MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT72

Total Repeats: 1751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017205	ATAA	2	8	4	11	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017205	TAGTT	2	10	48	57	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017205	ATA	2	6	75	80	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017205	TGT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017205	GA	3	6	219	224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017205	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017205	TAAT	2	8	254	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017205	AAG	2	6	389	394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
9	NC_017205	GAA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
10	NC_017205	AG	3	6	461	466	50 %	0 %	50 %	0 %	384189585
11	NC_017205	ATT	2	6	474	479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189585
12	NC_017205	AATT	2	8	570	577	50 %	50 %	0 %	0 %	384189585
13	NC_017205	AATG	2	8	599	606	50 %	25 %	25 %	0 %	384189585
14	NC_017205	ATT	2	6	609	614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189585
15	NC_017205	TCA	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189585
16	NC_017205	AAG	2	6	686	691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189585
17	NC_017205	AAAAG	2	10	696	705	80 %	0 %	20 %	0 %	384189585
18	NC_017205	TTGA	2	8	821	828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017205	TAG	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017205	A	6	6	952	957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017205	GCAGCT	2	12	967	978	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017205	T	6	6	983	988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017205	A	6	6	1050	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017205	TCTT	2	8	1149	1156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017205	TAA	2	6	1239	1244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017205	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017205	TGC	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189586
28	NC_017205	GAAA	2	8	1449	1456	75 %	0 %	25 %	0 %	384189586
29	NC_017205	AATT	2	8	1468	1475	50 %	50 %	0 %	0 %	384189586
30	NC_017205	T	7	7	1494	1500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017205	AAAGA	2	10	1503	1512	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017205	CCTT	2	8	1525	1532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017205	TAA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017205	CA	3	6	1601	1606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017205	TAA	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189587
36	NC_017205	TCA	2	6	1853	1858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189587
37	NC_017205	TGT	2	6	1901	1906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189587
38	NC_017205	GTA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189587
39	NC_017205	TCT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189587
40	NC_017205	CTT	2	6	2065	2070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189587
41	NC_017205	ATG	2	6	2114	2119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189587
42	NC_017205	TAA	2	6	2135	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
43	NC_017205	T	7	7	2159	2165	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
44	NC_017205	C	6	6	2174	2179	0 %	0 %	0 %	100 %	384189588
45	NC_017205	TGA	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
46	NC_017205	TTC	2	6	2286	2291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189588
47	NC_017205	CA	3	6	2318	2323	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
48	NC_017205	ACA	2	6	2371	2376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189588
49	NC_017205	CCTT	2	8	2386	2393	0 %	50 %	0 %	50 %	384189588
50	NC_017205	TA	3	6	2448	2453	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
51	NC_017205	CATTT	2	10	2484	2493	20 %	60 %	0 %	20 %	384189588
52	NC_017205	T	6	6	2532	2537	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
53	NC_017205	ATC	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189588
54	NC_017205	ATTC	2	8	2646	2653	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
55	NC_017205	GATA	2	8	2708	2715	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
56	NC_017205	TGT	2	6	2735	2740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189588
57	NC_017205	AT	3	6	2771	2776	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
58	NC_017205	ATT	2	6	2841	2846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189588
59	NC_017205	AAT	2	6	2889	2894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
60	NC_017205	TGT	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189588
61	NC_017205	ATA	2	6	2964	2969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
62	NC_017205	AT	3	6	3067	3072	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
63	NC_017205	TCA	2	6	3106	3111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189588
64	NC_017205	TAA	2	6	3123	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
65	NC_017205	AT	3	6	3160	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
66	NC_017205	GAA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189588
67	NC_017205	GTA	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
68	NC_017205	GTAA	2	8	3266	3273	50 %	25 %	25 %	0 %	384189588
69	NC_017205	AAT	2	6	3299	3304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
70	NC_017205	TAA	2	6	3351	3356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
71	NC_017205	ATA	2	6	3408	3413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384189588
72	NC_017205	ATG	2	6	3464	3469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
73	NC_017205	GGAT	2	8	3525	3532	25 %	25 %	50 %	0 %	384189588
74	NC_017205	AT	3	6	3608	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
75	NC_017205	CTCTT	2	10	3624	3633	0 %	60 %	0 %	40 %	384189588
76	NC_017205	A	7	7	3672	3678	100 %	0 %	0 %	0 %	384189588
77	NC_017205	ATTA	2	8	3732	3739	50 %	50 %	0 %	0 %	384189588
78	NC_017205	TGTT	2	8	3808	3815	0 %	75 %	25 %	0 %	384189588
79	NC_017205	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	384189588
80	NC_017205	AGAA	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	384189588
81	NC_017205	ATG	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189588
82	NC_017205	T	7	7	3956	3962	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
83	NC_017205	GAA	2	6	3999	4004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189588
84	NC_017205	CA	3	6	4021	4026	50 %	0 %	0 %	50 %	384189588
85	NC_017205	T	6	6	4068	4073	0 %	100 %	0 %	0 %	384189588
86	NC_017205	TTAC	2	8	4105	4112	25 %	50 %	0 %	25 %	384189588
87	NC_017205	TCG	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384189589
88	NC_017205	T	6	6	4142	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	384189589
89	NC_017205	TCT	2	6	4167	4172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189589
90	NC_017205	ACAT	2	8	4197	4204	50 %	25 %	0 %	25 %	384189589
91	NC_017205	TAG	2	6	4210	4215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
92	NC_017205	GC	3	6	4236	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	384189589
93	NC_017205	GAG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384189589
94	NC_017205	TGA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
95	NC_017205	ATCT	2	8	4430	4437	25 %	50 %	0 %	25 %	384189589
96	NC_017205	TGTA	2	8	4442	4449	25 %	50 %	25 %	0 %	384189589
97	NC_017205	CCG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384189589
98	NC_017205	ACA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384189589
99	NC_017205	ATG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189589
100	NC_017205	T	6	6	4833	4838	0 %	100 %	0 %	0 %	384189589
101	NC_017205	CTT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189589
102	NC_017205	AGCT	2	8	5012	5019	25 %	25 %	25 %	25 %	384189589
103	NC_017205	TAT	2	6	5125	5130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189589
104	NC_017205	TCA	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384189589
105	NC_017205	TTA	2	6	5202	5207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189589
106	NC_017205	TCC	2	6	5244	5249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017205	TTTA	2	8	5280	5287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017205	T	6	6	5293	5298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017205	TAG	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017205	A	9	9	5324	5332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017205	ATAA	2	8	5570	5577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017205	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017205	TAA	2	6	5635	5640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017205	ATT	2	6	5653	5658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017205	TA	3	6	5677	5682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017205	A	6	6	5732	5737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017205	ATAA	2	8	5740	5747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017205	GGGAT	2	10	5754	5763	20 %	20 %	60 %	0 %	384189590
119	NC_017205	TTTG	2	8	5816	5823	0 %	75 %	25 %	0 %	384189590
120	NC_017205	CTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384189590
121	NC_017205	GAA	3	9	5868	5876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
122	NC_017205	AAG	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
123	NC_017205	TGT	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384189590
124	NC_017205	GAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
125	NC_017205	AGT	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384189590
126	NC_017205	GATATT	2	12	5958	5969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384189590
127	NC_017205	GAA	2	6	6000	6005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
128	NC_017205	ACC	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384189590
129	NC_017205	AGAA	2	8	6101	6108	75 %	0 %	25 %	0 %	384189590
130	NC_017205	TAT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384189590
131	NC_017205	AGC	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384189590
132	NC_017205	GATTA	2	10	6209	6218	40 %	40 %	20 %	0 %	384189590
133	NC_017205	TAATT	2	10	6230	6239	40 %	60 %	0 %	0 %	384189590
134	NC_017205	GCTT	2	8	6254	6261	0 %	50 %	25 %	25 %	384189590
135	NC_017205	GAA	3	9	6285	6293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384189590
136	NC_017205	TAA	2	6	6319	6324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017205	A	6	6	6323	6328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017205	GTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017205	T	8	8	6353	6360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017205	GAA	2	6	6361	6366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017205	CAT	2	6	6375	6380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017205	A	6	6	6387	6392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017205	ACT	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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