MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 chromosome

Total Repeats: 43512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017214	AGT	2	6	21849	21854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189786
502	NC_017214	CGT	2	6	21858	21863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189786
503	NC_017214	GTT	2	6	22042	22047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189786
504	NC_017214	CAC	2	6	22057	22062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189786
505	NC_017214	GCC	2	6	22084	22089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189786
506	NC_017214	CGT	2	6	22119	22124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189786
507	NC_017214	CGGTG	2	10	22228	22237	0 %	20 %	60 %	20 %	384189786
508	NC_017214	CGA	2	6	22278	22283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189786
509	NC_017214	GAC	2	6	22317	22322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189786
510	NC_017214	TTG	2	6	22403	22408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189786
511	NC_017214	GTT	2	6	22543	22548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189786
512	NC_017214	GTC	2	6	22768	22773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189786
513	NC_017214	GCT	2	6	22794	22799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189786
514	NC_017214	GAA	2	6	22855	22860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189786
515	NC_017214	GGA	2	6	22861	22866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189786
516	NC_017214	TTC	2	6	22880	22885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189786
517	NC_017214	CGG	2	6	22923	22928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189786
518	NC_017214	CAG	2	6	23068	23073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189786
519	NC_017214	GCC	3	9	23086	23094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189786
520	NC_017214	TGA	2	6	23151	23156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189786
521	NC_017214	TGT	2	6	23157	23162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189786
522	NC_017214	GCC	2	6	23185	23190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189786
523	NC_017214	GCTCAG	2	12	23206	23217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384189786
524	NC_017214	CAT	2	6	23218	23223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189786
525	NC_017214	TCT	3	9	23259	23267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189786
526	NC_017214	AGC	2	6	23311	23316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017214	CAT	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017214	TCAAA	2	10	23380	23389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
529	NC_017214	GCA	2	6	23394	23399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017214	ATTC	2	8	23401	23408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_017214	CGC	2	6	23488	23493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017214	GCCT	2	8	23564	23571	0 %	25 %	25 %	50 %	384189787
533	NC_017214	TCGA	2	8	23591	23598	25 %	25 %	25 %	25 %	384189787
534	NC_017214	GGC	2	6	23692	23697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189787
535	NC_017214	GCG	2	6	23715	23720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189787
536	NC_017214	CAC	2	6	23758	23763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189787
537	NC_017214	CAC	2	6	23770	23775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189787
538	NC_017214	TGT	2	6	23879	23884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189787
539	NC_017214	CGT	2	6	24066	24071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189787
540	NC_017214	TTC	2	6	24089	24094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189787
541	NC_017214	CGGC	2	8	24153	24160	0 %	0 %	50 %	50 %	384189787
542	NC_017214	ATGC	2	8	24189	24196	25 %	25 %	25 %	25 %	384189787
543	NC_017214	GAA	2	6	24238	24243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189787
544	NC_017214	ACGG	2	8	24247	24254	25 %	0 %	50 %	25 %	384189787
545	NC_017214	GCGA	2	8	24269	24276	25 %	0 %	50 %	25 %	384189787
546	NC_017214	GTC	2	6	24322	24327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189787
547	NC_017214	TCG	2	6	24338	24343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189787
548	NC_017214	CGC	2	6	24393	24398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189787
549	NC_017214	CCCA	2	8	24675	24682	25 %	0 %	0 %	75 %	384189788
550	NC_017214	GAC	2	6	24755	24760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189788
551	NC_017214	GTC	2	6	24764	24769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
552	NC_017214	GCG	2	6	24855	24860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189788
553	NC_017214	CGA	2	6	24936	24941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189788
554	NC_017214	TCG	2	6	24954	24959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
555	NC_017214	GAAGCA	2	12	24982	24993	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384189788
556	NC_017214	GCG	2	6	25006	25011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189788
557	NC_017214	GAG	2	6	25067	25072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189788
558	NC_017214	CTG	2	6	25079	25084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
559	NC_017214	GTC	2	6	25133	25138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
560	NC_017214	CGT	2	6	25141	25146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
561	NC_017214	ACC	2	6	25167	25172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189788
562	NC_017214	CAGC	2	8	25177	25184	25 %	0 %	25 %	50 %	384189788
563	NC_017214	CGG	2	6	25189	25194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189788
564	NC_017214	CAG	3	9	25196	25204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189788
565	NC_017214	CG	3	6	25220	25225	0 %	0 %	50 %	50 %	384189788
566	NC_017214	ATG	2	6	25226	25231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189788
567	NC_017214	AC	3	6	25355	25360	50 %	0 %	0 %	50 %	384189788
568	NC_017214	CGTGCT	2	12	25390	25401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189788
569	NC_017214	ACC	2	6	25431	25436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189788
570	NC_017214	ACG	2	6	25443	25448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189788
571	NC_017214	ACG	2	6	25473	25478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189788
572	NC_017214	TCA	2	6	25582	25587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
573	NC_017214	ATC	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
574	NC_017214	TCG	3	9	25621	25629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
575	NC_017214	GAT	2	6	25673	25678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189789
576	NC_017214	GCGCG	2	10	25709	25718	0 %	0 %	60 %	40 %	384189789
577	NC_017214	GAG	2	6	25722	25727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189789
578	NC_017214	ACA	2	6	25759	25764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189789
579	NC_017214	CAT	2	6	25790	25795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
580	NC_017214	CGA	2	6	25837	25842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
581	NC_017214	TGC	2	6	25861	25866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
582	NC_017214	GAC	2	6	25889	25894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
583	NC_017214	GACG	2	8	25979	25986	25 %	0 %	50 %	25 %	384189789
584	NC_017214	GCT	2	6	25997	26002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
585	NC_017214	CGCC	2	8	26138	26145	0 %	0 %	25 %	75 %	384189789
586	NC_017214	TGC	2	6	26164	26169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
587	NC_017214	AGG	3	9	26170	26178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189789
588	NC_017214	GCA	2	6	26218	26223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
589	NC_017214	GAC	2	6	26225	26230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
590	NC_017214	CGA	2	6	26237	26242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
591	NC_017214	CAG	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
592	NC_017214	CAA	2	6	26273	26278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189789
593	NC_017214	GAC	2	6	26331	26336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
594	NC_017214	CGA	2	6	26338	26343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
595	NC_017214	GTT	2	6	26405	26410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189789
596	NC_017214	TCA	2	6	26422	26427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
597	NC_017214	GAT	2	6	26444	26449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189789
598	NC_017214	CTG	2	6	26478	26483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
599	NC_017214	TCGG	2	8	26487	26494	0 %	25 %	50 %	25 %	384189789
600	NC_017214	TGC	2	6	26572	26577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
601	NC_017214	TCG	2	6	26671	26676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
602	NC_017214	TCG	2	6	26683	26688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
603	NC_017214	ATC	2	6	26703	26708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
604	NC_017214	TGGA	2	8	26801	26808	25 %	25 %	50 %	0 %	384189789
605	NC_017214	GTGCT	2	10	26847	26856	0 %	40 %	40 %	20 %	384189789
606	NC_017214	TCG	2	6	26938	26943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
607	NC_017214	GC	3	6	26962	26967	0 %	0 %	50 %	50 %	384189789
608	NC_017214	TCG	2	6	26974	26979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
609	NC_017214	CG	3	6	27060	27065	0 %	0 %	50 %	50 %	384189789
610	NC_017214	CGG	2	6	27085	27090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189789
611	NC_017214	CGT	2	6	27131	27136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
612	NC_017214	TCG	2	6	27169	27174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
613	NC_017214	ACA	2	6	27175	27180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189789
614	NC_017214	GGC	2	6	27206	27211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384189789
615	NC_017214	TCG	2	6	27279	27284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
616	NC_017214	TGC	2	6	27295	27300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
617	NC_017214	CAT	2	6	27332	27337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189789
618	NC_017214	ATG	2	6	27454	27459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189789
619	NC_017214	CGA	2	6	27512	27517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
620	NC_017214	AGA	3	9	27550	27558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189789
621	NC_017214	GCA	2	6	27581	27586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189789
622	NC_017214	CCT	2	6	27604	27609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384189789
623	NC_017214	AGG	2	6	27643	27648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189789
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625	NC_017214	TCG	2	6	27745	27750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189789
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