MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8513

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017207	TAT	2	6	5	10	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017207	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017207	T	6	6	93	98	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017207	GAC	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017207	A	6	6	206	211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017207	T	7	7	222	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017207	CAC	2	6	376	381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017207	T	7	7	382	388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017207	T	7	7	418	424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017207	TGA	2	6	640	645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017207	A	8	8	688	695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017207	AGT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017207	TTG	2	6	816	821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017207	TAG	2	6	850	855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017207	A	7	7	859	865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017207	GTG	2	6	919	924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017207	ATG	2	6	985	990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017207	T	8	8	1196	1203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017207	CGG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017207	A	7	7	1306	1312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017207	GA	3	6	1366	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
22	NC_017207	AAAG	2	8	1406	1413	75 %	0 %	25 %	0 %	384183625
23	NC_017207	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183625
24	NC_017207	AATT	2	8	1497	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	384183625
25	NC_017207	TGT	2	6	1558	1563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
26	NC_017207	TTG	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183625
27	NC_017207	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	384183625
28	NC_017207	GAGAA	2	10	1674	1683	60 %	0 %	40 %	0 %	384183625
29	NC_017207	TGA	2	6	1708	1713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
30	NC_017207	A	6	6	1713	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	384183625
31	NC_017207	AAAAAC	2	12	1755	1766	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384183625
32	NC_017207	T	6	6	1781	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	384183625
33	NC_017207	GAAA	2	8	1837	1844	75 %	0 %	25 %	0 %	384183625
34	NC_017207	GTG	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183625
35	NC_017207	ACA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
36	NC_017207	AGA	2	6	1933	1938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
37	NC_017207	AAGAA	2	10	1947	1956	80 %	0 %	20 %	0 %	384183625
38	NC_017207	ATAG	2	8	1961	1968	50 %	25 %	25 %	0 %	384183625
39	NC_017207	GTC	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183625
40	NC_017207	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
41	NC_017207	AG	3	6	2192	2197	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
42	NC_017207	AG	3	6	2234	2239	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
43	NC_017207	GAAG	2	8	2251	2258	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
44	NC_017207	TGA	3	9	2404	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183625
45	NC_017207	GAA	2	6	2456	2461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183625
46	NC_017207	CAA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183625
47	NC_017207	GA	3	6	2522	2527	50 %	0 %	50 %	0 %	384183625
48	NC_017207	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017207	T	6	6	2554	2559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017207	T	6	6	2585	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017207	A	8	8	2636	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017207	A	8	8	2656	2663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017207	T	7	7	2695	2701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017207	T	6	6	2729	2734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017207	CTTT	2	8	2735	2742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017207	A	9	9	2818	2826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017207	GAG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017207	A	7	7	2907	2913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017207	T	6	6	2928	2933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017207	AT	3	6	2989	2994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017207	AGA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
62	NC_017207	TGAG	2	8	3091	3098	25 %	25 %	50 %	0 %	384183626
63	NC_017207	AGA	3	9	3163	3171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
64	NC_017207	GGA	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384183626
65	NC_017207	GAT	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183626
66	NC_017207	AAAG	2	8	3287	3294	75 %	0 %	25 %	0 %	384183626
67	NC_017207	T	7	7	3301	3307	0 %	100 %	0 %	0 %	384183626
68	NC_017207	GAC	2	6	3314	3319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183626
69	NC_017207	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183626
70	NC_017207	TCA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183626
71	NC_017207	GAA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
72	NC_017207	AAC	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183626
73	NC_017207	ATT	2	6	3598	3603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
74	NC_017207	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
75	NC_017207	AAG	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183626
76	NC_017207	GTC	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183626
77	NC_017207	AATT	2	8	3823	3830	50 %	50 %	0 %	0 %	384183626
78	NC_017207	ATT	2	6	3842	3847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
79	NC_017207	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	384183626
80	NC_017207	GAAT	2	8	3908	3915	50 %	25 %	25 %	0 %	384183626
81	NC_017207	ATT	2	6	3916	3921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183626
82	NC_017207	TAAT	2	8	4018	4025	50 %	50 %	0 %	0 %	384183626
83	NC_017207	TAT	3	9	4071	4079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
84	NC_017207	A	6	6	4111	4116	100 %	0 %	0 %	0 %	384183627
85	NC_017207	A	7	7	4173	4179	100 %	0 %	0 %	0 %	384183627
86	NC_017207	ATT	2	6	4185	4190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183627
87	NC_017207	GTTG	2	8	4247	4254	0 %	50 %	50 %	0 %	384183627
88	NC_017207	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017207	TAA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017207	ACTG	2	8	4302	4309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017207	TTATT	2	10	4329	4338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017207	GCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017207	T	7	7	4376	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017207	TTAAAT	2	12	4408	4419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017207	ATTT	2	8	4435	4442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017207	AT	3	6	4460	4465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017207	CTA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017207	T	7	7	4527	4533	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
99	NC_017207	AT	4	8	4538	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	384183628
100	NC_017207	T	6	6	4565	4570	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
101	NC_017207	GAT	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183628
102	NC_017207	T	7	7	4576	4582	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
103	NC_017207	T	6	6	4630	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	384183628
104	NC_017207	GATTT	2	10	4642	4651	20 %	60 %	20 %	0 %	384183628
105	NC_017207	TCTTT	2	10	4707	4716	0 %	80 %	0 %	20 %	384183628
106	NC_017207	TA	3	6	4746	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	384183628
107	NC_017207	A	6	6	4777	4782	100 %	0 %	0 %	0 %	384183628
108	NC_017207	TG	3	6	4849	4854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017207	TTG	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017207	T	6	6	4900	4905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017207	A	6	6	4974	4979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017207	AT	3	6	5008	5013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017207	AT	3	6	5016	5021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017207	ATG	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017207	A	6	6	5050	5055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017207	A	6	6	5071	5076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017207	A	6	6	5084	5089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017207	T	6	6	5098	5103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017207	TTTA	2	8	5111	5118	25 %	75 %	0 %	0 %	384183629
120	NC_017207	TC	3	6	5153	5158	0 %	50 %	0 %	50 %	384183629
121	NC_017207	TTA	2	6	5193	5198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183629
122	NC_017207	AATA	2	8	5274	5281	75 %	25 %	0 %	0 %	384183629
123	NC_017207	TTTG	2	8	5289	5296	0 %	75 %	25 %	0 %	384183629
124	NC_017207	T	6	6	5308	5313	0 %	100 %	0 %	0 %	384183629
125	NC_017207	T	7	7	5399	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017207	TA	3	6	5444	5449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017207	ATA	2	6	5502	5507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017207	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017207	AT	3	6	5548	5553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017207	A	6	6	5554	5559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017207	ATT	2	6	5570	5575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017207	GTAA	2	8	5609	5616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017207	TGAA	2	8	5631	5638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017207	GTA	2	6	5659	5664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017207	ATA	2	6	5702	5707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
136	NC_017207	TAA	2	6	5751	5756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
137	NC_017207	TCT	2	6	5779	5784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183630
138	NC_017207	AT	3	6	5850	5855	50 %	50 %	0 %	0 %	384183630
139	NC_017207	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183630
140	NC_017207	AAT	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183630
141	NC_017207	ATG	2	6	5915	5920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017207	T	8	8	5965	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017207	TAG	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183631
144	NC_017207	TGA	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017207	T	7	7	6182	6188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017207	TA	3	6	6258	6263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.