MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT281

Total Repeats: 6637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017203	T	6	6	57	62	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017203	ACAAA	2	10	88	97	80 %	0 %	0 %	20 %	384183817
3	NC_017203	A	6	6	95	100	100 %	0 %	0 %	0 %	384183817
4	NC_017203	TCA	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183817
5	NC_017203	ATTTG	2	10	140	149	20 %	60 %	20 %	0 %	384183817
6	NC_017203	TGC	2	6	199	204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183817
7	NC_017203	CA	4	8	296	303	50 %	0 %	0 %	50 %	384183817
8	NC_017203	AAAG	2	8	331	338	75 %	0 %	25 %	0 %	384183817
9	NC_017203	TCA	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183817
10	NC_017203	T	6	6	405	410	0 %	100 %	0 %	0 %	384183817
11	NC_017203	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183817
12	NC_017203	CATG	2	8	575	582	25 %	25 %	25 %	25 %	384183817
13	NC_017203	ATT	2	6	674	679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017203	TGA	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017203	CATAT	2	10	738	747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017203	TTC	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017203	TAA	2	6	845	850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017203	CAT	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017203	T	7	7	891	897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017203	ACT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017203	TCC	3	9	933	941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017203	TTA	2	6	975	980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017203	CAA	2	6	985	990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017203	CA	3	6	1007	1012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017203	TGA	2	6	1031	1036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017203	AAAAAG	2	12	1100	1111	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017203	T	6	6	1149	1154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017203	T	6	6	1222	1227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017203	ATT	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017203	GA	3	6	1282	1287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017203	ATT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017203	ATACA	2	10	1372	1381	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017203	A	6	6	1381	1386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017203	TTG	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017203	T	6	6	1483	1488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017203	AT	3	6	1518	1523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017203	A	8	8	1547	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017203	ATTT	2	8	1562	1569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017203	AAT	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017203	ATT	2	6	1681	1686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017203	TTG	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017203	TAAT	2	8	1797	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017203	ATT	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017203	ATATT	2	10	1841	1850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017203	T	6	6	1849	1854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017203	TA	3	6	2019	2024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017203	T	6	6	2093	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017203	A	7	7	2107	2113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017203	TAA	2	6	2117	2122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017203	TA	3	6	2125	2130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017203	AT	9	18	2148	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017203	CAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017203	GAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017203	AAT	2	6	2192	2197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017203	AG	3	6	2219	2224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017203	GTT	2	6	2372	2377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017203	ATC	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017203	AAAAAG	2	12	2404	2415	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017203	ATAA	2	8	2435	2442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017203	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017203	AT	3	6	2472	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017203	A	6	6	2519	2524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017203	TTTG	2	8	2542	2549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017203	ATC	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017203	TTA	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017203	T	7	7	2598	2604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017203	TA	3	6	2621	2626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017203	TAAT	2	8	2632	2639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017203	GAA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017203	TAA	2	6	2684	2689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017203	TTG	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017203	T	6	6	2709	2714	0 %	100 %	0 %	0 %	384183818
73	NC_017203	TCA	2	6	2863	2868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183818
74	NC_017203	CAT	2	6	2955	2960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017203	ATT	2	6	2971	2976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017203	T	6	6	2987	2992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017203	TTC	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017203	ATC	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017203	TAAT	2	8	3063	3070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017203	T	6	6	3082	3087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017203	TA	3	6	3100	3105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017203	GAAA	2	8	3114	3121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017203	TAAAT	2	10	3152	3161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017203	ATA	2	6	3261	3266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017203	T	6	6	3292	3297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017203	CTA	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017203	ATT	2	6	3317	3322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183819
88	NC_017203	TCT	2	6	3325	3330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183819
89	NC_017203	T	6	6	3330	3335	0 %	100 %	0 %	0 %	384183819
90	NC_017203	GAA	2	6	3447	3452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183819
91	NC_017203	ATATC	2	10	3491	3500	40 %	40 %	0 %	20 %	384183819
92	NC_017203	CTA	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183819
93	NC_017203	GAA	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183819
94	NC_017203	GCA	2	6	3595	3600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384183819
95	NC_017203	TAA	2	6	3648	3653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183819
96	NC_017203	ACC	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384183819
97	NC_017203	CTA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017203	TAT	2	6	3762	3767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017203	CATG	2	8	3788	3795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017203	T	7	7	3855	3861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017203	TAAA	2	8	3922	3929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017203	AT	3	6	3933	3938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017203	AT	3	6	3947	3952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017203	AAT	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017203	T	6	6	3996	4001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017203	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017203	TTAG	2	8	4063	4070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017203	AGTAA	2	10	4079	4088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017203	ATT	2	6	4101	4106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017203	TA	3	6	4122	4127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017203	T	6	6	4143	4148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017203	TTA	2	6	4165	4170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017203	AGAT	2	8	4250	4257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017203	AAAT	2	8	4295	4302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017203	TATTG	2	10	4318	4327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017203	A	7	7	4339	4345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017203	TCA	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017203	A	6	6	4410	4415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017203	T	7	7	4441	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017203	GTTT	2	8	4449	4456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017203	AT	3	6	4513	4518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017203	TAG	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017203	TGA	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017203	AATAT	2	10	4640	4649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017203	ACTT	2	8	4659	4666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017203	C	7	7	4680	4686	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_017203	ATCA	2	8	4745	4752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017203	A	6	6	4761	4766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017203	TTG	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017203	CTT	2	6	4826	4831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017203	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017203	ACAT	2	8	4894	4901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017203	TACAT	2	10	4931	4940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017203	TGC	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017203	TTA	2	6	4958	4963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017203	AACAC	2	10	5003	5012	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017203	ATA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017203	TTAT	2	8	5069	5076	25 %	75 %	0 %	0 %	384183820
139	NC_017203	GAA	2	6	5099	5104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183820
140	NC_017203	T	7	7	5133	5139	0 %	100 %	0 %	0 %	384183820
141	NC_017203	GT	4	8	5158	5165	0 %	50 %	50 %	0 %	384183820
142	NC_017203	TTTGT	2	10	5171	5180	0 %	80 %	20 %	0 %	384183820
143	NC_017203	TAAT	2	8	5201	5208	50 %	50 %	0 %	0 %	384183820
144	NC_017203	TAA	2	6	5255	5260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183820
145	NC_017203	T	6	6	5294	5299	0 %	100 %	0 %	0 %	384183820
146	NC_017203	T	6	6	5371	5376	0 %	100 %	0 %	0 %	384183820
147	NC_017203	TAGT	2	8	5521	5528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017203	ATT	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017203	TCA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017203	T	8	8	5577	5584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017203	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017203	TAATA	2	10	5648	5657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017203	T	7	7	5970	5976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017203	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017203	CTATT	2	10	6234	6243	20 %	60 %	0 %	20 %	384183822
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285	NC_017203	A	7	7	10690	10696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_017203	TA	3	6	15754	15759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017203	TAA	2	6	15767	15772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_017203	TTG	2	6	15819	15824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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