189871
2503	NC_017214	CCG	2	6	111039	111044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189871
2504	NC_017214	ATC	2	6	111047	111052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189871
2505	NC_017214	CTT	3	9	111074	111082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189872
2506	NC_017214	TTG	2	6	111103	111108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189872
2507	NC_017214	GGC	2	6	111189	111194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189872
2508	NC_017214	TCG	2	6	111214	111219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189872
2509	NC_017214	CGG	2	6	111266	111271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189872
2510	NC_017214	GCA	2	6	111296	111301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189872
2511	NC_017214	CGG	2	6	111428	111433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189872
2512	NC_017214	CGC	2	6	111444	111449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189872
2513	NC_017214	TCGA	2	8	111451	111458	25 %	25 %	25 %	25 %	384189872
2514	NC_017214	ATG	2	6	111481	111486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189872
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2517	NC_017214	TCG	3	9	111586	111594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189872
2518	NC_017214	TGA	2	6	111596	111601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189872
2519	NC_017214	CGG	2	6	111647	111652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189872
2520	NC_017214	GAT	2	6	111684	111689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189872
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2528	NC_017214	GC	3	6	112192	112197	0 %	0 %	50 %	50 %	384189872
2529	NC_017214	CGG	2	6	112220	112225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189872
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2532	NC_017214	TCG	2	6	112357	112362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189872
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2535	NC_017214	CGA	2	6	112549	112554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_017214	GA	3	6	112663	112668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_017214	GGCA	2	8	112670	112677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2538	NC_017214	CCG	2	6	112710	112715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_017214	ACG	2	6	112780	112785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189873
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2545	NC_017214	TCGTC	2	10	113004	113013	0 %	40 %	20 %	40 %	384189873
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2551	NC_017214	TCT	2	6	113352	113357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189873
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2553	NC_017214	TCG	2	6	113420	113425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2554	NC_017214	TCGA	2	8	113543	113550	25 %	25 %	25 %	25 %	384189873
2555	NC_017214	ATG	2	6	113672	113677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189873
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2559	NC_017214	CGCCT	2	10	113806	113815	0 %	20 %	20 %	60 %	384189873
2560	NC_017214	GGC	2	6	113863	113868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189873
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2568	NC_017214	GAT	2	6	114163	114168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189873
2569	NC_017214	TCG	2	6	114182	114187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
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2572	NC_017214	TCT	2	6	114234	114239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189873
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2579	NC_017214	GTC	3	9	114584	114592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2580	NC_017214	CAG	2	6	114613	114618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2581	NC_017214	TCG	2	6	114710	114715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
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2586	NC_017214	CGGCC	2	10	115148	115157	0 %	0 %	40 %	60 %	384189873
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2589	NC_017214	CCG	2	6	115297	115302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189873
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2591	NC_017214	TTC	2	6	115322	115327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189873
2592	NC_017214	GTC	2	6	115396	115401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2593	NC_017214	CTG	2	6	115480	115485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2594	NC_017214	ATC	2	6	115534	115539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189873
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2602	NC_017214	CCT	2	6	115860	115865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189873
2603	NC_017214	TCG	2	6	115943	115948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189873
2604	NC_017214	CAT	2	6	115995	116000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189873
2605	NC_017214	CG	3	6	116031	116036	0 %	0 %	50 %	50 %	384189873
2606	NC_017214	GAT	2	6	116083	116088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189873
2607	NC_017214	CATG	2	8	116136	116143	25 %	25 %	25 %	25 %	384189873
2608	NC_017214	AAT	2	6	116235	116240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189873
2609	NC_017214	TCG	2	6	116424	116429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_017214	GAAG	2	8	116470	116477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_017214	CGGC	2	8	116621	116628	0 %	0 %	50 %	50 %	384189874
2612	NC_017214	TGT	2	6	116669	116674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189874
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2614	NC_017214	GAT	2	6	116709	116714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189874
2615	NC_017214	CGA	2	6	116779	116784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189874
2616	NC_017214	TGC	2	6	116840	116845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189875
2617	NC_017214	TGCG	2	8	116885	116892	0 %	25 %	50 %	25 %	384189875
2618	NC_017214	TGG	2	6	117029	117034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189875
2619	NC_017214	GATT	2	8	117051	117058	25 %	50 %	25 %	0 %	384189875
2620	NC_017214	CCT	2	6	117111	117116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189875
2621	NC_017214	GCCC	2	8	117158	117165	0 %	0 %	25 %	75 %	384189875
2622	NC_017214	TGG	2	6	117180	117185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189875
2623	NC_017214	TCT	2	6	117228	117233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189875
2624	NC_017214	CCGA	2	8	117419	117426	25 %	0 %	25 %	50 %	384189875
2625	NC_017214	GCC	2	6	117434	117439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189875
2626	NC_017214	ACCG	2	8	117442	117449	25 %	0 %	25 %	50 %	384189875
2627	NC_017214	GTC	3	9	117469	117477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189875
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2630	NC_017214	TGCC	2	8	117604	117611	0 %	25 %	25 %	50 %	384189875
2631	NC_017214	CAT	2	6	117652	117657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189875
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2638	NC_017214	CA	3	6	118036	118041	50 %	0 %	0 %	50 %	384189876
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2643	NC_017214	CTG	2	6	118462	118467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189877
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2649	NC_017214	CTG	2	6	118594	118599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189877
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2653	NC_017214	TCT	2	6	118722	118727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189877
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2687	NC_017214	GAT	2	6	120456	120461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189879
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2694	NC_017214	ACT	2	6	120870	120875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189880
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2724	NC_017214	CCTC	2	8	122188	122195	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2725	NC_017214	GGCCAA	2	12	122200	122211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2726	NC_017214	CTC	2	6	122222	122227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2727	NC_017214	CATC	2	8	122299	122306	25 %	25 %	0 %	50 %	384189881
2728	NC_017214	GTC	2	6	122309	122314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189881
2729	NC_017214	TCGC	2	8	122324	122331	0 %	25 %	25 %	50 %	384189881
2730	NC_017214	CTC	2	6	122333	122338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189881
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2734	NC_017214	TGG	2	6	122512	122517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189881
2735	NC_017214	C	6	6	122520	122525	0 %	0 %	0 %	100 %	384189881
2736	NC_017214	AGC	2	6	122610	122615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189881
2737	NC_017214	ATG	3	9	122628	122636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189881
2738	NC_017214	GCC	2	6	122716	122721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189881
2739	NC_017214	GTG	2	6	122889	122894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189881
2740	NC_017214	CTC	2	6	122924	122929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189881
2741	NC_017214	TCC	2	6	123083	123088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189881
2742	NC_017214	GAT	2	6	123136	123141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189881
2743	NC_017214	CAT	2	6	123143	123148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189881
2744	NC_017214	CCA	2	6	123157	123162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189881
2745	NC_017214	CGC	2	6	123170	123175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189881
2746	NC_017214	GCTC	2	8	123226	123233	0 %	25 %	25 %	50 %	384189881
2747	NC_017214	GC	3	6	123280	123285	0 %	0 %	50 %	50 %	384189881
2748	NC_017214	GCACA	2	10	123335	123344	40 %	0 %	20 %	40 %	384189881
2749	NC_017214	GCTC	2	8	123532	123539	0 %	25 %	25 %	50 %	384189881
2750	NC_017214	ATT	2	6	123585	123590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189881
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2752	NC_017214	CTG	2	6	123819	123824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189882
2753	NC_017214	TCA	2	6	123859	123864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189882
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2755	NC_017214	GCG	2	6	123924	123929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189882
2756	NC_017214	TCG	2	6	123946	123951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189882
2757	NC_017214	ATC	2	6	123958	123963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189882
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2761	NC_017214	CGT	2	6	124127	124132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189882
2762	NC_017214	AAGG	2	8	124143	124150	50 %	0 %	50 %	0 %	384189882
2763	NC_017214	TG	3	6	124438	124443	0 %	50 %	50 %	0 %	384189882
2764	NC_017214	GAA	2	6	124494	124499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189882
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2779	NC_017214	GAC	2	6	125449	125454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189882
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2783	NC_017214	G	6	6	125571	125576	0 %	0 %	100 %	0 %	384189882
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2789	NC_017214	GCC	2	6	125908	125913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2857	NC_017214	CGG	2	6	129194	129199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189885
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2985	NC_017214	TAC	2	6	134228	134233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189890
2986	NC_017214	GGCA	2	8	134235	134242	25 %	0 %	50 %	25 %	384189890
2987	NC_017214	TCG	2	6	134259	134264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189890
2988	NC_017214	AAC	2	6	134297	134302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189890
2989	NC_017214	CCA	2	6	134352	134357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189890
2990	NC_017214	CAG	2	6	134390	134395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189890
2991	NC_017214	GC	3	6	134415	134420	0 %	0 %	50 %	50 %	384189890
2992	NC_017214	CATC	2	8	134433	134440	25 %	25 %	0 %	50 %	384189890
2993	NC_017214	GTG	2	6	134504	134509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384189890
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2997	NC_017214	CAT	2	6	134719	134724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189890
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