MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus subtilis subsp. natto BEST195 plasmid pBEST195S

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017194	TA	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017194	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017194	TAT	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017194	ATA	2	6	121	126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017194	T	7	7	155	161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017194	ATC	2	6	190	195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277406
7	NC_017194	GACG	2	8	248	255	25 %	0 %	50 %	25 %	428277406
8	NC_017194	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	428277406
9	NC_017194	TG	3	6	431	436	0 %	50 %	50 %	0 %	428277406
10	NC_017194	ATA	2	6	467	472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277406
11	NC_017194	TGGA	2	8	510	517	25 %	25 %	50 %	0 %	428277406
12	NC_017194	ATG	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
13	NC_017194	GAA	2	6	673	678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
14	NC_017194	ATC	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277406
15	NC_017194	TGT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
16	NC_017194	GAA	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
17	NC_017194	TTG	2	6	806	811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
18	NC_017194	ATG	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
19	NC_017194	TGT	2	6	936	941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277406
20	NC_017194	AGA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
21	NC_017194	GAT	2	6	991	996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277406
22	NC_017194	CCG	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428277406
23	NC_017194	GGA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277406
24	NC_017194	GAA	2	6	1102	1107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277406
25	NC_017194	CGAA	2	8	1121	1128	50 %	0 %	25 %	25 %	428277406
26	NC_017194	GTT	2	6	1195	1200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017194	T	7	7	1206	1212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017194	CTT	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017194	TA	3	6	1327	1332	50 %	50 %	0 %	0 %	428277407
30	NC_017194	TGT	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277407
31	NC_017194	T	6	6	1340	1345	0 %	100 %	0 %	0 %	428277407
32	NC_017194	TAT	2	6	1347	1352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
33	NC_017194	ATT	2	6	1359	1364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
34	NC_017194	AGG	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277407
35	NC_017194	TAT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
36	NC_017194	TGT	2	6	1446	1451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428277407
37	NC_017194	TAT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
38	NC_017194	CTG	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428277407
39	NC_017194	ATT	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
40	NC_017194	CAA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428277407
41	NC_017194	GAAAG	2	10	1647	1656	60 %	0 %	40 %	0 %	428277407
42	NC_017194	CATA	2	8	1720	1727	50 %	25 %	0 %	25 %	428277407
43	NC_017194	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277407
44	NC_017194	A	6	6	1804	1809	100 %	0 %	0 %	0 %	428277407
45	NC_017194	GAT	2	6	1854	1859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017194	T	6	6	1900	1905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017194	TTTTG	2	10	1908	1917	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017194	AGG	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017194	AAAAG	2	10	1986	1995	80 %	0 %	20 %	0 %	428277408
50	NC_017194	CTT	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277408
51	NC_017194	T	6	6	2059	2064	0 %	100 %	0 %	0 %	428277408
52	NC_017194	ATT	2	6	2125	2130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277408
53	NC_017194	ATA	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
54	NC_017194	GGAAA	2	10	2192	2201	60 %	0 %	40 %	0 %	428277408
55	NC_017194	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	428277408
56	NC_017194	CA	3	6	2206	2211	50 %	0 %	0 %	50 %	428277408
57	NC_017194	GAA	2	6	2257	2262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277408
58	NC_017194	ACC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428277408
59	NC_017194	TTA	2	6	2274	2279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428277408
60	NC_017194	TCTT	2	8	2305	2312	0 %	75 %	0 %	25 %	428277408
61	NC_017194	ATA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
62	NC_017194	GAT	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277408
63	NC_017194	T	6	6	2489	2494	0 %	100 %	0 %	0 %	428277408
64	NC_017194	AAT	2	6	2520	2525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428277408
65	NC_017194	T	6	6	2555	2560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017194	CA	3	6	2582	2587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017194	AGC	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017194	TC	3	6	2652	2657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017194	CGG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017194	GTCGG	2	10	2670	2679	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017194	GA	3	6	2726	2731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017194	CCA	2	6	2733	2738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017194	TCA	2	6	2875	2880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428277409
74	NC_017194	A	6	6	2895	2900	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
75	NC_017194	A	6	6	2944	2949	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
76	NC_017194	A	6	6	3040	3045	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
77	NC_017194	GAG	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428277409
78	NC_017194	GCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
79	NC_017194	CTC	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428277409
80	NC_017194	CT	3	6	3291	3296	0 %	50 %	0 %	50 %	428277409
81	NC_017194	T	7	7	3305	3311	0 %	100 %	0 %	0 %	428277409
82	NC_017194	GAT	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277409
83	NC_017194	GCG	2	6	3388	3393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
84	NC_017194	AAG	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
85	NC_017194	AAAT	2	8	3433	3440	75 %	25 %	0 %	0 %	428277409
86	NC_017194	AG	4	8	3496	3503	50 %	0 %	50 %	0 %	428277409
87	NC_017194	A	6	6	3549	3554	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
88	NC_017194	GCG	2	6	3857	3862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428277409
89	NC_017194	GAA	2	6	3885	3890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
90	NC_017194	GAC	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428277409
91	NC_017194	CTAAAA	2	12	4014	4025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428277409
92	NC_017194	AAG	2	6	4077	4082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277409
93	NC_017194	A	7	7	4127	4133	100 %	0 %	0 %	0 %	428277409
94	NC_017194	AG	4	8	4151	4158	50 %	0 %	50 %	0 %	428277409
95	NC_017194	AATA	2	8	4275	4282	75 %	25 %	0 %	0 %	428277409
96	NC_017194	CAAT	2	8	4315	4322	50 %	25 %	0 %	25 %	428277410
97	NC_017194	CCA	2	6	4339	4344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428277410
98	NC_017194	T	7	7	4346	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
99	NC_017194	TGG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428277410
100	NC_017194	T	6	6	4371	4376	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
101	NC_017194	T	6	6	4434	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	428277410
102	NC_017194	TTC	2	6	4477	4482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277410
103	NC_017194	TCG	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428277410
104	NC_017194	AGTG	2	8	4592	4599	25 %	25 %	50 %	0 %	428277410
105	NC_017194	TTC	2	6	4702	4707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428277410
106	NC_017194	TGA	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428277410
107	NC_017194	TTTA	2	8	4845	4852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017194	AAAG	2	8	4864	4871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017194	GAA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277411
110	NC_017194	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428277411
111	NC_017194	TACA	2	8	5052	5059	50 %	25 %	0 %	25 %	428277411
112	NC_017194	CTTT	2	8	5073	5080	0 %	75 %	0 %	25 %	428277411
113	NC_017194	GATGT	2	10	5081	5090	20 %	40 %	40 %	0 %	428277411
114	NC_017194	TGT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017194	T	9	9	5166	5174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017194	GGA	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017194	CAAA	2	8	5273	5280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017194	GTTT	2	8	5284	5291	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017194	C	6	6	5312	5317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_017194	GAA	2	6	5318	5323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017194	G	6	6	5326	5331	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017194	G	6	6	5334	5339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017194	CCGT	2	8	5362	5369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017194	TGG	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017194	A	6	6	5467	5472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017194	TAAAAA	2	12	5531	5542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017194	A	7	7	5538	5544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017194	CCAT	2	8	5626	5633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017194	A	6	6	5650	5655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017194	A	7	7	5690	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017194	A	9	9	5708	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017194	C	7	7	5720	5726	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_017194	GAA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017194	A	7	7	5768	5774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017194	T	7	7	5795	5801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.