MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 3053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017202	AAG	2	6	126189	126194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183812
3002	NC_017202	A	6	6	126229	126234	100 %	0 %	0 %	0 %	384183812
3003	NC_017202	AGA	2	6	126297	126302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183812
3004	NC_017202	ATA	2	6	126332	126337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183812
3005	NC_017202	CAT	2	6	126341	126346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183812
3006	NC_017202	A	6	6	126354	126359	100 %	0 %	0 %	0 %	384183812
3007	NC_017202	GTA	2	6	126379	126384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183812
3008	NC_017202	TCA	2	6	126406	126411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183812
3009	NC_017202	AAT	2	6	126412	126417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183812
3010	NC_017202	TGG	2	6	126453	126458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384183812
3011	NC_017202	AAT	2	6	126542	126547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183812
3012	NC_017202	GA	4	8	126558	126565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017202	TCT	2	6	126583	126588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_017202	ATA	2	6	126612	126617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017202	TA	3	6	126625	126630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017202	GA	3	6	126657	126662	50 %	0 %	50 %	0 %	384183813
3017	NC_017202	A	7	7	126700	126706	100 %	0 %	0 %	0 %	384183813
3018	NC_017202	TCA	2	6	126712	126717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183813
3019	NC_017202	AT	3	6	126838	126843	50 %	50 %	0 %	0 %	384183813
3020	NC_017202	TGGG	2	8	126850	126857	0 %	25 %	75 %	0 %	384183813
3021	NC_017202	TCAAT	2	10	126904	126913	40 %	40 %	0 %	20 %	384183813
3022	NC_017202	TGT	2	6	126941	126946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183813
3023	NC_017202	ATG	2	6	126960	126965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183813
3024	NC_017202	ATT	2	6	127001	127006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183813
3025	NC_017202	GTC	2	6	127009	127014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183813
3026	NC_017202	ACA	2	6	127015	127020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183813
3027	NC_017202	GAA	2	6	127037	127042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183813
3028	NC_017202	GCAA	2	8	127049	127056	50 %	0 %	25 %	25 %	384183813
3029	NC_017202	GAA	2	6	127164	127169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183814
3030	NC_017202	ATA	2	6	127191	127196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183814
3031	NC_017202	TACT	2	8	127206	127213	25 %	50 %	0 %	25 %	384183814
3032	NC_017202	AAC	2	6	127265	127270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183814
3033	NC_017202	TAA	2	6	127293	127298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017202	ATT	2	6	127306	127311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017202	TAA	2	6	127368	127373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017202	ATT	2	6	127397	127402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017202	TTAT	2	8	127425	127432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017202	AT	3	6	127431	127436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017202	TA	3	6	127478	127483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017202	GTT	2	6	127496	127501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017202	TTTTA	2	10	127536	127545	20 %	80 %	0 %	0 %	384183815
3042	NC_017202	TTA	2	6	127608	127613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183815
3043	NC_017202	CCG	2	6	127621	127626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384183815
3044	NC_017202	TCA	2	6	127633	127638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384183815
3045	NC_017202	TTC	2	6	127658	127663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183815
3046	NC_017202	TAA	2	6	127685	127690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183815
3047	NC_017202	GTT	2	6	127763	127768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183815
3048	NC_017202	CTAG	2	8	127773	127780	25 %	25 %	25 %	25 %	384183815
3049	NC_017202	A	7	7	127801	127807	100 %	0 %	0 %	0 %	384183815
3050	NC_017202	A	6	6	127830	127835	100 %	0 %	0 %	0 %	384183815
3051	NC_017202	AT	3	6	127843	127848	50 %	50 %	0 %	0 %	384183815
3052	NC_017202	ATT	2	6	127850	127855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183815
3053	NC_017202	T	7	7	127875	127881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.